Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1561296 (7245 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1561296

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11531 6 2066 bp MLOC_11531.1 Available Available LOC_Os01g22954.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13101.m02433 protein serine carboxypeptidase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_11531






Contig Sequence (7245 bp)

>contig_1561296 7245 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTCAACCCCCAGGTTTTGAAGACCCAAAGCATCCTGACAAAGTCTTTAAACTCAACAAGG
CTCTCTGCGGCGGCCCGCCAAGGGTAATGGCTCATTAGGTTCAGGCGTCCTTCAGCCAGG
CCAAAACGGCTGAGTGGGACCATCTGCTTGATGCCCTACCTTAGGCACTGCCGAATTATC
CAAACAGAGTGACCTCGCGACTTTCCATGTCTAAGGAATACTCGGTTAGCTCGGCATATC
AGGCGTTGTGTTGCTCCCCCATCGTCCCTTGGCTGGCTCTGTTACGGAAGGCACCCCTTC
CCCTCAAGATCAAAATATTTGTATGGAAATTACTCCGTGACCGGCTCCCCTTGGGGACGA
AGGTAAGAAAGCGGCACGGGCCTGGGGATGGCTTGTGCCCCTTATGCTCGGTGCCAGAGA
CTATGACCCACATTATTTTCTCCAGCTCGATGGCAAGGGCCATATGGGAATTCATACGCA
AGGCTCTTGGGCACGATTGGGAGGCCCAAGACCTCACAAAGTTTCTCTAGAACAAGGCAA
CCCAATCTAGCCGCTGTCGTCGGCTATGCTGGTTGATATTTGCCGCAATGTCGTGGACCC
TGTGGACCACCTGTAATAAGACGGTGACTGAGAGGATCTTTCCGAGGGAGGCGTCTGACT
CTTTCAAACTCCTTGCTTTTATGCAGCATTGACATCCACTCTCTAGGCAGCGAGACCGGG
GTCGTCTTGATGGCATGCTGGATGCTCTTCACGCTTCGGCGCGTCGACTGGTTTCACAGT
AGGGCTGAGGCGCCCCCGCCACTAGGTGGTTTTTTTCTCATTTCTTTTTCTTTATTTGGG
CGTGATTGCGCCGATGCCCAGCCTGTCTTATGTGGTTGAACTTGGACGTTATTGTTTGGA
TCGTTGCTTTATCTATAAAGCGGGGCGAAAGCCTATTTCGAGAGAGTGGTCGAAGTAGCC
CGTGCAGCCGCCCCGGGTCACTGGGTGCATTTGTGGATCTACCATTAGGGCGAGCTGCGA
CGGCTGCCCTAGGTCTCCGGCGACGGAGCACCGACCCCCGCTACCTATCCTTCGTCCGAC
CCTCTCAGTTTTCCTCCGACAGCTAGCAGGTCATGGCGGCTCGGCTACATGCATCTTTCT
GCGAAGGGGTGGGTGACTTGAGGTTGAGGGAGAGAGGAATTGGGCTTGGGCTGGAGTGCA
CAGACTAAGCTCGAGCTATCGGGCCCAATTTAGATCTCACCAAACGAGTACACAACCACC
AAACTATCAATCTTGTCTCATAAAAGACTATCAATCATGTCCTAGAAAAACAAAAACAAA
ACCATTCCAGTATATTGACCAATAAAATTTAGTATATTGATAAAACCAATCCAGTATATT
GACCAACAAAAAACAGCCATCAAGCGATTGGACTTTAGGTTTAGATCCAATTGTTTGCCC
