Map Locations of contig_1561779 (10479 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1561779

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11761 13 4658 bp MLOC_11761.2 Available Available LOC_Os10g35940.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13110.m03241 protein folylpolyglutamate synthetase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_11761






Contig Sequence (10479 bp)

>contig_1561779 10479 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AATTAACAATGGACGGGTTGATTTCTCAAACAAATAGGATAGGACGGACTACATCAGTTA
GTTAGCTTATTATTTTAATAAATCAAAATGATTATAAAAAGATTAAATGCTTGTGGTAAT
TTTTTCTCCCGTTGCAACGCACGGACCTTTTTGCTAGTTTATTATTCATATATGTAGTGT
GTGACACCCTCAACTCCCAAGCATATGTTTATTTTTTGGCAAAAATGTGATATTTGGAAA
CGAGTGGATGACACAATCATGGGCCACGCTTGCGGTAAAAAGCTCCAAATAATGGGCTAG
GCTACCTGTTAAGCCCCAAAATACAAAGAAATGAGGCCTGTTGTTTCCCCCGCACAGCGC
TAGAGGAGCCCAACACAGCGTTAATCAAAGCCCAACACAAGTGCGATAAAAGGAAGCTGA
GCCCTCCACATCACACGATTGGCGAGCGAGAGCGATGCGCGCGAGCGGCGGCGCGAGCCC
ACGACCCGCACCACCGAAACGCTCTGCCACTCCGTCCACCACCAAACTACCACTACCAGT
ACCCGCCTCCTCCTACCTCGCCATGCCGGCCCCTCGCCTCGCCCACCTCCGCCGCCTGCT
CTCCCTCCACTCCCCGCATCCTCACCCGCTCGCCCCAAGCCCCGTCCGCCCCTTCCACCC
CTCCTTCATCCTCCCGCGCGCCATGGCCGGCGCCGCGCAGGCAGGTAAGCTCGCGAACCG
GGCCGAAACAGGAACTTCCTCTCTGCTCCATTTGGGCACAGCGAATGATGCGCTGGTGCG
TGGGGGGAGGGTGCAGGTGCCGCGACGGGGTCGGCGGAGTACGAGGAGGTGCTGGGGTGC
CTGGCGTCGCTGATCAAGCAGAAGGTGCGCGCGGACACCGGCAACCGCGGCAACCAGTGG
GAGCTCATGGCCAAGTACCTGCAGGTGGTGTTGCTGCGACGTCGATCTATTCGATTCTTA
TGTGGTCTGTTCTGTTGTTTCTGATTACTTTTGTTTTGTTTTGCTATAGATACTGGAGCT
GGAGGAACCCATCGCGCGGCTGAAGGTGGTTCACGTCGCCGGGACCAAAGGGAAGGTGAG
TGCAGCTGGACGCGGAGTTGCTGGGTTAAGATAGATTTGGATTGTTCTGGAATTCTGGAT
GGGTTTAGGCTTGCAGTTTTAATTTATTCGTGACCAAGCACAGCAATAGTTATAACAACA
GTATGGACTAGTGTTATCTACATCGTTTGCATTTCAACTTTGTTTCCACGCGAGACATTG
GATTGGCAAGATGACCAAATCACCCCTCTCCCTCTGTCTCAATCTTCCCTGGACGCTGGG
