Map Locations of contig_1562294 (13673 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1562294

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11987 1 663 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_11987






Contig Sequence (13673 bp)

>contig_1562294 13673 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGTTCACCACGGCGCCGCTGCCGACGTTGTCTTCTGCTGAGCCCAATCTCTTTCGAAGA
CTATCTCAGCATCCCAACGCATAGCCTCCTCGTCCACGCTCCACAGGTAAGCCCTAGAAG
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GTTCGCTTAGCAGTCGTGATATCATGTCTGTATTCTCCGGTAGGCTGTTGATTTTCTGCC
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CCTGTTCTGTCTTGTCTTCATAACAAAAGGGGTGGCAGTTTTGTTCAGGAGTTTTTTACG
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CTATGTTACAAAGAAGAACCGACGCAAGCGCACAAGAGAAGATGATCTAAAGAAGGAAGG
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CATAGATCAGATACCATTACCAGCTACTGGTGATGAACCTGAAGCAGCAGAGAAGATGGA
GGACGAAGATCCTGACTATGAAGAAGATCCCGAGGAAGTAGAAATATATGAAGACGATGA
TGAGGACATGGATGGTGATACTGCCGAGCAACAGGTAAACATGTTTTGCACACAATTTTT
GTGCACACTAGTTATATTTGATTGACAAACAGATATGCCATTTATTTATCTTGTGTTTCT
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GTCAGAGCTTACAAAATTTTGTGCGGTGGCCTTTACACCTGACAGGGCCATTGGATGATA
GTTCAAATTTCATGTAAAAGAGAGCTGTTTTCTACAGTGGTTTTTGTACACTGGTCATTG
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CCTATAACATCCTGCTGTTCCCTCATGTTTCACGGTGTACCTGATTGTTTTATCTGTGCC
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GAAGTAGTTGATAAGGACCTGTTGCAGGTAAATTTTCTGTTGTAAGAGACTAAGAGTTGC
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GGTGCATTGTTCATAACTTGGGGAAGTTCTTGTCTAATAGGGACGTGAAGGTTAGATATC
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GCATTATTTTTTCTGGCATTTTGTATCAGTGCATCTAACAGTGACATGTTTTCCCTTCAC
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ACACAAAAGAATTGTTCTTAACTACGAATTCCCCATCAGAATGTCTCGGCTCAAGAAAAA
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GAAAAGTTTAATAATATTGTATATGTAGCAGAAAGGGCATTGCAACTCTCAAGCCTGGAT
GGTTTTTATAATTCATTGCACCGGAGGCAAAAGTTTAGTGGTGTATGGTACAAGGTAAAT
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GTCTGCACACATGAAACAAAATGTAGTATCAAGCATCATGATAGAAGCACAGTATATCAT
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GGTATATAAAAGTAAAGCTCTACAACCACTTGGTTCAACATATGATATGAATTCTAAAGA
TGATTCAATATTTGAAACTGCAAACAAAAATATCGGCAAAATCTTTTATATGTCTCATAA
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GCAAAGCTCCCTACTTCATATTAGGCTAACAAAACTGTTGAAGTTGGCTTATAACATGCA
CAAAAATCAACAAAATAAATAAATTAATCACATTGAAAGGAGATGAGAAATATTATCTAA
AAAGATAAAATAATAAATAGATTGTCATCAATGGAGAACTATCTAGTGGAGTCTGTCCTT
ATTTGGCTTGCCTAAAACCCGAATGGTCTGCCTTAACATGCCTATCGACGGTGAAAGATC
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GATTCTTTGCTATGGTATAATTATTCATATGCAAATACAGAGAGCCACAATGTTTGTTTT
GATCATAATGCATGTTCTTCATTATATGCAAAGGCGGCGAGGAACAACATTGTGATAGCG
TGGCTTATTAGGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAAGGAATTCCTTCTTTTCGGGAGCC
CATTCGAACAGAACTCTCAGGTTAAGCGTTCTCAGCTTGGAGTAGTTCTAGGA