CCGTACACTTTGATTCCTGGGTCCGTCATTGGCCGGGAGCTAGCTCCGCCCCTAAAGTTA
ATGTCTATCTGAAGGAGCTGTGTCGCGAGTAGGGATGCAAGGTGGCGCCCGATCTGCCCC
GCTCCATAGTATAATCAGCTCAGGTTAGATGTAAGTTTCTGTAGCGATTTGATTTACTTT
TGAACTAATTTCATGTTTTACGGGCTTATGCGGGACGCCGCCCTGCATCCCTAGTCGCGA
GGCATCTGTCCTCGAATTTTTCTTTTTGCTTTTTTTGGATTAATGTTGTTTGGTTGCTGG
ATTTTACATTCTTAAGCTATGTGCGTCGAGGCTATCGAGAAACAAAACATGCAGTTGTAC
AATGGTACTGTTTTTCATTTAAGAAAAGAAAAGAAGAGATAAAACAGAAACTGCAAATCC
CAATCTCACTTGTCTCATGCACGACGGTTTCTACTGTATGCTCGTCCAACTTGATGAATC
GGTACGTGTGACCGTGTCAGCGTTTAGTCAGTCACAAGGCAAGCCGCCAAAAGCATCAGA
CGCATACGCCAACAACGCGCAGACACGAGTCGAAGATGCCCCTCGGCAAGGCTGCGGTGC
CGCGCCGGTGCGGCACAGCAAAATAAAATTCGTTATCCCTGGTTCACATGCAGCCAAGCG
CCAAGCCAATGGCCTCCTCTCACCCCCACCCCCAGCTCTGAGCTCCCTCCAACTTCACAT
GATCTTCTAGTGTGATCTCACTCTCACACACATTGAGTTGTGCCCAACCCCTCTCTGCTC
TTGCTGTCCTAGCCAAGCCACTCACTCTCACATTTGCACATTCTCATGGCGGCAGCAGCA
GCGAGCCAAGACAAGCAGCGGCGGCAGCTCATCCTTGCTCTCTTTCTCCTCGTCTTGGCC
TCCCGGAGTTGGCGCTGCTGCTCGGCAGGTTACGGTAGTGAGCAGGAAGCTGATAGGGTG
GTCTTCCTCCCCGGTCAGCCAAGGAGCCCGCCGGTCTCTCAGTTCTCCGGGCATGTCACC
GTCAACAAACGGAATGGCAGGGCGCTCTTCTACTGGTTCTTCGAGGCTCAGTCACAGCCC
TCATACAAGCCTCTCCTGCTCTGGCTCAATGGAGGTTTCTTACTTACCTCATTCACTTCA
CTTGTTGTTGTTTTTTACCTTTTTTACTTCACCTTATTTCGGTTGCTGCTTGGGGTGAAA
CATAAAAAACTTTTTTGTTCCCTGTACATGCATGCAGGACCAGGCTGCTCATCAGTTGGA
TACGGAGCTGCTTCTGAGCTAGGACCTCTCAGGGTGAGCAGATTTGCAGCAGGGCTCGAG
TTCAACAAGTTTGCATGGAACAAAGGTGTTGCAGCTTGCAAGCGTTGTTTGCACTTGTGT
GGATTATGAATAAATTTATGATTATCCCAATTGTTCTACGTGGAAAAGAAAATCTGAATA
TTGGTGTTTTTCTCGATTGACTCTTGCCAGAAGCCAACTTGCTCTTCGTGGAGTCTCCTG
TTGGGGTTGGCTTCTCCTACACCAACACATCCTCTGACCTCACCAACCTCAATGATGATT
TTGTAGGTAAGTGAGGATTCTTTTCGGGAAGTGTGCTTGCTTTTCATAACTGTTTGAGGC
GTTTTGAAATGTTCATCAATTTCCATTTTCTCTTTTGTATAGCTGAGGATACATATAATT
TCCTGATTAATTGGTTCAAGAGGTTTCCGCAGTACAAGGACCGGGAATTCTACATCTCAG
GAGAGAGCTATGCAGGTAAACGTTTGCATCAACAAGACACTTGTTCTTCAGGCCTTGATT
TCCAGAGTTGATCTTAGTAACCTGCAAACTTAAAAATTTTCAATATAGTTGTCCTACATG
TCTGACAAAGTCGTAAAAATAATAAGTCGACCTGGCCTTTCAAATCAGGTTCTTTACCAA