GCCTTCATCCAAGACTCTATGCAGGTGCGGCACTGGTATATGTTTGATCGAATGTCTGGA
AGGAGCAGAACAGACACATTTTTAGAAATGAATTCTTAGATGCCAAGGGAAACTCTTTCC
TCACTCAGGAGGATATCTTGCATTATAGTGTGTCTTGCAGTGTTTAAGCCAACGGGTAGA
CAGCTTGCTTCTTGGTTTTGACGAGGCGGCATGTATGAATGACGGCGCTCCTACCACTTT
TTCAAAAAAGAAAAGGAAAATAAAACATTGGATTGCCTTTGTTTTTTATGTGTGTCTTCA
TCTGGCATGAAACACGGAGTAATACAAGTTGGCATCAAGCATTTTACTTTAGAAACTTAC
ATAATTGCTGAAGTAGCATTTACCTGAGGCCTTGCTTATCAATGAAGTGCTTGTAATTTT
GTAATGTGTGTCGTGTTTGTGATAATGATTTATGACCTAGTGATATCTAACAATGTATAC
AGACTATAGCACTTTCTGATTGTTTTCGTTCGCACTTACTGAGTCAATCCTTTGTGATAT
TCTTGCAAAGAATTTTTTGCAGCAGAGCAGCTGTTAACTTCTCTGTGCTTTTTATATCCT
TTAGGGTTCAACATGCACATTTGCCGAGTCAATTCTTCGATCATGTGGTTTCCGCACTGG
ACTGTTCACCTCTCCACACTTGATCGATGTCCGTGAGCGGTTTCGGCTTGATGGGTACTT
TTCTCTTTGCTGTGATGCTACATTTTTTTTAAATGAAAGTCTTTAGTTGCTTCTCATTAT
AATTAGACTTGAGGTAATTACTATTGTTGAGTGACTTATTTAATTCGTCCAATCACTATG
CATCATTGTACTTACCTATTGCCCTTTTTTCTGGTGAGGTTACAGGCTGGACATTTCGGA
AGAAAAGTTTATTAGGTATTTCTGGTGGTGCTGGAACAAATTGAAGGTGAATATCACCTG
TTTTGTTTCATATGATGCCATTGCGGCTGTATCATGTTGAAGTGGGACACTAGTGGAATC
TGCATCATTTCTTTTCATGAAATTTAATACTTTCCTTAAAACACCCATTAATGTGGTGAA
TTTGGTTTACGTTCCAGGTCAAGACTAGCGATGATATTCCAATGCCAGCCTACTTTAGGT
TCCTTGCGCTGCTAGCATTCAAGATTTTTTCAGATGAGCAGGTTAATACTTTGCGAATAC
TTATTGTTCGACAAGCATCACTCTTGTCATGAATCTAGATAAATACATGTTTGAGCCTTT
TCTTTTATGCGTATTTTGAAGACTTTTCCCATCTAAAGACTAGATATTCTGGACATTGGC
TCATTGTGTATCAGATTATTTGTACGTTTATGAAAGAAAATGCGCCTCTCGTACTGTAGC
TTTATTGTTTGTAAAAAGGCTGCAAGTACTCACCTCCATAATAATTTTCTTCTTCACTCG
AACTGTCTAGCCTATGTTACTGAAAGATGTCATATGACTGGTAATTTGAACTGTGAAAGG
GTCAGTTATCAGGTAGGTTTATTCAAAGGCATCATCATTTTCTAGTTAGATGAGCCTATG
GTATACTTCTTGATTTTCAGAACTGCATATATGATTGTTTCCTAGAACCTACTCATTTTG
TGTGTTGTGTGTTTAAGCAGGTGGATGTAGCTGTGCTGGAGGTCGGTTTGGGAGGGAAAT
ATGATGCAACAAACGTGGTTTGTGACATTTCTATGATCATTTTGTAGTTAAATAATCCAC
ATTAATGTGAAGTGTCTGTATGACATGATCGCCAAACAAAAAGAAAGCTCATACACCAGC
GCATGTGGTTCTTTTGATATGTCACACTGATTCTGATTTTAATACTAAACTTACATTGTA
