Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1561505 (6964 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1561505

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11635 1 856 bp AK362753 Available Available None





CDS Structure of MLOC_11635






Contig Sequence (6964 bp)

>contig_1561505 6964 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTACTTCGGCAACGCCATCCAGAGCGCGCCCACGATGGCGACGGTGGCGGAGCTGGCGTC
CAACGACCTGCGGTGGGCGGCGTCCAGGCTGAACGCGAGCCTGGCGGCGTACGGCGACGA
AGCGATACGCGGCGCGGCGGCCGCGTGGCAGGCGGCGCCCCGGTGCTTCCCGCTGGGCAA
CCCGGACGGCGCGGTGGTGACGATGGGCAGCTCCAACCGGTTCCCGATGTACGAGGGCAA
CGACTTCGGGTGGGGCCGCCCCCTGGCGGTGCGCAGCGGGCGCGCCAACAAGTTCGACGG
CAAGATGTCGGCGTTCCCGGGCCGCTCCGGGGACGGCAGCGTGGACATCGAGGTGTGCCT
CGCCCCGGACACCATGGCGGCGCTGCTCCGCGACGACGGGTTCATGCGCTACGTGTCGTG
CCCGGCGCACCTGTTGTGATCGATGCCTTGCCGCGTCCGTGCGTCCGTGCGTGCGCGCGC
GCGCAAGTAGGGCCGCCATGGCATGTCGTCAAGCTGCCTTCCCCGGATGTGTGCACTGTG
CAGGAGGATGAATCCATTTCGGGAAGTGGTGGTGCGCGCGGGCGGACCGTGGCATGGTGC
TCGTAGTGCCTGGATTGACTAGCTTAGGCAGCGACGTGCTGAAGGAGATGGATGGATTGT
GGGACTGGTAACTGGAAATAAAATAAGGTTGTCAAGTGTTTGATATCAGTGTTCCTGAGT
TCTCCTTGTTGATGTGCTAATGGCGTGCGGCTTTCTTTCTTGGTTACTATCAGGTAGACA
CATACATATGAGCTAGTCTCCTAATCAGTGTAATTTTAAACTCAATATAAGCAAATTTTG
TATGGAGAAAAAATATACATTACAAATATGAAGCAAATGGCACCTTTTTATTTTCTCAAT
AGATGACAAACATGTATACAAAAATAATCATCCATGTGTTCATAAAAATAATCAACAAAC
ATGTATACAACAACACATTTTAGCTGATTTCCGTTTGGGATGCAACTCAGAGAGATGTTG
TCCACGCAACAAAGACATATAAAGGAAAGGTGACGACGGTCGTGCATGGCGTCTGAACGG
GTTGCTTCCAAGGTGGCAGGTCATGAAGGAGGAGGGGAAGTAGAGGCGTACAAAGGAAGA
AGAGAAAGCAACAATACAAAGGGGAGTAGGGGAAGTGGCGGCGCACCAACGAGGACATGG
CCAACTGCCATCTACGCCGGGAAGGGGTGAGAGGAGCGGGTGGAGGGCAAAACCCTAGCT
CTTTAGGGTCGTGAGGGGCTAAAAGGGTTTATGGGCCAAATAATCAAGATTTGTTTCCCC
ACGAGTTAGCGGGCCAACAACAACTAATTGGCCTCACAACCTATTAATCGGTCCAACTGA
CCATTTAATCGGTCTGACAGACCATTTAATCGCCTAGCAAGTTAACACGATGAATATATG
