Map Locations of contig_1562724 (2810 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1562724

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12174 2 656 bp AK251398.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_12174






Contig Sequence (2810 bp)

>contig_1562724 2810 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCTTAGGGTAGTCTTGCCCCCATCCTGGGATGTCCATTGAGTTGCTTGTAATCTGTTGT
AATCGTCTCCTCTGAGACTGACTTTCCCTCTTTTCAATACAAAGAAACGCACATCTCTGC
GTTTTCTCGAAAAAAAAAAGTATGCGTAATCAGATTCCTATTGTTTGAATTGCTGATGCT
ATTATGGGCTGATGCTATTATGGAGATCGGTTACAGGCTCACAACATTTGATTGCCATAT
AATTAATTAATGCTATGAATAAAAAGTATTTATTCTCAATCACATTATGCAAGTCTTTGA
TTTGTTGCATGCTGGTTTGGTGTGACTAATAGGTCTAGACTGATTTGATTTGTCCCCCAT
GTCAGTTGTTTGCTTTAGTATTTTTCTTACGTTATTAATCATTGATGGATTTGGACTTTG
TAATGCAGATATCATTTAGCATTGTTAATTATCTGGATATTTTAAGTAATCTTTGATTGA
CCATGTTGTGTGTGCATAGTGGTCGATGAACTTGAGTTGGCTGTACCACTTATTGACCTG
GCAAGGTTGTAAACTTATCTGCAAATTTATGTCTTAATGTTGCATACTGCCATGTACAGT
ATTATTTTATTTGGTCTATGTCATGATTTCAAACTTGCTTACATGTTTGTACTCTTGACA
GCGTGAGTTACATAGCCGAGGCTTAACTCATTCATGGTTATCATCTTCACTGAAATTTCT
GAATTTTGGTGATTGCAGTGGGTACTGAAATATTTGACTTATGTCAAAAATAATAATTAA
ACTTGGTTGGATTTTGTTCAAATCATTGAAAGTAGAAGTTGTTTGGCTGAACTAAAAACA
AATATCGCTGATTTCAGTGGTGGCCAAAATATGACCAAATATGTCAAGCCTGGATTGGGT
TACTTATTTTCTTGTATGTATTATACCATTTTTTTTCTTTTGCATTTGCTTCTTGCTGCC
TCCCACGGTATCACTACATAATCAGTTCACCTGTGCTAGCAACGGTGCATCGATCCTGTT
TACCAATGGTTCTTTATGTATTCCAGATGTGTAGTTGACACTTTAAATATCAATAAATTC
CTTCAGTTGTTGCGGGTATTAATGTCATTATATATTTATAGGATTAAAATCTTATTTATC
TGTTAATTCTTGGTCTGCTTGCTATTTTGTTGTTCTGGCTATATTATACTTCTAATGACA
TGCGGCCTTTGAAACAAATGTGCAGGTTGTGGAGGTTTCAACATCAAAAACTGGGAAGCA
TGGTCATGCCAAGTGCCACTTTGTTGCTATTGACATCTTCACCAGCAAGAAACTTGAAGA
TATTGTGCCATCTTCTCACAACTGTGATGTCAGCACATTTCATGAACCTTTTCCTGTTTA
AGTGGCTTCTATTGATACTAAAACATGAACATGTATAATCTCTACAGGTTCCTCATGTGA
ATCGCACAGAATACCAGCTCATTGATATATCTGAGGATGGATTTGTAAGTTGGATTTTTT
CATTAATGTCTCTTATATTTTAATCTTTTGTCAAACCGATTATTTAACTGGAGAAATTAA
CATTTCTTTCAGGTGAGTCTGCTGACTGATAATGGTAACACCAAAGATGACCTCAAGCTC
CCAACTGATGAAACCCTCCTTGGCCAGGTTTGTATGAACTATGTGTGCTGTTTAGAGTGA
CTCATGCGCGTGAACTATCTCTTCCATAGCCCACCAGCTCTTATATTGAATTTGTCCACT
GGTGCAGATCAAGGATGGGTTTGCTGAGGGGAAGGATCTGGTGGTGTCTGTCATGTCTGC
TATGGGAGAAGAGCAGATTAATGCGCTCAAGGACATTGGCCCCAAGTAATCTGTCGTGTT
AGCACTATTTTCTCGGGCGTGGTTCATTGGTATCTGTCGGTTAAGATGGATTTGGGTGTC
TCAGCCATTGAGGAATTGTGCCTTTTTGCAAAACTAAGTTGTCAGTGTTTAGTTGATTTG
TAGTCCTAAATTCATGGGTTTATTGACCCCTCTTGACTATTGGTGTTGTTGGTGTCTCAG
TGTGGAGGTAAATTGTGCTCAAGATGAAAAAGAAAAACTTGCCATTCTACCCTACCTAGA
ACAGCTTGTAGCGTGCCTTGACTTATGCTCATTTTGGTAATTCCGTGCATCTTTTCAGGA
TGCTATATACTCCCTCTGTTCCATAATATAAAAATCTAACTAACTGCACCGCATTTTGTC
ACTACCGTGCGGCAGCTTGCGGATTTGTGTGGGCTCTCTTCTTCATGCATGCAATGATGT
CATCAGATTCGTTTTAAATTATGAAAATTTTAAAAACTTTTATCTCTTAAACCGTTAATT
CGATTGATGATCTGTTTTCATTGTTGACTTTGTTTCGACGAAATCTTTAAAACTAGATCC
CATGTCGACATGTTTTGACAACTTTTTCTTTTGCTCGTACTTATCACATTTGTTGTACTT
ACTTGTTTGATAAAAAATAACTTAATTGCCATATTTTTAGAAATTGCGTATAATATGACA
TCTCGACATAATCAAACTGGCAAGCACAAACAACTTTTTTCAAGCGATTACACGCAAAAA
TATGACAACTCAACATATTTAAAAACGGTGATCACAAGAATATTTGGTCATCCTTTGTAA
ATATGACAACTCGACATAGTTAAACTAACAAGCACACAAAATAGTTTTCTCATAAAGTTG
TATGTAAATATGACAAGTTGGTATATTTTAAATTGGCAAACACAACCTATGGCATGCTTT
TATATCATGTATAATGAAATCTGCTACAAGGCTTTTTTGTACGAAACAAC