CTTTAGCCGCAAAAGGCTGGTCGGAGATCACAGTGCAAACTATAGCAGAATGACTGTCAT
GTAGCTCGTTCAACCTAAGTTCATCTGTAAAATATCTAGAATCTGTTTGGAATGCATTCT
AAGCTTATGTTTCTTCCTATTTTAGCCCGTTGTGATCACCATCAAAGAGATCGGAGAGCA
TAACTGCTGTGAAAATTGAAACTTTTGCAGGTAAAAGCACCTGTAGTTTGTGGGATATCT
TCCCTCGGATATGATCACATGGAAATTCTTGGTTAGTCATAAAACTGAATGAAGAAAAAA
ATCCTTTGCATCTGTAGTAAACTTGTTTCATTCATGTTGCCAATGCTTGAGCAGGAAATT
CACTTGTAGAAATTGCTGGGGAGAAGGCTGGAATATTGAAGGTTTCTCTCGACCTATTTT
TTTCCTTCACATATTTTTTGGAAGAATGTAACATGTTTGTTTTGCTCCCATCTCCTTCAG
CTGACAACTTCTGTTACTAAATTTGACTGTTATTTTGTACCTGCATGACTTTTTTCATCA
AAACACAGAAGGGAGTTCCAGCCTATACAGTTCCACAACCAGAGGAGGCAATGTCTGTAC
TGAAGCAGAGAGCTTCTGAATTGGGTGTATGTTATATTCCATGCTACACATTTTTTTATC
GCCTCTCTGCCTTGCACATTCTGGTTGCAATGAGCATGACTATAGTTTGGTCCAGTTAAT
TTATGAAATTTAAATTCATTAAAGGTTTCTATCCGAATAGTTCCACCTTTGGACCCACGG
CAATTAGAAGATCAACCTCTTGGGCTGCATGGTGAGCACCAGTACATGAATGCAGGCCTT
GCAGTTGCATTGGCTAATACCTGGCTTGAGAGGCAAGGACATTTGGACCGAATACATGTC
AAAGATCATGTAAGTACTCCAAACTGGCATCTATTTATTTTCCACAAAAAAGGATATGTT
AGGATCAGTTCTCATGTTACCATGGAGTGCAGGGCACCTTACCAGATCAGTTTATCAAAG
GGCTATCAATTGCTTGTTTGCAAGGCCGAGCACAGATTGTCCCAGATCTACAAGTGAGCT
CAGCATGTAAGGACGCCAATTGTCCCTTAGTTTTCTATTTGGATGGGGCACATAGCCCAG
AAAGTATGGAAATATGTGCCAAGTGGTTTTCCCATGTTACGAAAAAGGATGCAGCACAAC
CAGGTCCTTTGGAGCAGCCTCGTAGTGCTATCAATTCTAAGAAGGTATGCTATGCCTTGC
AGTGGCAGCCTTTCGGATTAAAGCAATGTTTAAATGGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCA
CACACACACACACATTCTCTTGTGGGATGCTTTCAGATTCTCCTGTTCAATTGCATGTCA
GTAAGAGATCCTCAGATATTGCTTCCACGTCTTCTAGATACATGTGCTCAGAAAGGTACG
TCAACATAATTCTTTGCTGATGTATCGATGACGATCTTGAACAATGCAATGATTTTATTT
TGTAGTTACTCAACGTGTTTGGAGGAAACAAATTTCTACTCGAGCAATTGTTTGCTTTTA
TTGTTTGCTTATTTATTTTAGCTATGGCTTCTGTAAATAAGCTTGCACTCCTTGTTTTTT
TCAGTTAACGAAATGGGCAGAGTGCCCGCCTTTAACGTCAAAGAGAAGTTGTTCGTTTGC
GTGTCATGTAGATAATCTGTGTTGTACTCCCTCCGTCCCGTAATGTAAGATGTTTTTTGA
CACTAGTGTAGTGTCAAAAAACGCCTTACATTGTGGGACGGAGGGAGCATTTCGTTAATG
