Map Locations of contig_1562580 (7676 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1562580

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12117 3 2515 bp MLOC_12117.1 Available Available LOC_Os01g21970.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13101.m02335 protein protein kinase, putative, expressed
MLOC_12118 1 608 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_12117






CDS Structure of MLOC_12118






Contig Sequence (7676 bp)

>contig_1562580 7676 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCTCGCCGCTGCGGTGCCCTGCCTATAAGCAAAAGCGGTTGGTGGGAGGGACATTTC
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GTTGTCACTCTTGTCCGTGTCGGAGTTGTCCCGCTGGGAGTCCATTCCAGTGCTACCCCC
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CTTCACACATTGACATGAAATGTATACATGCATGACGTAAACAAGGATGAAGTTGCTTTT
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CAGCATCCGCACAACTTGACCCATCTTCGGTCTCTTTTCTGAATCTGGATCCACACACCT
CAAAGCTGTTAGAAGTGCACGCTTGAGAACTCTTGTCGAAGGCTGTGTCTCTATGGTGGG
ATCTACCACCTCCTCTGAACGCCTGCTAGCAACCATCATTTTTAACCAGTCAACCAAATT
TACCTGCAAATGGCACAAAATCATGTGTTGAGTTGGAAAAGCATAAGGAATGGCCCCCTG
ATTTCACTCAAGAGATAATGCAAGACACTAAGCATCACATGAAAGATTTTTATGACAAAT
ATAATTTTATAAATCAATGTGGTCAAGTTATGTCCTTTTCACCACACCATAGACGCACGA
GAGTGCGCCCCTAGCACATGCTAGAAATTTACAAAGGCTGAGGATAAAGATGTACTCTCA
AGGCTCTGAATGACCAAGTTATGCTATTTATGTATAGATGAGCACTATCTTGTTAACAAG
GGTGTAAACTGGTAAATGATAATATGGATTATCCAGTATCTGTAATCAGGGGGAAAAACA
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CTGGATTCTGGGTAGATTACCGACTTGACCTCTAATTTGGGCAAATAAGATTTGTGTTTG
TTTGGCACTACAAGGCAAACATCAGTATGGCCACCAGTTTTCTATTTGATGAAGTTTTAC
GCATTTTCCAACGAAATTGTAGGATAGTCACATCTGTTAGGAAAGCAACTTATCTATATT
GAAGACCCAAGGGGCATATATATATTACACATGACTTGAGGTGCAAGGAAAGTAAA