Map Locations of contig_1562518 (5683 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1562518

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_12097 1 1837 bp AK364357 Available Available None
MLOC_12098 1 290 bp MLOC_12098.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_12097






CDS Structure of MLOC_12098






Contig Sequence (5683 bp)

>contig_1562518 5683 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCGCCAGCAGCGCCTCCCTCCTTCCTGTACTAGCCGCCGCCGGCGACCAGTCCATAGGC
GGGCAGGTAGCCGCCACTCCTTCCCCCTTCCTCCTCCCCGCTCCTCACTCCCTCTTCCCT
CATCCCCCCTCCCTCCTTCCTCTTGCATCCTCTGTTTGTTCAAAAAAAAAAATCCTAACT
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GTCGCCCCTCTTGGTTTTCTAACACTGGGTTCAAGATCCAAAAGAATGATCCCAACCATA
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ATGCCACTGAGAGTAGCTCATCTATTGCATATGATCATGTTTTTCTGATCATATGGTATT
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TTTACTCACATTCTTAAACCATGAGAATATCGTAGATTTTCATACCGGATGGTTGCTTTG
GGGTTGACAAACGTTACCCATAAGTGGATGATCATAAAGGTAGCTCACGGGTATATCAAA
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GCGAATAAGAGATGTAATTAACTAGTAGTGTGTACATATCCAAACAGACAAACATTGCAT
CTGAAGAGCACAAACATGCAACCAAATGTCATGCTCGTGTTTCTACTCTCATGCAGCCTG
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CAGCCTCCACCGGGTTTCAGCCAAGCACCTGGTATTAGCCAACTCAAATCAAAATAAAAT
CATCAACCAGCCTCCACCTTTATTCATCACTAGCTAATTGCCCATGTGGTTGCAAAGGGG
TATACACATTCTAATGATTTAAAACCAATCATGTCTCACATATACTTCATCCATCTCAAA
ATAAGTGTCTTAACTTTGTACTAGCGGGCCGATTTTTTTGGCATGCTAAGGGCATGTACA
ATGGTGCTATCTTAGTAATGTCATGTAGGATAAATGATGAGCTGAAAGAGAGAGAACTCA
TGAAAAAGGTTTGTCTTCTCTTATTTAAGAGAGAACAAGAGGTGACCTCTTAGTACAATA
TGTCTCACCATATTTTTAGAAATAGCTAATTATTAAAGATAAGGCTAACATATGATCCAT
TGTAAGATATATTTTTTTATCATCTCTAAATTACATGCAAGACTTAAGATAGAATCATCT
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GGAGCGCTTTGTTCTTTTTGGTAGTGTAGATAGATACTTGTTGTAAAAAATATTACTCCT
CACCAAGCCCTCTTTGTTATTTGTTGCTCGCTACGAATCATCT