TTCTTATTTATTATTATGTAATCCATAAATCATTAAATTTAAAAGAATTGGGCAATAATC
GATGTTAAAGCATAGATGGGAAAATTTGGTGGCATGGCCCTTTATATTGGTTCTGCTGGT
GTTCCTGACATGTCCAATGGTCCTATTAGACTTCTGTGAGTATTTCAGACATGGTGCAGC
AAGAGATGTACTGCAATCCATTTTGTAGATCACTGACGAAGAATTTTAAATTTTATACAG
GTCATTATGTGCCACAACTTGCTGACCTTGTCTATGAGAGGAACAAAGGCAAGAAGGCCA
ACACATACATCAACTTTAAAGGGTTCATTGTGAGAATATATAATTTGGCAGCTTCATTTG
TTTATATTGCTGGTCTGGCCTTGTTCAGTTCTGTTTGAAAATGGGATGATACAATGTATT
GTTTTCGATAGTTGACAAGTTTGAAAGAATTCATGTATTTCCTGTGTTTATGTAGATCAA
AAACATTGTGTACTTGTTTCTGTGAAAAATACAACAATCTTGGGATTTGTTAACCTTCTG
ATGAATTTCCCTTTTTCTATAAATGTATATATTGCTATATTTGAAATTGTGAAACATCAT
AACATTTCTATTGGCCCAAATGTAGGTTGGCAATCCATTAACTGATGATTATTATGACTC
GAAGGGACTGGCTGAATATGCTTGGAGTCATGCAGTTGTATCAGATGAAGTTTACGATCG
CATAAAAAAGGATTGTGATTTTAGAGCCTCAAACTGGACCGATGATTGCAACAAAGCCAT
GAACACCATCTATGGACAGTACCAGTTGATCGACATATACAACATTTATGCGCCCAAGTG
CAATCTTGGACAAACATCAGCAGCATCTGTTGTTGATACAGAACTCAAATATAGTGAAGA
TGTAAGGGACAGATGGTTTAAATTAGAACTTCGGCTTCTGAATTTCTAAGCGTTAATTTC
TTTGGCATGGTAGGAACCTTTCAGGAGGAGGATTAGGTTGTTCTCGGGATACGATGAATG
CTACTCATCTTATGCCCAAGAGTACTTCAATAAGGCAGATGTGCAGAGAGCACTTCATGC
AAATGTCAATGGGATGTTGCCTGGGAAATGGCAAGTTTGCAGGTGATTTCTGTCGATATT
TTCATTTTTTTTATCTATGAAGTTTTAATCTAGTAGTTACAACTCTGAGTTGAGTTGTGT
CTTTCAAATAAGCTTTGAAACAGTTAGATAGTTTTATGTGATTCTACTTTGTGTCATTAA
CATTTTGTCCAGGGACTCCAGACTAATATCAAATGGACAACTACCGAGTCAAATTTAGAA
ATGCTCAAAACAGATCATTTTACACGTGGAGAAGAAATTGGGCATGTTTTTTATGAATTT
GACTTATTTCCATTTTCATTTACCATGCAGTGACTCCATTCTGAAGTCGTACAACTTTTC
CGTACTTTCCATTCTACCAATATACTCCAAGCTCATCAAAGCAGGACTGAGAGTCTGGCT
CTACAGGTGTATTTCTGCACCTTGTACCCTACCACCATGTGTTAGTTCTCATATGCATTC
AAAGCAGCCATTATTTGTTACTTCCATGTGCATATACTGTCCTCGAAAATTACTTGTGGT
AACCTTAAAACACATTTTTTCTGTTCTCTGACGGCTTAAAAGTCTTAGAATGCATTGTCT
TTTCATTGGCGTCTTAGAATAGGTGCTATTTTGGTGTTCGGCAGTGACCTATAATTTTGT
GCATGCAGTGGAGATGCAGATGGCAGGGTCCCAGTGATCGGGTCACGGTATTGTGTGGAA
GCACTTGGCTTGCCTATCAAGTCACAGTGGCAACCATGGTACCTGGACAAACAGGTTAGA
AATTCTGAACTATCAAGTGAAAATTCTCTGGGGCTACAGTGATACTGCGACTTAAGTTAG
