| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
| No map location |  |
No map location |
Predicted Genes from contig_1561759
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_11750 |
2 |
679 bp |
AK248191.1 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_11750
Contig Sequence (5230 bp)
>contig_1561759 5230 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCCGTTCATAAATATTAGTCTTTTAGAGGTTCCACTACGAACTACATATGGATGTATAT
AGANNNNNNNNNNAGTGTAGATTCACTCATTTTGTTTTGTATGTAGTCTCTAGTGAAATC
TCTAAAAAGNNTTGTATTTAGGAACGGAGGGAGTAAGACACATCTTAATGTTTATTTTCC
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ATTTGAAGTAACTTTGGAAACTGGATTTAGTATAGAAGTTCTATTTAATATTAGTCTGGA
TCTGAGTCTGTACTGGAAAAGGAATTTCTAAATTATCTATTGTCATATTGCAGCCAACTT
TTACCGCATGGTGCTAATATTGTACGGCTTGTAACTGATTACTTCAAAATTGCAAAGTTG
CCTACTACGAGGACAAAAGCTTACAGCATTGTTCAGCTGTTGCTGACCTCCATGGGTGTT
GGTAGGTGATTCCTTTTGTTTGTTTGTTTGTATGCTCACAGTTGCATGATTTTATATATT
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GAAATGAATACGGGGACTGCCTGTTTCCAGAGTCGGCACAGTTTAACAATGATTCCGCTT
ATTTCAGAGTGGAGATAGAACACTAATTCTTGCCTTTCCTTTTTCCTGTTGCCACTGCAT
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ACATGGAATCCTAACTTAACATTCACATTCCCTGCACTGGTCCATCTCGTGTTTTTCTTT
GTTGTTTGACTGTCATACTTCGAGTTGCATCCATACACATGTTTGGTAGATAGCCTTGGT
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GGAATGTCTCTCCATTTGTTAGAGGCAATAGTCAGCAATGCAGTTGGTGATCTGGATGAT
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GTTAAAGTGGCTGCACTAGAAACCTTGGAAATTCTTCTGAATGTGGTATGCCTAAAATTT
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CTCAGTGGCTTCCTTACAGCCTAAGACTCCCACTGACTTTTAGCCTAAGACACAGACTTG
ACTCACTAGCTTACTATTCCTTGCAGACTCCCCCCTATTCCTTGCAGATCAGACTTGAAT
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AGCCATGTCTTTCCAGTCTTCCACCTGTAGCGTAGACCGTAGTAGCTGGTGCCAGCAACA
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TTTGCTACTCTGTGGCATCCACCTTTCTCGCCGTGCTCTCACGGCTCAGTTTGAGTTGCC
CCTCCATTGGAGTGTGAGCTGGGTTGCAGCCTTCCATTCCTCCAAGCTGAAGGATGCGCG
AGGCATAGTGTGCCTAACATAATCTGATGCCATTGCCATCTTGCTGGACTTCGATTCCGA
GATAGAATGACAACAGTCCAAGGTCACTCATCTGGAATTTTGCTTCCATCTCGTCCTTGA
AGCTCTACACTGCTCCCTTGGATGAACGAGTGATGATCAAATCATCTACATACAGTCCAA
TGAGCATGATTTCGTCACCGGTGACACGCTGGTGGATCGCGTGCTTGTGCCCACTATTTT
TGAAGCTAATTTCCTTGAGCGTGCAGTAAAGCTTCGCGTTCCATTCTCGTGGCGCCTGCC
TAAGGCCATAGAGGGCCTTACACAGCTGCATGCTGTTTCCTTCTCCGGTGATGATGAACT
GATCGACTGCTTCACATAGACCTCCTTCAGTTCTCCATTAAGGCTGGTTTTACGTCAATG
