Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
No map location | ![](/morexGenes/blast_net_images/contig_1562796_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-OregonWolfe_maploc.png) |
![](/morexGenes/blast_net_images/contig_1562796_assembly3_WGSMorex_rbca.fasta-Morex_bigstats_maploc.png) |
Predicted Genes from contig_1562796
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_12198 |
4 |
3011 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os11g24560.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13111.m02341 protein protein transport protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_12198
Contig Sequence (10217 bp)
>contig_1562796 10217 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGAAATGTCCTAAAATTTTAAAAACATAATGTGATTATCACAATTGGAGATTATGATTT
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TTTAAATACAGGAACTAGTCGAAGGATTTGACCAGGAAACTGCAGCTGTTGTGTTGGCAA
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ATGATTCAGCCGTCATTAATTTCATTTTCTTTCGATTCACCTCCATCCCCTGTATTCCTC
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ATGGCTCCCAGGTGTGTATGTTACTGTATTATTATTTGTTACCTCTTGTATAGATTAAGG
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TACTTCCTCCATTTTAAAATAACTGTCTTAACTTTATACTAGTTCTAGTATAAAATTATA
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GGAGTACTAAGCTTAAGACACTTATTTTGGATGGAGGGAGTATTATCATTACACGCTCTT
TTGATTTACAAGGACCGGACCGTCATGTCTTCATAATCACATAAATATATGAACCGCTTA
TATTACATCTTTACCATGAAATTCCATTACACTTTCCTAATAAGAATATCTTAAAAAACT
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GGCGCGGAAGTGGTCGGCCAGACGGCGCAATGGTGCAGCCTTCAGGCCCATGTTACAGAT
GTCAGCCTCTTTCCATGTTAGATACAACCCGTACAATTGCGTGTATGTACGCCTGTTTGC
AGACGTCCCATGGCGATGACTGATCTCTGCTGCATTGGCGAGGCTCTCCGCTGCTACTCG
GTATAAGCTTTCCGTGACTGCCGTTGTTGTGTACTGGATGCTTGCGTGCTCCAACTCCGA
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TTAAATTCACCATCCTGTATGGCCCGACGAGAAACAATCAGAAGGATGCCTTCTTTCCAG
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CGATCTCACAACTTTAGGAGCTGCCTTCTCGGAGGAAGAGGTGAAAAAGGCACCGGGCCC
GAATGGCTTCTCTCGGGCCTTCTTCAAGGCGTGTTGGGAGACCATAAAGGATGACATTTT
GTTGGCAGTCCAACACTTCTCTAATTTGCGTACTCTGAACTTAAGTTGGCTAAATTCGGC
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TACATCACCTTCTCTACAAAGCAACGGCCGAAGGGCAGCTCCACCGTCTGTGCAGTCGAT
CTTCTCCTGTTCGGGCCTCGTTCTATGCTGATGATGCCGCCATTTTTGTGAATCCCATTA
AAGAAGACGTCCAATTCCTTGCTGCTACTCTGGCCTCCTTTGGTGCATTCTCATGCCTCG
TCACTAACTGTGCGAAGAGTTTGGTTGCTCCCATTCGATGTGACAATATCAACCTTGATG
ACGTTCTTCACGCTTTCCCGGTGGTGCACACATCATTTCTAATGCGATACCTTGGACTTC
CGCTTTCCGTCAAGCGTCTCAAGCGAATCCACTTCTACTTTCTTGAGGATAAAATCACCG
AAAAGCTCCCTCCCCGGCAGGGAAGGCATGTGGCTTATGCTGCACAAATGGTTCTCATCA
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CAAGAAAATTGATTGCATTCGCCGTGCTTATCTTTGGGCAGCCTCGGACAAGGTATCCGA
CGGAAAATGTAAGTTCAACTAGGAGCTCGTCTGCTAGACCAAGGACAAGGGATGGCTTGG
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ATGCAAGAAGAACTCCTCGGTCCTACAGGCCTTGACCAACAACCGTTGGATCACCATTTT
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GCTAGCTATGGTGGTATTAGAGGAAGATGTGGAAGACTCAATTACTTGGAAGTTTACTAA
GGATGTGACTGATTCCACTTCTTCGGCATACAAAGCACTATTTGAAGGCTTCACATCATC
TGATCTTGTTCACTCCGCATGGAGGGTGTGGGCTCCCCCAAGGTGCAAATTCTTTGCTTG
GCTGCTCCTACAGAATAGGATTTAGACATTAGACCATTTGATACATCATGGTTGGCCCAA
CTGTGGCTTGTGCCCCCTTTGTAACCAAGTCCAAGAGTCCGCTGCTCACCTCATCTTCCA
ATGCCGTTACACGAAGTGCATTTGGAATGACATTCTTCCATGGCTGGGTATTCACCACAT
CTCTACTAATACATGGACGGTGAGCGGCTTTGTCAGAGAATGGTGGAATGGTATCTTGCA
GATTCGCTCGGCTCCCCTAAAGCTCTTGCCTCATTGTTAATGCTTATTTCCTGGGAGGTC
TGGTCGGAGAGAAACACAAGAGTATTTAGAAACATGGCGGTCCTCTCGACGGTCATCATT
AACAAGATCAAGCAGGAGGTGTCGCTTTGGGGGTGCCATGCTGGGGAACATCGCATGGGA
AACAAAAATATTTTCCTACGCTCACCAAGATCAATCTATGAAGCCTAACATCTATGGGAG
GGGGAGTGCATCTACAT