TTTCCGAATGTAGTCTAGACTCTAGACTCCACTGGCGCTGACGAGAGAGTCATTTGCATT
GTAGGTTGCTGGAAGATTTGTGGAGTACCATGGTATGACCATGGTGACAATAAGAGGGGC
TGGCCACTTGGTACCCCTCAACAAGCCCGCAGAAGGGACAGCGCTGATCGACACATTCCT
TCTTGGTAAACAGCTTCCTACACACCGGTGACGGTTAAACTTGGGGTAAGGTGAAATCGA
CCTATGACCCAAAAGGAGCTCAAGGAGAGCTTATGCAGGAAGCGTAACACAAATAACGCA
TGGTTTCTTCAAAGATGGGATATGCTGAATTCTGGGGCCGATCCTTTCCGAGGATGAATC
TGTCTTAAAGAGAACTGTTGATGTCCCTATTGGAGATGCTTGGTATATTTTTCATTGATC
AGCTGAACATGTATTGATCAAATTGTGCTAGGGTTCAAGAAATGACAGGTGGCACATACT
AATCTTTGTTAACGGTCCAGGCTTAAATTTATCTCCTCAAAAGTAAAAGTAAAACATTAT
GAATCACTGTAAAGGTCACTCCTATTAGTTGAATTTGTTTTGAACCACTTACCATACTCA
TGTAGTCGGTACAGAGTTCATATCGAGCATGTATGTGCAAGTTAATTTTATGGCAATTGA
AATAATGTGACTACATATATGCCACTTTAAACGTTAGCCAATTCAGCTTATGACATTTTG
GCAATCTAAATTTGATTTTCTCAGATAATAGCCACATGTAAATGATTTTCTTTTTGAAAC
TGAGGTATAAGATTTGCCTCGCCCATTAATTAAGAAGGGAAAAGAGTTTGGTTTACACAT
GCACGTGACGATATATGCACCCTAATACCAGGGCCGTCTCCAGAAATTCGGGCCCCGGTG
TGAAATGCAAAAGGGGGCCCAAAAATTTACAGAAGATCGTGTAACTAAAACCTAATATAG
TTAAACATAGTCTCGGATAATTGTATAATTGAAATGAGTGTACTATTTAGAAATATATTA
GAAACTAATGCTAAATGAGTGAGGTAGTACTAAATTGATCTCGCCTTCTTACAAAAACGA
TCATCCGTGTTGGATTTTTTGAAATGAAGATATCGTATATCTTCGTAACTAGTTTCTTCA
AGATATCATTTTCCACTGTTATTGCCATCAATACACTCGGTCTTTCTTGAAACAAAATAT
GCAGTATAGCTAGCCAGCACACAAGTACTCGTATAAAGAACTAGTACTAGAAATGGAAAT
TGGATTACGGGCAGTGTATCACATTGATCCTATTAATTTGATTAGAACCAAGTACAAGCC
TAATTGAGTAGTAGTACCATGCTAATAAGGATTGCGTTTGATTTGGCATGAAAATACCAA
AAGAATCAGAGAGAGAGAGAGAGATTGTATAAAGAATCAACTTAATGCAGTGTTCATCGT
CCATCGATTTTGATTAAAAGCTTATGACTTACGGCTTAATTGGGATATATTTGGGGACGA
CTGGGTGGAGGTGCTGCAGTAGCAAAGCCAGCGGCAACGGCCACATGCACGGCGGACTCA
CCAAGCCGACTGTAATGGATCTCGTTGCCGAAGCAGCCGGCGGCGGAGCGGCGCCTCGCT
ATTCTGGCTCGAACACGAGTAGGCCTTCCTTCTTTCCTTGATCTCAATTTCTACAAACTG
GCCCAAATAAAGTGGGGGGCGAATACTGGGCCATTACTCTGCCCAATACAAAAATCATCA
CTCTCCCGGTATTATATGGAAAATCCTATATTTGATGCTTGCTGCGTTAAAATGTCGGTC
TTTTGCCCTGGCCATAGGTTGAAGCGAGCGGATTGCTACCCCACTCAGACAGTCGGTTTT
GGGAATATTCTAGAGTTTCTCAGCCGGTTTTGGAAACTTTTTAAAAGATTTCCTGAAACG
GTTTTACTTTTTTTTTTGTTTTTTTCTTTGTTCTTTTTTGTTTCT