Map Locations of contig_1562604 (8537 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1562604

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12128 1 1815 bp MLOC_12128.1 Available Available None
MLOC_12129 1 801 bp MLOC_12129.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_12128






CDS Structure of MLOC_12129






Contig Sequence (8537 bp)

>contig_1562604 8537 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGTTCTACTTCAGGTCGTTACATTGTTTTTTTGCAGCATTTAGTTAATTATTAATTGTT
GGCCTGTGACTGTGACTCTACTTGGGTCGTTGATGCTCATGTTCGTTGGCCCGCAGCAAG
GATAACTTATGTGGAGATGTTTACTTGCGGCAACATATGGATGAGGAGGGCTTTGTATCC
ATCCCTTTTATGTCAACTTTCAATAAGGTGATCATGTTTACTGAAATTCCTTAACTTGCC
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GCATCATATCATATTAAGTGCACTAGATTGCTGATTTCCAATGTGGTTAATTCATTGGAA
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TTCTGACTAAGTTATATGAGATCAAGTAACTATTGGCTTCTGGATGTGATGTGAAGCTTC
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TTTCTGCTCGTCTGAGATGTTGTGTGTTCTTCTCTGTGCCATCAGGTTGTTTTTTTGTTG
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GCAACGTGCACCTGGCTGCACGTAGATTGTGTTTTTATAGAAAATTGTTTTATTCTTCCT
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ATGAATACAGCTAGCTTTTTCATCTCCTTTTTTGGTAGATTGTGTGAGTGGTAGTGGCCT
TGTGCGTGTGCATGCTTGAAGTCAGTTTAAAATGCCTTTGTTGTTTATTGGGATGCTTAT
TGCTTTACACCTGTTATATGTCGATGAATGCCTGCATACAGTTTTCCTGCAGGTATATTA
CATTGATATCTTGTGATTGAACTCAAATATTTATGTTAGGAGTGCATGACCATGTTATCA
TACATTAATAATGAATGCCAATCAAGCATCAGGGACTTGTGTGTTCTAGTTCTTGCAACT
TTTCTTTACATATTAGTTTTAAAAAAATGAAGCCTTTACTCGGGGACAGGTATCTGATCT
CTATCTGAATTCTGTTTGGCTGTAAGATAGGAGTTTCAAGTATAGCAGTATTGAATATTT
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ATAATAAAAGTAGCATGTGATTAACGTACTATTGCTCCCTACACCACTTCTCATTGATAA
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TCACTGTGCTCAAGTGCACTTTCATACTGCAATTTACTTGCACGACTCCAATGGACTAGC
AGTAAAATAGGGAGTACAGAGACAATGGATGTGCTTTTGTGGATAGTATGCTGCTATGGG
GGAACTAGGTTAGCAGTCCTTCATTCTATCTAGGTTTTTCTGGCAAGGCCATCCAGTATC
TAATCCATAAGTGATCTGTGTTTTTCAGTTGAATAAGATGTGCAACTCTTGCTGTAATTT
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TATCTTAAGAATTTGGTCAATCTGGTTGCTTTGCTTTCCCTGTTGTTGCCAATCTTTCTG
ATTCATTATTTTGTTTCGTGCGCTCGTGCATCCACAAAAACTGACAAGAAACTTAGTATC
TTTTTTTTATGATGATACCATATTATGTACTCCCTCCTTTCCTACATATAAGTCTTTTTA
GAGTTTCCACCAGGAGACCACATACGGATGTATATAGACATACTGTAGAGTGTAGATTCA
CTCATTTTGCTTCGTATGTAGTCTGCTAGTAAAATCTATATAAAGACTTATATTTAGGAA
CGGAGGGAGTATATATATGCCTAATGCTTTGGATGTCAAAAAGGAGGTTGGTGCTGAATA
TGTTTAAGCAGTCTGCTAACCGTGCGGAAATATTGTTTTTGCAGGTCCGGGAAATCACTG
CTGATATTCCTAACGCCAATTTGCAGTATATAATTGAAACAATTCAGTCCTCATCTATAC
TGGAAGTGAAGGTACATCCTATTATTCCACTCCAGTTTCAGCTATTTGAGGGCAAGTGGT
GTGCACTATCACATCTGTATGATATGGGGTTCCTTCAATGCCCACAAATAAAGCATTTAA
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TGTGCATTCGTAGACACTGGTCTAGAATAATCCAGTCCCTCTTCCCTAATGGTGGCGTAT
