Map Locations of contig_1563307 (8425 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1563307

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12443 4 2554 bp AK372148 Available Available None
MLOC_12445 2 405 bp MLOC_12445.1 Available Available None
MLOC_12444 1 171 bp MLOC_12444.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_12443






CDS Structure of MLOC_12445






CDS Structure of MLOC_12444






Contig Sequence (8425 bp)

>contig_1563307 8425 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCACGCCGGACCGACGGGTCCGTCTTCCTCTAGGAGGGCTGACTGGGCCAGGACGATGAG
ACGCCGGCGGGCGGCCCGCCCCGCCTCGGCGGGGTACGACGTCGCCACGCTCACCGTCGT
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GTGGAGTCAGTTGGAGGCCATTTCCGCCCAAGACCTGGAAACAACCGTCCTGGCTCGGCT
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CGGTTGTGATGACCAATTCACATTACTTGTATGATGAAACACTTGTGATATTACGTGAGA
AATGGCATTTGTCAACACCATGAGAGGACCTTGATCGTCAAACCTCTATGTGCATTTACG
GCTTTACGTGCCTTCCTTCTGTAGTGTGGCATTACTTAATATCACCATGTTTTTGTCCCG
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TGGTAAAACAAGTGTGTTATGACATGAGAAATGGGTTGTGCCTGAACCGAATGAGGTCTT
TGATTTACTTAATTATATCTGTTTTCATCCCGATTTCCAACCATACACCCTCCATTTTTA
TTTTCGGAGGACAAAATCCAAATAACTCGAGTCAACGTCGCGTTAGTACTTAGTTTCGCC
GGTTCTCACCGTCATTTCATCCCGATTTCCTGCTTGGCTTCTTCCTCTCCTAATATGTCG
GTACTCAATTCCGACAGTTTCAACCCCCATTTCATCCTGATTTTCGGCCTCTCGCCTTCC
TCTCCCGACATGGCGGTACTTGATCGCCCTTTCATCCCGTTTTCCGCCTTTCCGCCCTTC
TTTCTACGCTAGGCTATGGGCAAAAATTGTGGCCAATGGTAGTACCACAAATTGGGCGTT
CCCCGTGGGCATTGGGCGAAGAGCAGGTGCACCTAACATTTTGTCCAACTTGTCCCGTTC
CCCTCTCGTGCGCCGAGGCCAGCCAGTCAACACGACCGCTCCCGTCAAACCCACCGTCCG
ATCCGCCCCCGCACGGATCTCCAGGCGCATCCGACGCCCTCCTCCTCAAAACCCTCACCC
GCTTACGCTTCGGCCCTTCTTCTCTCCTCCTTCCACCTTCCCCTCCCCCGAGACCGGCGC
CGCTCGATCTCCCGATCTGCTCGCTCCGGCCCGCCGACGATCCGCGCCGGGCGCTCCCGA
TTCGACGCGAGGGCGGCCAGTGCCCGGATCAGGTGCGCGCTTCCGCGGATTTTTTTTCTC
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AGGTGGGGGCGCGGGACTCGTGGCCCATGGCAAGTTCGTATAACTTCGGCTACATGATGC
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