Map Locations of contig_1561834 (7382 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1561834

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11792 1 3477 bp AK373991 Available Available None





CDS Structure of MLOC_11792






Contig Sequence (7382 bp)

>contig_1561834 7382 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCTCTTCAATCGGTGCTACCCCAAGTCTAAATACTGAATTTTGGTCACTGATCAGTCATT
CTTTTTAATGGCATAACTCATCGGACTTATTTAAACCTATCATAAGAAAAAATGCCATGC
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CAGCACCGGGAGCAAGTTCCATTCATGCGCTTTCCACCCTAAGTATCCATCTTTGCTCAT
CATTGGTTGCTACCAGGTAAGTGTTTTAGTGCGTAACAGCATTTTGCCATCATGACACGT
CTGAAAGTAAATTGCAAAGAAGTATAAATGTGGTTGCAAATGAAATTATCTCAACTACAA
TTTTAGCTTAGTGTCGAAAATTCTCATCTTATTAATACAAGCATGACGATGTGTATGTGG
ATGCACAAATATTACTCCGTGGCACAAAATTACCCTTAGAACTTGCTGCTGTGTCTTTGA
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TTGGTGTCCAACGCTGCAGTCTCTGGAGCTGTGGGACATGGTGGAGAACAGGAGCATGAC
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CTCAGCGAGCCATGACAAGCACGTGAAGCTGTGGAAATGAACCGTCTCACCACCGCCCTC
GCTCTGAACCATAACCGTGGTGGATGAGCAAACGGCTTTTGCGGCCGGTGCTGGAGAGAC
TCTAGATCGCATAATAGCCCCCTAGTTATGCAGAGCTGGTGCTGGAGAGACTCTAGATAG
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GTATAGAACATCAGCAGCTAATATATATCTATCTGAGTTTGGGCACCATCTCTGATCTCT
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TCTCGTGAGTTTTCTATAGTTTGTGGTGGTGGATACGGCTGCAGTCTTGGATGCCAAGCC
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TCTTGACGGTTTGCCAAAGACGTTGATTGCTTGATTAGAAGTCCGTGTGCAACATTCTCT
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GTTAGTGCAAATTGGTGGTGCCATTAGTGCAATTTAGGAATTGGGCATTAGGTATAAGAA
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TGAAAAGCAAGTTTCAATTTCAGAAATTGGACAACCTCTTTTATATGGGATTGTTGAGTC
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GAAGTACATTCTAGGGGTGAATCAGATATATGCTTGTTTGAATGAGTTTGTTGATGACAT
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CCCTAGAGACAATAATAAAGTGGTTATTGTCATATTTCCTTGTTNNNNNNNNNNNNNNNN
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