GCTTGTGTAGCTAAATGAACTACCAGCAAGCTGAGGACTGTCTGAAGTCACTGGCGTAAT
TTTCTTTGTGCTTACTTTTCAAAATGAACAATATACTCGTACTGTAAGTTGAATGGATGC
TTTCATTGCTCTTCTATAATAACAAGTTGTTTTGCCCAGGCCTCCACTTTGATCAGGCCT
TATTTGTGCCAAACCAATCGCAATATAACAAGCTTGGTTCGCATGCATCACCACCTCCAG
GGAGAGAGCAAATTGATTTGTCATGGCAGTTGTCGCTCCAAACAGTTTGGGAAGACTTGC
TTCGTGGCAAGAAAGGTATACTAAAATTATCGCAGTTAGGTCTCGAACTGGGTTGTACTG
TCAGCACGACCATTTGAGTTAAAGATGATTGACGCACTTCAATGGAAACAATGCAGGTCT
AAATTGGACAAGCTCTAACGGGGCTAGTTTAGTTTTTGAATCTCTTCCATCAGCAATTAA
GTGGCTAAGGGAAACTTCTCAACAAAACCAATCTACTTCATGCCAGGTAAATTTCTTGGG
CATATTTGATTATTTTCCGTGATGTTCTCTGAAATGTTTCATAGCAGTACTACATTATGT
CATGCGATGACTGGAATATTTCACCCTGCCATCCGTAGCTAGCTACCCTCCTCTAGGCAT
TGTAGGATTCATTATCACTTATCCTTTACTGACCCTCATTCACTGATTCACACATGTATG
TAATTGTTTGTCTTTTTGGCATATATTATTCTTCTACCCGTTCAATTCACGTTCATTTGT
TTGTTTGTTTATTTCCTTTTGTTCTGCTATTCCATGATTTATACCTGCCATTTTATTACA
CTGGCTGCTTTATGTTTGTTCAGTTCTGCTAATCCATGACTAAGAACATGTGTTATGTAT
TTGTATTTCTTCTCTTGCAAGTTTCAACTGCTTTACTACTCGATGCTTATAGGTTTGTTT
TTATATACTGAATCAGGTCTTGGTTACTGGCTCCCTGCATCTCGTTGGTGATGTCTTAAG
ATTGATCAAGACCTGATTCTCCTTGCATCTCGTTGGTGATGTCTTAAGATTTCTCAAGTA
AATTTTGTTGGAATACAAGGTTCAGATTGAAGTGTCTGTATACTAGACCACCATACACCG
GAGCCTATTGTTATTTATGATTGGCATCCACAATACAACCACCTGGCTGAAGAATGGGAG
ACTTGAAGGCCTTATTATTCTGACGTGGACTAGCACAAACATGTTGTACTACCTCATTTT
TTTGTTTCTGCCTATGTGGGCGCTTGTACACCACTGTAGCCCATTTTTCTTCAAATATTT
TCACTCTGCTTTGGAGTGTACAAACAGTGAACTATATGATATGAACAACCATGCAAAATT
TTCAAACTTGGAATAACAATGTTTTCCAAGCTTCGATTCTTCAAAAATTATTGTGTCAAA
TACAAATACCCTTCATATACCGGCACTCCCTGTTGGAAGATAGAGAATAGTCTGACTAAT
TGTCAAGTACTTTTCCTGCACATCCGCCCTAACTTTACTTTGCACTGAAGCAGACAGGAC
TGACAGGTCACTCTTTTGCAGAACAGATTCTTGGGTCTGATTGCTTGTTGGTTTGTGGAC
CTGAGAAAACAGAGTATGTACATAATATGAATCCTAATTGGTAATGTTTCACCTTCATTT
CTCTTGTTTCTCCAGTTCATAGACTAAAGCTACTAGCAACTGAACTGTTCATTTAGATAA
TTCTAGGAGTTTTCTTTTTGCGCCTTGAATTTTTATATTAGCTTTTCGTTTCATCGTTTC
TTTGCTTCTGAAAAGCTGTTCGAGTTCAAGGCCTAACAAGGTCTTCACGTTTATTCATTG