TGGTGGACGGGCCACCCCTCCTGGTCAGCCAAAGCAAGCAGCAGACGGATGGATTCCATG
CAAGCCACAGGCGCAAAGACTTCATCAAAGTCAATGCCGTCTTGCTGCACGAAGTTGCGT
GTGACCAGCTGTGTTTTGTGCTTGATCACCTTACCAGTTACATTTTTCTTCAATTTGTAG
ACCCATTTGAGGCCTACTGGTCAACACCCATGTTGTAGATCGACGAGCTCCCATGTCCTG
TTTTGCTCCACCGCGTCCATTTCCTTGCGCATGGCTGCTTGTCATGCTTGGCGTCGAGGT
TGCGCGGCGCAAGTCCAGATAGTGGTTCTCTAATCAGATTCTGGACCATGTGATAGCGAA
CTGGTGTGTCTTTGTGAGCAGCATCTGAGTCGATCATCATCATGTGCTGGTGTTGTGGCA
AATTCTGGTGTAGCTGGAGCTGATGCAAGTGATGGTGGTGCGGCAGGTGAAATACCCACA
TGTCCTGTTGACACAGGCTCAACTCGCCCTGAGTTGGATGCATAGATGGGTGCCTTCGCT
GCGTGACGGCAGATGTACTGGATGTTGAAGTTGCTGCCCAAGTGCGTGCTGTCATCCGCT
GCCCAATCCCAGGTTCCCAGCCACGTTCTACACCGAAGATGACATCTTGGGCAATGCAGA
TGCGCCTTGTCACAGGGTCCAGCAGCCGGTACGCCTCCCACTTTCCTCCTAGCCGATGAA
CACAGAGGGAGAGTTGCGATCGTTGAGCTTATGCAGGTTCCCCCATTCCTTAACATACGC
CAAGGACCCAAAGGTGCGAAGGTAGTGGACAGCCGGCTTGTGGTCTTGCCACGCCTCGCA
AGGTGTCTTTCCAGCAAGGGATTTAGTGGGAGCATGTTTGAGCAGGAAGAGAACAGTGCT
CACAGCCTCCCCTGAAAATTCAGCTGACGTGCTCCTCTGTTTCAGCAGAGCATGTGCCGT
TGTCACCACAGTTTAGTTTTGTCGTTCGATGATGCCATTTTGCTGCGGGCGTAAGGTGCA
GAGAAGTGGTGCTTGATGCCTTCATCAGCATAGTAAGCGGCGAACTCGGTCGAGATAAAC
TCGCCGCCGTTGTCCGTGTGGAACACGCCCAGTTTGTGTCCGCATCAAACTTCTGCTGCT
GTCTGAATTCTTTTGATGACATCAAGTGCGCTGCTCTTGCAAGCCAGGAGCATCACCCAC
ATGTAGCGAGTGGCGTCGTCCATCAGCAGCAAGAAGTAGCGCCGTCCTCCAGGTGTCGCC
GGTGAAACAGGACCACAGAGGTTGCCCATGGACAAGCTCAAGTAGCTGCTGCGCGCGGTA
CCTCGCTTGCCGAGGAGTTGCGTTACATGACGATACTTGGTGATGACATGTGTCACAGAG
CTGCCCCATGTGATCCAGCAGTGGAAGCCCGCGTGTCATGGCGAGGTGTAACATCTTCAC
CAATGCGTTGAAATTGAGATGCCCATACTTCTCATGCCACCGCCAAGCCATGTTGTCATG
GCGGGCAGATAAGACATATTGGCCAGGTCACCCTGTAAGATATAGGAGGTAAAGGCGATT
CCGGCCATGTCTAACCCGAGTGAGTCGACCTTGCTGATCCCAGATTCGAAGCACAGCTCT
TTTGATCAGTCCGCATGCATTCTTGCCGTGGGATGTAGTGGACGCCGCTGAGGGCCTTGT
GTTCGCTGTTCTTGCCAGTGAAGATGATTGTGCCCATGCCACAGATTTTGACGATGGAGC
CATCTCCAAACTAGAAGTTGCCGATGACCGTGTGGTCGAGCTCGGCAAAAGCATCACCGT
GGCCTGTCATATGATTGGTGGCACCGGTATCGAGATACCATCCTTCGACCCGCTTATCAT
TGTCACGTAGAGTTTGGTTGCTGAAGCAATTCCTTTTTTCCATCATATATATAGAGTTGG
GGAATAAATTGAATTTTATATAATGTTATTCATATAACAATAAAATATAGGGTTTAGAAG
TATTTTTCTTGATTGCTCCCACCCGCTCATTGTTGTCACGTAGACTGGTTGCTGAAGCAA
TTCCTTTTTTAAATCACATATATATAGAGCTGGGTAATAACTTGAAATTTATATAATTTG
ATTCACATGACAATAAAATATAGGGTTTAGATGTAATTTTCTTGATTGCCATGCTAAACA
TGCAGAGTCCTTTTGGAATGGGAATATTATCATGAAATAACGCTATGCACTGCAATACCA
TTTATGCCCTGTTTGGTTGCGCAGAATTCGCCGCGGAATTGAATTGGCAATGGAATTCCA
AATCAACGATTTCAATGGAATTCCAGTTTTGCTGTTTGGATGCGCATGGTATTCGTCCCT
AGAATCAAGG