TTATTTGATTTGGCCACCCTATGAGTAGAGATTAACTGGCTAGTTAACTGATTAATCGGA
TGAATTCTTGAATAATGACAATGTCTATATATGAAGTGTATATCGTATGTGCTTCGGTTG
GCTCATGTTGTTGTGTTGTACTAGTGTCCCAATGACGCGATATCAGTTCAATATTGATAA
TTCCCCATTTATCGAAGATACGCATTGATGGAAAAGCTATAGATTAACTATTCTAACAAT
CATAGCACAAAGATTATTATCTACAATACTTGTGGCAGGTGAATACTGTATTACGTTGGC
AATTTGATTGAAAATAGGCATAGCAACGAGTAGACATAAGGAAGACAACTAGAGCCAATA
AAACTTGGTGGATAGTTCTATTTGTTTATTCATGACGTCAACTTCATAATTTATGAATAA
CTTGATTGTGTTCCATATTATTGAACAAATGTGCCCACGAAAAACAATCTATAGACTAAG
TATTTACATGATCATAGCACAGAAAATATTGTATATAATACTTTTGTCGGGTTAATACTA
TATTAGGTTGACAATTTGTTTGAGAAGGATTCTTGCAACCAGTAGACATGATGGAAGGAA
GCTGTCTAGAGCTAATATAACTTGGTGGATAGTTTTATTGTTTACTCTTGAAGACAACTC
CATAATTTCTACATAACTTTTTTTTATTTCCCATTATTGAACATATGTGCCCATAAAAAT
ATATATAGCCTAATTCATGGTCATAGCACAAATATTATTGTCCACAATACTTTTGTCGAG
TGAATACTATATTAGGTTGACAATTTGTATAAAATAATTGCTACAACTAGTAGACATAAA
AAAGGAGGACATCTAGAGCTAATGTAACCTGGTGGATACTTTATTATTTATTATTTGCCA
AATGGTGGATTGATTTATTGTTTACTCCTGAGGTCAACTCAATAATTTTTGTATTCCCCA
TTATCAAACATATGTGGCTATGAAAAAAAAACTGTAGACTCAATAATTCATGGGTAAATT
TTGTCCAGTGGTCACAAAAATTATGTTCTATAATGCTTTTGTCCAGTGAATACTATATTA
GGTTGACAATTTGTTTGAATATAATTTTTATAGCCAGTTGACATGAAAAGGAAGACTTCC
AGAGCAAATATAACTTGGTGAATAGTTTTACTGTTTACTCTTGTGGTCAACTCCATAAAT
TGTGTATAATTGTTTTTTTCTAGGGGATGCAATATATGACTCGATGGAAGGTGGGGACGT
GGGGGGAAAAAAGGGGAAAGAGAAAAATGGTGGGAATGTGCAGGTCCAGAAGAAGTGTGC
GATCGCGATCCAACGAGGAGCCAAGCTTTCAATGTTAATGCTAAATTTGGAACGTTTCCC
AAAAAAAAAATGTCGTCTTTGTATTGCTGTCCAACTTGCCTTTGTTTTGTTTGCATGGCA
AAATATGGTCACTGTATGTCGTTGAAATGCGCCAATGTGTTCACAGATGGAGTAGCCCGT
AGGGCACATGAAACACGCTTTCTTTAGGTCCGCACATGAAACAACGTTGGGGAAAAAAAG
GTTCGATGATGACAAGTGTGAGAAAAAGGTAGTCACGATCGTGTATTCTCGAGTTTTCTT
TTTGTGGGGGTGTATTCCCGCACCGATTATTTATGAAAAATGATCATTACCAACCTACTG
ATTTTGTTTAGAAATGAGTCGCTCCGTTCGACTGCCACGTAACCTGTCACGCGTCGTCGT
TTCAGGCTAGCCCAGCCTTATCTTCTCGCCTTCTCGACTACACGTTCCTTCCCTTGTTCG
TCTTCCTCCATCACCCCATCTCTTACCCAATAGCCATCTCCCATCGGCGTTGTGTTGGAT