TATATATTTAAGTGCATGTTATTTGATATTTATCATATGTGCTGTAGAGGAACATGTTTT
TTCTGGGTATATCGAGAATGCATGTGTGTCTTTCTGGGTGCACTAAGAATAGATTTAACA
TTGGCCACCTTCTTCGTCCAATAAAAACTTGACCGACAGATAACAACGCCTTCTAATTTC
GCAATACTTCTGCCTATGTCTTGGACTATTGTTAGTATTTTGTTATCTTTGGACACTAAA
TATAGTTGAACACTTTGTATAGGAGAATAACCACAAATTAGAACCGTGCAAGGAGTAATC
TCCAAAGTTAGCATTATGACGTGGCACATCTATTCACATCTCTTACCTTTTCCTGTGGCT
TGGTGTTGGAGCCGAGCCTCTTCTATTTTTCCTTCCGCCTCTCCCAAATCTGGTTTCAGG
CATTGCATTTAAAGCCTTCCACTGCTTCTAGGTCCAGCCTCTCTTTGGCTTTCATCTGCT
TCTATTCGGTCGCAGATCGAGAGCCGAAGACAGGTTATCTTGATAGCATTAGAAGGCTTG
CACCAGACAACTCTTGTTAGCAACTGAGTGGTATATTTCGCTAGGTTTCACCACCAAGAA
TATCAAGATGACATTCTATGGTACACAGGACAAGTGCAAGGCTTGTAACAAGACCGTTCA
TTTCATTGACCTCCTCACTGCCGATAGCGTTCCCTACCACAAGTATTGCTTCAAATGCAG
CCATTGCAAAGGCACTCTTTCAGTAATGCCCCCTTCTTGACATTTGCCGTCAGATGCATC
AGTTTCTCACATCCCTTTGCTCTGATCTTCTGAATTATGCCTTGTGCATGAGCTCATGTT
AAACTGCACTGTTTCTAGATGTGCAGCTACTCCTCCATGGATGGAGTTCTTTTCTGCAAG
ACTCATTTTGAGCAGCTTTTCAAGGAAACAGGCACCTTCAAGAAAAACTTCCCCACATGT
AAGTTTGTCCTCATTCCTCTTCCCACTGTTGTTTTGTTTGCAATTACAACAGAAATCTTA
TAACATTGTACCTGTTTTTTTTTCTTCAGGCACAAAGGCAAATAATGAGCAGGTATTGCT
TTCTCACCATTCTGTGGGCCACGCTTATATTTGTTGTGAAATGATTATGAAAAAATGTAC
ATTGCAGCCTGATAGGTTATCCTTTGCTGCTGATTTAATATTTCGTAGAGTACAATCAGC
AATATCGTTACTTCCCAATTTAAAAAGAATCACAGATTGCAGCTCATAGGTCGTTTTTTA
TTTTATTTTCTACAGTCTAAGGTCCCAAACAAGTACGGTTCTGTGTTCTGTGGAACTCAG
GACAAGTGTGCTGCCTGCAAGAAGACTGTGTACCCATTGGAGAAGGTAAGAAATTCCCAT
TCTTGAACAATTAAAGCGGCCGCGATTAAGGAGTGAAACTTGGGTCGCAGGGCAATCTCA
ACTTTTGGCTAACAAAATTCAATTAGCAATAAAATGCACATGCATATAGCTGTTTGCTTC
ATTTCAGTCCTTGATCAACCCGCCCAAGTTTCACGAGTAATCAATAGCCTGTCTGATAAT
TTCAATTCGTTGGCAGATGACCTTGGAGGGTGAGCCCTACCACAAGACCTGCTTCAAGTG
CGCTCACGGCGGCTGCATCCTGACGAACGCCTCCTACGCCTCCCTCAACGGGATCCTGTA
CTGCCAGCACCACTTCTGGCAGCTGTTCAAGGAGACGGGCAGCTACAGCAACCTGCTCAA
GCCTGCCTCGGCGAAGCATGCCAACCAGCCAGAGGCGGCCAAGGAAGAGGAGCAGGCGGG