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ATTGTTTTCTGTGTTGATGCAGGGCGACAAAGTTAGGAGGAAAGATGATTGGGACAAATG
GCTGATTCCTCGAGAGAGCAACCCTAATATTGTGTCAAGCTCTGCAGCAGCTGTGCCAAG
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CTCCTTATATCACACTATGACTGCAAGGGTTTTTGTCCGAGCGCGAGTGACGAGAGTAGA
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AGCTGAAGAAGAGGATGAAAGACGCTGGTTAGGGCCTAGTTGCTTAGTATGCGATCCCCG
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TCTTGTCAGCTGTTTGGCCAAACGAGAATGTTGTACAACTCCTTGGTGTACTATTTTACA
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TTGTGATGTGGTGTTACTTGCTTCTCCTTCCGATGCATCGTTGCTCCAGTGTAGTTTTTG
TTTCTCATTAATTTTGTTGTGTGGTTACTGTGTTTTGTTGTACATGTAATTTGTTGTTGG
GTGTGCGTTGGTGCAATGCTGGCAACATGTTTGCTATCTGCGACTGGGATGGGCATGCAG
TGGTGACAAGCTGAAGCAGGCAGATTCAGCTGGAATCTAGGGGCCTGTTCGGTGTCGCTC
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CCTAGGCGTCGGTGGATTACTGAACAGGTCCTAGGTACATGCCATACTGATCACCTTTTG
GCCTTGAAGCAGGCACATTCTGATGGAGGCATCATGCACTTAGGATGATCGTCTACGTGT
TGTTGTGGTGTACGTTGCACTGCTGGCAATATGTATGCTATCTATGCAGACCATGTTTTT
TTAAAATCTACTCTGTTCAGTTATTTCTACATGAAGCAACAAATTCGTTCTAGTCATACT
GAAAAAGAGAGGAATTTCGGTGATTAGGATGAGCTATTTCTATATCAAGTAACCAATTCA
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TTATATTGCAGCTGACGGTGAAGCAGCAGTGAAGAATAATTGGACCTTGTGCGTGTGTGT
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TGGACAGGCAACTGAGGTATATATGCTTTATGGGAGAAACATCTGCAAAAAAGTCGAGCA
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TAAATAGTAAGCGTATTTAAAAATGTCTGATTTTTTTTGTAACAAATATAGTTGAATGTT
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GATACTTTTGAAACCATTTTGGAGCACTGATTTTCTTTTCCAATGTCATTCCATCACGAA
AATTTGCATGCACTTACAACATTCAACAATGTTTATCGCCAAAAAAGATGATATTTTTTT
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AAAATACGACCGTGTCTAACTAAGAAATAGTTGGACGATCGATGAGGTAGTTAGGTAGGG
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TTTCCGACTCAAAGGCAGCCCCCCTCAACCTTTTTTTATTAAAAGACAAGGCAAACAACA
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AGCTGCATGCGTGGCAAACATCCAAAAAAGGAGATGCAATCTAAACTACAACCATGGGGG
AAGGAAGAAACCTGCCAGTCGATCCTAAGTAATTCTCCTCGTCGATGATCTAGTAATCTT
AGGCACTCGAGAACAAGTGTGGCTTCAACACCTGAGCAGTGAACCTTCCATTGACGCACC
AGCGAACCTACTAAACCTGACACGCACTTCATACTTTGCCATTTTTGCCCATGAGAAACA
AGGTGGCACAAGTCACTAGATTGATAGCATCAGACTTCTTCTTACGTTTCCAAAAGGACA
GCAAAGATTCAAAACAACATGTTAATAGAATATATAAGAAAATAGCCACAATGTCCCATA
ATTGTCGAGCTTGTAGAAGGATTTAACAGTGTACACACGCGAATTCTCCAACACCCAATA
TGTCTATCTTTGCTAGAAGCAAGAGTTTTGTTTTGGACCGAAGAGAGCAGTTCCAACCAC
TTTTTGTTCAGATCTCTATCAACACATCTTCTAAAAGAAAGTTCCAGAATGTAGAAGTTG
GTAGAGACTTGGTGAACAAATTAGTCTCATGATTTGACTTGCAAGATATGCAATATAGTA
ATATTTCTTATTACATAATCTGTTTCTATCCACGTAACACAAGCAACCTTATATTTGAGA
TAATGGTTGGTGGATGTAGCCACAAGGTCTGTTTCGAAGACTTTCATGGGATAGCTACCA
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TCTAATGATATTGATGTTCAGATTTCTCTAAAAATGAAAGATTAGGACAAAATGTTTGAT
