Map Locations of contig_1562796 (10217 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1562796

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12198 4 3011 bp None Available Available LOC_Os11g24560.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13111.m02341 protein protein transport protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_12198






Contig Sequence (10217 bp)

>contig_1562796 10217 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGAAATGTCCTAAAATTTTAAAAACATAATGTGATTATCACAATTGGAGATTATGATTT
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TTGTTTACCTACCTGGCTCGCTCATAGTTTGACTTTGTTTTTTTGGCCATGTGTCTTTTC
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GTCTTATCGCCCGTCCTTTATTATATACTCCCTTCATTTTTGAATATAAGTCTTTTTAGA
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CATTTTGCTTCGTACGTAGTCGCTAGTGAAATCTCTAAAAAGACTTGTATTTAGAAACGG
AGGAGGTAGTTACATAATACATAGTGACATGGCCCCTACATCAAACGGGTTATACACCAA
TTCATGGTTTAAGTAAGCTGCTATCATATCTTAATAATGATGAATTATGATGTTGTTATG
TACTTCCTCCATTTTAAAATAACTGTCTTAACTTTATACTAGTTCTAGTATAAAATTATA
CTCCCTCCGTCCCAAAATTATTGTCTTAGCTTTGTCTAGAAATGAATGAATCAAAATACT
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GGAGTACTAAGCTTAAGACACTTATTTTGGATGGAGGGAGTATTATCATTACACGCTCTT
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GTCAGCCTCTTTCCATGTTAGATACAACCCGTACAATTGCGTGTATGTACGCCTGTTTGC
AGACGTCCCATGGCGATGACTGATCTCTGCTGCATTGGCGAGGCTCTCCGCTGCTACTCG
GTATAAGCTTTCCGTGACTGCCGTTGTTGTGTACTGGATGCTTGCGTGCTCCAACTCCGA
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TTAAATTCACCATCCTGTATGGCCCGACGAGAAACAATCAGAAGGATGCCTTCTTTCCAG
AGCTGATCAATGAGAAGCCCACCCCAGGTTCTAAGTGGTTGGTCACCGGTAACTTCAATC
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GTTGGCAGTCCAACACTTCTCTAATTTGCGTACTCTGAACTTAAGTTGGCTAAATTCGGC
GAACATTGCTCTTCGTCCGAAAGGAGGGGGCGAAATGCATCTCGAATTTCCGTCCCATCA
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CTTCTCCTGTTCGGGCCTCGTTCTATGCTGATGATGCCGCCATTTTTGTGAATCCCATTA
AAGAAGACGTCCAATTCCTTGCTGCTACTCTGGCCTCCTTTGGTGCATTCTCATGCCTCG
TCACTAACTGTGCGAAGAGTTTGGTTGCTCCCATTCGATGTGACAATATCAACCTTGATG
ACGTTCTTCACGCTTTCCCGGTGGTGCACACATCATTTCTAATGCGATACCTTGGACTTC
CGCTTTCCGTCAAGCGTCTCAAGCGAATCCACTTCTACTTTCTTGAGGATAAAATCACCG
AAAAGCTCCCTCCCCGGCAGGGAAGGCATGTGGCTTATGCTGCACAAATGGTTCTCATCA
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CGGAAAATGTAAGTTCAACTAGGAGCTCGTCTGCTAGACCAAGGACAAGGGATGGCTTGG
AGTGCTTAATCTAGATAATTTCGCTTCTGCCCTGTGGCTAAGATGGCTATGGTTCGAATG
GACAGACAAGCCAAAGCCTTGGATTGGCATGTGCACGCCATGCGCGGAGGATGATCGTCA
ACTCTTTGCGAGGACCACTTTTGTCACTGTTGGGAATGGTCGAACTGCTTAATTCTGGAA
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ATGCAAGAAGAACTCCTCGGTCCTACAGGCCTTGACCAACAACCGTTGGATCACCATTTT
TGATAGCACCAACGGTATGTCCCTTGTGCACATCGAAGAATTCGCCGTCCTTCAGGAGAA
GCTAGCTATGGTGGTATTAGAGGAAGATGTGGAAGACTCAATTACTTGGAAGTTTACTAA
GGATGTGACTGATTCCACTTCTTCGGCATACAAAGCACTATTTGAAGGCTTCACATCATC
TGATCTTGTTCACTCCGCATGGAGGGTGTGGGCTCCCCCAAGGTGCAAATTCTTTGCTTG
GCTGCTCCTACAGAATAGGATTTAGACATTAGACCATTTGATACATCATGGTTGGCCCAA
CTGTGGCTTGTGCCCCCTTTGTAACCAAGTCCAAGAGTCCGCTGCTCACCTCATCTTCCA
ATGCCGTTACACGAAGTGCATTTGGAATGACATTCTTCCATGGCTGGGTATTCACCACAT
CTCTACTAATACATGGACGGTGAGCGGCTTTGTCAGAGAATGGTGGAATGGTATCTTGCA
GATTCGCTCGGCTCCCCTAAAGCTCTTGCCTCATTGTTAATGCTTATTTCCTGGGAGGTC
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AACAAGATCAAGCAGGAGGTGTCGCTTTGGGGGTGCCATGCTGGGGAACATCGCATGGGA
AACAAAAATATTTTCCTACGCTCACCAAGATCAATCTATGAAGCCTAACATCTATGGGAG
GGGGAGTGCATCTACAT