Map Locations of contig_1562816 (10863 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1562816

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12212 7 2849 bp MLOC_12212.2 Available Available LOC_Os02g35860.1, FRAME:+1, EVALUE:2e-175, 13102.m03904 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_12212






Contig Sequence (10863 bp)

>contig_1562816 10863 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GCGGATTGGGGCTCTTCAATCGTGAGAGAGGCGCCCCGTGATACGATACGGGGGCAATTG
GAGGCGGCGGCCCCGATTTTTTCCCCGTGATTTTTCCGGGGCTGATTATAGGGGCGACTC
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CCGCCGCCATTGGTGGGTAGATGGTGAGTGGTGCCCCCCATGGAGCAGGACATACCCGCC
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GTGGTGCTTTGTAGTCTGATGGTCAGCTTTAAACATCATTATGTGTAGTTTGTAACTTGC
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ATTTGTTGGGTAGTGAGCTCCTGGTCACTGTGTGCCAGCCCCTCCGGCTCCGCCATGCCC
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AAGGTCTCCCGCCGCTCTGTTTTCATCGTTTGGTGTTGAGCTGCAAGGCATGTTCAAGAT
GGTGCTCTGTCCATTGCGCATGCTAGAGGCCTCTTTGAGCTTGTGGTTGATACATGCAAC
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GATTCTTATTTTGGGAGTAGTTCACTTGAGGTTTGTGGTGTGTGGTGTTGGGCATCTTCT
GTTTGTGTTTGTTATGTTGCCAATTGTGGGCGTGGCTTTGGGTGCACTGTGATTTTGAGA
GGGCTTCGTCTTGCTTGTAATGGTTTTCATCCGGTTTTTCATAATTAACTGGACAACTAT
CTTTTTCTTATAATTAATAAAAAAGGCAAAGCTTTTGCCTTCGTTTCAAAAACAAAATGT
GTTGAAGAAACTCAATTGGCACAAGATTACCATCATCGGGTTTGTTAACTTGGATAACTA
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TGAAACACATGACATTAACAAATCTTTTTTGTTTGTTTTTTGAACTTAAATTTAGTATCT
CTTAAAAACCGATTAAAAGTCTGTTTCATCATTAAATCTATCTCAACGAGATCTTTAAAA
TTAGATCTCATATTGATATATTTCGGCCAAAAATTACGAAGATGTTTACATCAAAATTGT
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CATGGGCATGATTAATATGTTTATATTGGCCGGTTGCTGTTGATTGATTTGAAAAAGTAT
AGGTCCAATCAAAATAGTAAACCAAACCCATTAGGAAGCATAATGTATCTCTCTAAAGAA
TTGAGGAGGAGAGTTTCGACAAATTGTTGACTTGGTCAAAATCGGATGACCCAATTTTAA
TTTGAGTCTTGAAGACCTGAATTGAACCTGCCTCTTTAAAACTAAGGAGTATTGTATTAT
AGAGGTATAAATAAAATAATTAAATAAAAGAGCTTTGAGTAATTGTTGACCAGGTCAAAA
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ATTAGTGTTATAGTATATTTTGTGACAAAATTTCACACGCATCTGATATACATCTACATG
TACTTGTGTATATATTTTTTAGATTTTGTTTTACAATTAAAAATGTGTAACGACTAAGAT
GCGACCCNNNNNNNNNNTGGGGGCGATGCCTCAAAAGGGAAAATGGTGCATTTACACGTT
TCGCAAGAGAGATAATCATAACATTACATAACTGAAAGAGTGGCAAGTAGGGCATACACT
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