GCATTGGAGATATCGAAAGATATTCTCGAGTCTCAACCAATTGTGTTTGGTGGATCCAAT
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CTTGTCCACAATCAATTTCTCCAATATAATCTGGACATAGACAACATGTGTACCATAATG
TATGAGTGAAGGTGCTCAGGTCTTACCTAAGTCCTTCATCTTAAATTCCGCCATTTAGAT
GATCACATGCATAACATGTATGGGTAATCATCAGTGTAGGAATATTCCTTGCTTCTAAAG
GACTCCCTACACCAGTTGTACCAAATGTACCGACATCAATGAGTCATATGGTGACTTTTT
GATTTTACATAATGTGTGTCGCGTTTTGCATTTCGATTCAGAAGCAAGATTCCAATGGTA
ACCATCTATGTCTGAATCTAGTGATCCACATAGATATGTAATCACTACATCTATCAACTG
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GGAGAATAGCTGGGTATTTGTGTGAACCTTTATGCTATGTTAATTATCATGTGTTTGCCA
TGGTATTTTTTATCATGACAAACTACTTGCATCATAGCAAATTTTGCTTCTTTCATACGC
AAGAAAACCGTGTAGTTTCCCCCATGGATATTTTGTGTTTAGTAATGGAATGTCATAGTC
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TTAAATTAAAATTATCATAAACTTATAAGGCATCATGCCACGTTAAGTGTTTTGCCATGG
CATTTTTCCTAAAAGTTTGTTGCTCATGATAAAATAGTGTGATCATGGCAAATTTTGGTT
GTTTCGTACGCAAAACCATCTAGTTTTGCTATGGGTATTTGTGTTATTAATAAAGAAATG
CCATAGTTCTTGCAATAAGTTTGGATGGATCGAACGACGTAGAGGTGGGAGGTCCGGTGT
GGCCCACCAAATAAATTTCATATATCATGGCAAATCATTTATTTTTGTTTTTGCAAGGTG
AACTTATTTTTTGAATTGTTTTTGTTTTGTTTTTAGGCTCTTTTCAGCGCAATAGTAGGC
AATTGGGTTGTGTGTGGCTTTTTTGAATTTCTGAGCTGACTTCTCCTGTGTCAGATGGGC
GAGCAGAAAATAGTTCGACCCCGAAATCGATCAACCCGCCCCCATACCCTGGCGAGTGTT
TCTTCCGATCTAGGAAGCTCCCAGACCAAACATCAAGGAGATATTGGGGTCCTAATATTA
TGGACGTTGTTTTTTTGACCGGCAATGGCACTTTTCATCAAGTAGGAATGAAATAACTGT
ACAAGTGGCTGGTTGGTTAGACAACCAAGGGCCAAGAAAGAAGAAGAGAAAAACCGATGT
CCCCAAGTGGCAACTCGGCTATACATCAGCTAGGAAAACTATAACTCCCATGCCTCGACA
AGGAGGCCAGCATCACCTCTAATAAGGTTCTACACGACAATTGCAGTTGCCTCTTTCTAT
TGGAAGACTCTTCAATTCCTCTCGTTTCATAAGTTTGAAGCAATTTAATGTAAGCAACAA
CTGTTGCACTTAGCAAATTATCAGGAACAAGGATGGTAGGCTCCTTTTGGTGGAAAAACA
TTCTCAAACTCCTGAATTATTACAAGGAACATGCAGTATGTAAGGTTGGTAAAGGAAATA
CAATTCTGTTTTGTGACGATAAATGGACAGATAAACCACTTAAGCAAGAGTACCCTGAGC
TCTTCTCATTTACAACAGACCCCAGTATCAAATTGTCACACATATGGGGACTCACTGAGA
TAAGCCGATATTTTCACAGATCATTGTCACAACAGGCCTAGCATCAATTTAACTGATTGC
AAAACCTTATGCTGACCGTTAGATCGGCTCACCACAAGGACAAATGGACTTACACCTAGA
AATCCAGCCATTATTCTTCTATGAAGATGTACAAAGCACTGATAGAGGTCCCCACAATCT
TCAAGCATCTCTGGAAAACCTGATGTAGGTTATGGCACAAAATCTTCTATTGGCTTCTCC
TTCATGACATACTCAATGTCGGAAACCTTTTACATAGAAAGAATATGTTCCTGGAAGATT
ATAACTATGCTCTATGTGCACACCACACTGAAGAAACAATTCTGCATCTCTTTTGGGATT
GCCCATTTGCACTTTTATGTTGGGACCACCTTATCCCTGATAAACGGAGAGGTGTTAGAC
AATGTAATTACGGGTGCGTGTGTTTAAACTATGTAGGGATAGAACGTTGGGATTGATCTT
TGTAGTTATTATTCTCTTGTAGATAAAGATCAATCCTAACCTCTTTCTATCTCATGTAAT
CCTTGTGTATTCGGTTGCCCTTTGAGCCTATATAACACGCAGCCGTCCCTGCCGCAGAGG
CATACGATTCTACCCCATCTCTTCTCACATGGTATAGAGACTTCCTCTTCCATCTATGTC
CAACTCATCTTCATCTTCCGCCGCCACCATGTCCTCCTCCACCTCTCTCGCTGCCCTCGG
TCACACCACCACCGAGAAAACTCTCTAGAGAATTTTTTTTGGTGTGGAAGGCGCAAGTCC
TCCCCCACATCAGGGCTGCCGGGCTGATGGGATTCCTTGATGGATCCTCGGCGGCGCCCC
CTGCAGTTTTGCTCACG