CTCATCCAAGGAAGAGGAGCAGGCGCCAGAAGCCGTCGAGGATCAGGAGCACTCATAAGA
AACTACACACGTGAACAGTTACAAGAACCTACATACATGTTCGTTCCCCACGCTGATGTT
GCTCTTGTGTATTGCTGCTGCTGCTGCCGCCCATCTTTTTTCTTATCTCACAGAGGCACG
CAACGGCTGTTATGCATCTTATCGCCTTGGCTATCGCGATCCTGAATTTTGTACTCTATC
TCGTTAGCCGTGCCGCTGTCCCCTGAGTGATAGCAGAATTTGCACGACTGATTTTTTTGG
ACCACATATATTATACTCCTCTGTTAACTAATATAAAAACGTTTTTTTTATATTAGTTAA
CAAAAGGAGTATTAAACAATAATATAGAGTACAATTTCATACGTACATGAAGAAACTATT
AGAAACTGTGCAGCAAGAAACCCATACAAAAGACTAATACAGTTAAGCCGATTGGAATTC
GTGCGAACAACCAAATCTAAAACCGTCCTCGATCGTCGACATCACTGACGCGCACACCAA
GTAAAGAGGCGAAGAACCAACAAACCAAAATTGAGGCTAGTGTCATAGACTTGTAGGCGT
TATGAGCTGAAGACTAGACCTTGAACACACCAAAATTGAGGCTAGCGTCATAGACTTGTA
GGCGTTGTGAGCTGAAGACTAGACCTTCAACACAGGTGCTTGACGATGTGGCGTGTGAGG
AATGTTTCCGACGCCGACTTGGATCCAGATCTGACGCATTCCACCACTGTTGCCGGGGAA
GAATGCCAAATCCGCCGTGTGAGGAATGTTTCCCACGCCGACTTGGATCCAGATCTGACG
CATTCCACCACTGTTGCCGGGGAAGAATGCCAAATCCGCCGTCGTCGGGCCACTAACCTT
GTACCTGATCCGTCGCCATCGGGCCACTAACCTTGTACCTGCACCAATTTGTTCCAATTG
TCGGTGCCGCCAGAAGGGACGAGAGCTGCTAGACACGGGAAACATATGGCCTACCGATCC
GAACGAACGACAAGCAGACGAGGCAATCGGCTCAGCGCGTCGCTCGAAAAACGTTGTCGT
GGTGAGGAAGAGATCGATGCCACCTTATTCGACGCAGCACGAACGTCACCAAAGTGGCGC
TACTAGAGTGTTAGAAGGGAGAGAGAGGGATTGGTGGAATCCAATGATGAATATAGAAGT
ATATATAGAGAAGTACAGACTTGGAGGGCAAGAAGCCTCTCCTAGAAATAAGGTAGAGAT
AAGGTAGGAGACGAATTATAAATCCTAAACTACCAAATACATGCACACCAAATATATCTC
TAACATACCCCCGCGGTCTTAGCGGTAGCGTTGTGAACAACAGGAGCGTCGCAGACGGTC
AGACTGAAAAGAATAACAGCTGACGGGTTGACTCCCATCGCAGTCGTAGCGGGAGAGTTG
GGGACGGAGTCGCGTCGCAGACACATGGAATGTAGAGGAAGCCGATTAGTTGCTCAAGCA
AGGTGATATCCCTTTGTGCCGTTGTCGAGGTAGTCGTACGAAGAACGTCAAGGTCGATGT
CGAGTCGGGGTGGCCGGTGTCGAGGAAGTCATCGTGGAGCCACAGGTGCAAGGAGGCGGC
GAGTTAGTCATGGGCGTCGTGGTGTCGAAGTAGTGATGTGCGGGGAAGAAGATGTTGACG
ACGCGTCGCGTTGGGTTTGCCAAACCCGGGGACACATCATGGACGAAGACACACATCGGT
GTTGCCAGCACCAGGCATGCGTAGACAGACGAAGTCGATGTTGGCGATGCGCCGCTCCAA
GCTTCCCATGCCAGGGAGCATGATGACCCACAAGTATAG