CTCCGTCAACACTGCAATGGAACTTCGCCGGATGCGTCGGTGCTGCGTTGGAGCTTCGTC
GAACGTCGACGGTGCGCCATAAGAGTTGCAGTGGAGCTTTTATTAGTGCAACATCGCTGC
GTTGAAACAGTCGCGTGGCTACTTCTGCCGTGGCATTGGTGTCATCCAACGGCCATCGGT
GTGTCGGTCGGACGCCTACCTAGCCGGATGATTTCTCTAAGAAATCGTTCGGCAGATTCA
TAGGAATCCCCATTATTTATCGCCTTAAGCCATATCGAAAGGGACCTCCTATGCATCACT
CGCTGCGGCGAACTGCCGAGCGAACGCACAGGGGGTCGCCCAACTTGGCCGGTCTAGTTT
TTTTTGTCTTAAGAAAATATGATATTTTCCTTTTTTTCAATTTTTTGTTCCTTTTTTTCT
TTTCTGTTTATTTCCTTATCTGGTTCACTTTTCTTTCCTTTTCCTTTCTCTTTCGAATAT
GAAGCAAAACACATTTTTTGAATTTGAAGAACATTATTTGAAAATACAAAATATTTTTCA
AATTCACGAACAATGTTTGAAAAATGACAATTTTTTTAAATTGCAAACATTTTTTTAAAA
GCAAGGACATTTTTCGAAATTTGAGAACAATTTCCGAACATGAACTTAGTCTAAAAATGA
ACAAAACTTTGATATTTTAACCTTTTTTTGGAAATACCGAGCATTTTCTTAAAATACCAA
ACGCTTTTAAAACCCTGAACAATTTTTGAAGTGATGAATGTTTTTGAAAACGGCAACTAT
TTGTAATTTAGAACACATTTTTTAATAAAACACTTTTTTAGAATTTGAATAAATTTTTTA
AAAAATCTAGACTATTTTTCGAAAATTCATTTTTTTTTTAATTTATGAACAATGCTTGAA
AAAAGACAAATTTTTAAAATTTGGAGCATTTTTAGAAAGCAAGAACATTTTTCAAAAATT
AAGAACAGTTTTCAAACACAAAGTTGGTTTTAAAATTGAACAATTTTTTTATATTGTGAA
CAAAATTTTGAAATAACAAACATTCTTTGAAAATGCTGAACATTTTCTTAAAGTACCGAA
CAGTTTCTTCAAAAATCAAACATTGTTAAAAATCCCGAACATTTTTTGAAGTGATGAATG
TTTTTGAAGAATGGCTACTATTTAAAATTTAGAACATTTTTTAGAAAAGAAAAAGATTTT
TTTTTGCGTTTGAAGAACAATTTTTGAAAATCCACAATATTTTTAAGAATCCAGAACATT
TTTCGAAACGGAAACAGAAAAGAAAAATGAAACAGAAGAAAGAACCACCGTACTGTTAAG
TGGGGTCGAGGTGATCGAAGTGAGAAGGTGATGTGATGCTCAACCCAATAACTATGTTTT
CGAGTGAAGACAATGAGAGGAAATCTCTTCGAGAGTTGGTTTAGTGAGCATTGCTTGTAG
CCCAAGTAATGTTATCGTGTGAGTCTTTGAAAACCGACTGTAATGACACGTGTTAGTTGG
CCATTGACCGAGGGCCATTTTGTTCATATCATGTCGGTTTGTGTGTTGGATATAAATAGC
CCACCCCCTCCATTATAAGTTGGTGGTTGCTCAGAGTTAAGACAAAGTTGTTCTTGTTTT
GGAGCAACCCACCTTGAGGACATTGAGAGAGAAGTATCGTGCAAGGACAAACCCAAACAC
CTACAGACAAAGTGTTTGAGCATCACCGAAGTTATCCTGTTCCGAGTGAATCGAAGACTT
GTTACACTTGAAAACTATGATCTTTCAAACGGTTAGGCGTCATGGTATAGAGCATCCAAG
AGTCATTTTGGATTGTCGGGTGATCGAGTTTGTACGGTTTCGAGAAGTCTCCCGTGGAGA
