Map Locations of contig_1563062 (9212 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1563062

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12326 2 2762 bp MLOC_12326.1 Available Available LOC_Os01g19130.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13101.m02077 protein protein phosphatase 2C, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_12326






Contig Sequence (9212 bp)

>contig_1563062 9212 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCACTTTGATGTATACATTGATGTATTGTGTGTGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNA
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AAAAAAAACAGAAGCTGCAATAGCTAGCTAGACAGCTAGTCGTACATACGTGATTGTATA
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ACCCACCCGCCCACCAGACCCCGCGGGGAAGAGGAAAAAAAAATCGGGAGATCGCCGTTG
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GGTATGGTTGCCGGGCCGGAGGTCATGCATCAGGTCGTCCCGATGCTGGAGGCGTCGTTC
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CCGCCGGTCGATTCGCCATCGCAGGTCGACCTCCAGGTTCCCGATCTGGTGAGTTCTTGA
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TCGGCCGGGATCGCTCGCGTGTTCTTTGTGGCGTTGTAGGATTCTTTAGATTGTCAATCA
GGAACGCCTCTCTTATCTGATTGCGCAGCGAATTTACGATGCGAAAAGGTGTTTAAATGA
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CGTGTCTTGTTTCTCTGCTGTGCATATTAGGAATGTGCTAACTTGTTTTGAGTACATTTA
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GTAGTTGTTTTATCAATTCAGCATTGAAATGTTCGTTTAGTTATCTCTATAACACATGCA
TAAGTAGTTGTTTTTATCAATTCGGCATTGAAATGTTTGTTTAGTTATCTCCATAACTAT
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CAGCGTCACCTCTCATTGCAGAGCCAGAGTTCCAGCAGACCATCCTCACAGAGGATGACG
AGTTCCTCATCATAGGCTGCGACGGGATATGGGATGTCATGACCAGCCAGCAGGCGGTGA
CCCTGGTCCGAAAGGGGCTCCGGCGGCACGATGACCCCGAGAGGTGCGCGAGGGAGCTCG
CCATGGAGGCGAAGAGGCTCCAGACCTTTGACAACCTCACGGTGATCGTTATTTGCTTTG
CCTCTGAGCTCGGTGGGTGCCTGCCGCCTTCGGAGCAGGCGTCGTCGAGGAGGATAAGAT
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ACGGCTGCGCTTGCGCAGCCAGCAATTTTGTAGGGCACCCGTCGTTTGTTCGTTGCAGTT
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CTTGACAAAGCCACCTTTGTGAAAAGTGCTGATAAGAGGGAAAGTGTGCTTCTTAGCCCG
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GGCAAATTGAACGCTTTCTATTGCAAATTTAGTTGGCCTCAGGATGGCAAATTTAGTTCA
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TGCCAACTAAATTTGCTATCCTTGGGAAACATAAATTGCCATGAAAAGTGTTCGATTTGC
CATGGTTAAAAATCTGACACCAGATTTATAGTGAAGTCCAAAATAAAGCTAAAAGCAGTC
AAATGATAAGTACCACACATGTGACATCAAGCACTCCGTTCCTGACTTTTTTTACAACTA
AAGTTGACACCCGAACAGAAAAAAACAAATCCAAAAAACTAAAACTTGTCATCCGAAAAG
GAAGCTGTCAAGACAACTAAAGTTGTCATTCTTGCATCATTAATCTCGCCATGAAAAACG
TTCGGAGCTGTCACGTGTTCGTGCCACACATATGCACTTATCAAGATTCAAAGAAAAAAT
ACCAGAAGGAAACCGTAGAAGAGAAGTCCACCATGATGGAGGGACAAGTGTGACTAGTCC
AACAACTATGGACTCATTCTCTCTCATAGTCTACAAGGGACCCATGACAAAGATGTTGGA
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CTCTAAAATAGTTATTATTATATTTCATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCATGCTAT
AGTTGTATTGAATGGAGACATAAATGCATGTTTGGATATATAGACAAAACAATGTCCTGA
GTGAGTCTCTAGTTGACTAGCTTGTTGGTCAA