CTTACCTAGGTGATTGCGCGAGGTCTAAGTGACCTTGTCTCAAGGGGAACAAGGTGAAGA
CGAGGTCTTTTGAGCTGAGTCTCAACCTCCCTAACGAAACGTACAGTTGTCACAACAACT
CGAAGTGGTCCAATAAATCATGAGTCTCCATCAAGCAACTAGTTCTATATTTCCACTCAT
TTTCTTGTTACTTAGTATTGCGAAGCTATTGCTTGATTGATCTAGTGTGAAGACATTCAT
CGAATACATTCAACTAATCTGCATTGTCTTCGTACTACTGTAGTTTATCTTTGATACACT
TATGTTTGTATGTTGACTATGTTGTACATATCTGAATGTCTTCGTAACTTTGTATGTCAT
GCCTAGATCCTTGAGTGTTATCACTATCCGATCCTGATTCGCACTTCGAAGGCATTTATT
GTTTCGAAGCTCTTCATAAAAATCATCTATTCACCCCCTCACCCATCTAGTCGATAACTA
GCCCTTTTAGTGTTATCCTATGAACTCTCACAAACACATTAATCCCCCAACCATATTTGT
CTTCAATACTCCAAAACAAACAAGGGATGACACTGGATGCACTTACAACTTGTTCAACAT
TTTTCAAATATTTTAATATAATGTTTCATTTATATATAGGACGTCCGTTTGGGGCACCTT
GTCTAGAAACCGTTGGATGACACTAAGATGTGTGCACGTGTAACTAGTATTAGTACTAAT
GAATAAATTTGTTAGCTTTTTATTAGGAAAGAACTATTGCAAATTATTGCTTGATATGGA
CACTTAATGCTCAGATTAGATATGCTAGAGAAAATCAATAATAAATGGCCGGTTCATGTT
TTAATGGCATCCATGTCTCATGGTACGTGCATTTTTTTGCATATGGTAGAAGTAGTATAT
CTTCTGATACATTCTGGTTAGCCATTTTCTCTTTCTTCTACGTGCACTTTTTTATTTTTT
GTAGACTACCTAATATCTTGAATAAATCACTAGATATACACATACATAACCCAAAATATA
TTATGTTTTGTTTATGTACTCGAAATATATTGGGTATATATATTAGATATCCATATTAGA
TACCTTATTATGTGGCCGGGTATTACGTAGTCATATTTTACTTTACGTACATACATCGAC
TTGGTATATACACTATTTTCCAAGTTTTTTTCACGTAGCCAGGTAGATAATCGCATATAC
ACATGGGGTATATGGGTCGTCCGAGTGTGTACAATTTAATGCTATGTTTTTCCATATAGC
CGGGTATATGGGTTGACCAAGTATGTACAATATTTTCTTATCATTTTTCACATGAATGGG
TACATAAGTCGACCGAGTATGTAAAATATTTTTTTACTTTTATCACACAACCAGGTATAT
ACGACGATAGGGTATTTACTAAATTTTCCAACGCGAAAGTGTAGGCTGAAATTTTTTAAA
TTAAATTTCTGTTAAGGATCTTAGAATGTGGTGTCGTGTGGGTATATATGTCAACCGCAA
TAAGGAAAGAAGTATCTCCCTAATTTTGGACGTGCATGAACTACATGACTGCTAGAGGGA
AATAACATGTATGGATACTCTACGTATATGCCAAACTAATAAAATCATATTTCCTAGTAC
CTCATATATATCTTCATCTTTTTAGGAACGTGGTATTTCTTGTGGCCGGGGTATGTAGAG
TACGTGCATATATCATCTTATTAAAAAACAAAGGTATAGAAAAATATATACACATTGGGT
ATGTTGTTTTAAGTTTGTTGTAGGTGGATAAGCTACTTGTAGGTACTCCCTCCGTAAACT
AATA