Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1561237 (5114 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1561237

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11494 2 2902 bp AK376294 Available Available None
MLOC_11493 1 693 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_11494






CDS Structure of MLOC_11493






Contig Sequence (5114 bp)

>contig_1561237 5114 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTGGGCCGTCTTGTCCTAGTTGGCGGAGGCTGCATGGAGGTGCCACCAGCAAAGCCGGCT
GCTCCAGCTCTACCGGTCGCTTCTGCCGCGGCAACTGGGGTGAGCTCTGATGAGGATGAA
GATATGGGGATGGAGTTGTAGAAGCTGCTGGCCTTGGCGAATGGCCCCCTTTTCGGTGCA
GTCGAGCTTAGCCGCCGGCCACACTCTATGTTGTGGGCTTTCGCTGTTGATGAAGACGAT
GAGGTGCTGGCACCCCAGACGCCGCCAGCTGCCACCAAGGCCATCAACCCCGACTTTGCC
GAGGTGTGCGTGAGGCATGGACCAGACACAAGAGGGGGATATCAGGAGGTGCTGCCGCGG
CGCGGTTCGCGGCATTCGGCATCGCCGGCCCTGACATTGGTTGCTCGCCCCATTCCTAGG
TGGCTCATGGCAAATGTTGCAGATGCCTTGCTCCTGGGCATCGTGCGGCTGTTTGCAGAG
ATCCCCTTCGGCGCTCCCGCTGTTTTGCGAACGGTCATCTTGCGTGTGGGTGCCGCAACC
CCTGGCATCCACTCAGCTCGCTTGCATGCCTTGTCATGCCACGCCACAACATGGAACATC
ATCAAGCTCCGATTTGTTGTGAAGGTCCGATGAAGTCCACGCTCCCCTCCGAGGGGCTTT
GTCATGGGTCTTGCGCGTCTGTCGTTTCTGGTACCACTGGCTCAGCTGCCTCGTCTAATA
TGGATCTATGCTCCACTCTAGCAGATCAGTCCAAGCTGTTGCAAGTCTTGTTGGCACGTG
TTGGGAGCTTTCTGGAGCAGGCGGAGGATACTTTGGTCAAGCTCTCCCTCGGGCCAACTC
CATTGGCAACTGTTCTGACACCGTGTTCTCATGTTGTTTCGTGTGTTGGTTCCACGGAAG
ACATGAGGACAGAGCTCTTCGGTTGTTTATCCCCTCTGTTGGGGTCAGTTCTTCGTCATT
GTCTGCCTTGCCCCTTGTGTCGACTACTGCTGTGGGCGAGGCCATCGCCATGGTCGGCGC
CCCATTGTTGCAGATCATGCCCGAGCTTCAACAACTATGTGTGAGACCTGCTTCTCCTTG
TGGAGCATATGGAGGTCGATTCGTTGGCGATCTCGTGTGAGGGTCATGATTCACCTATGT
CATGTGAGCAACTGGAGGTGCCTGAGTCAATCGTGTCAGTGGTTCCCGTGGGCGATGTTG
TCGTGTCGGTGGTTTCTATGGCTGATGATGTTGATGCGGTCGGTATGTTGGCGCCTGACC
TTTTGGAGCCCAGCCGGCCGCTCGCCTCTGTGGACCATGAAGGTTCTGATGTTGCGGTCA
CCCACTCGCACGTGACCATTGGGAAGGTGGTATCTGTGCGTGACAAGGTCGATGAGATTC
TCTTCGAGTTAGAGGTTCACAGCTTACTCAAGCGTTTGGAGGCGGTTTGTCCTGGATCTG
GCAAGACGATTGTGGAAGAGGCTCTCATCAAGAGCAAAAGTAAGACGAATGGTGGTGCGG
GGAAGGCGTCTGCAGCTGCTTGATGGATGATCATCAGTCTCTTCGGTTTGACTTGTCTCT
GTGGTCTTGGTGGTGCTCGTGGATTTCGGCAGAGGTACTCCCGTTGGTTATTTGTTTGTG
ATGTAGCCGTGTGGAGGTTGGTGGTCGTTATGTGTTGGGTATGATTGTCGGGCTGATTGT
GTGCTTATGGGGTTTCATGTTATGTGAGTAGTCCTCATGTGGTAGGTTTGTATCGGTTTT
CGCCCGGTTTTCCATTAATTAACTGGGCAACTCTCTTCTGCTTAATTAATCGATAAGGCA
AATCTTTTGCCTCCGTTTCGAAAAAAAAAAGTTCTTTTGACTTTGAGTGTCCGATACTGG
ACTGGTGCGCTTCAGTATGCCGTCGCCAGCATAGAGAAATGTGTTTTCTATGATGAGTAA
CGTGTTACAGCATTATTTTTCTAACCATCTGAGAAGCACAGGTCACAATAGTACAGTTTA
TTCATTGGCTAACCCAATTATAAATGGGAACTAATGATGATCTTCCTATAAGTTTAGATG
GTGAGGCCTTGCTTGATGATTTTATATCTCCGGTGAAACAAGATTCGATAGTTGTGCAAA
GGTTTTGAGTTTTTGGTCCAAACTGGCCCTGTTGAATTTTAGTTTCTCAATTTTCCTCCT
TTATTTGATTTCTCTTATGTACCTTTTGGTATGGTATAAAAACACGTCTACGTTTGATGG
TGCTTTTGTGGTCCTGCTTTTCTTTATTCTTTACAATAGCGTGCCTGCAAAATTGTTGAA
TCAATCAAAGTGCGCGTCAATATGCGCATGTATGCTGTTGTTTCTTGTCAGTACGTAACG
TCTGTCTGGTGATTGTAGCTTACCTTTTCATGTTTTTTTCTACTCATAACTTTAATGAGA
TTTTGTTGTGCCTTTTGATTGCAGATGTACTATATAGACCATGAACTCAGTATTGATGAT
TTTCTTCATGGGTCAAACCCAGATGGCCTCAATAACCTGCAAGGGACTGGTCAGCCGGAA
CATCAACAGTTCAATCTGCAACATTCTAGTAATTCATATGCTGATGCAAATAACTCTGTG
CAAAGTACTGGAGATGTTTTTTTCCACATGTCAGACTTGCTCACAACAGTCTGCCCGTCA
CCTTCTCAATATTTGGGGCCAAAATGTGCACTCTGGGATTGTGGTCGACCTGTGCGAGGA
TCAGAAGAATGTCAAGACTACTGCAACCCGTATCATGCTGGTTTGGCTTTGAATGATGAT
GGTCTTCTAGGGACAAGGCCTGTGATGCGACCAAGGGGTATTGATTTGAAAGACGGGCCC
CTATTTGATGCTCTTTGTGCAAAAGTCCAAGGAAAAAATGTTGGTATTCCTGTCTGTGAA
GGGGCTGCAACGTCAAAATCACCTTGGAATGCACCTGGTACGTTTGGTTATTAATTGTTA
GCCTTTTAGGTGAACACCGGTATCAGCAAATTCTTGTTCTAATTGTTGGTTCCCTGCTGT
TGTTGCAGAACTTTTTGATCTTTCTCTTCTTGAGGGTGAATCTCTTAGGGAATGGTTATT
CTTTGACAGACCAAGAAGGGCATTTGAGAGTGGCAACCGCAAGCAAAGGTCATTGCCAGA
TTACAACGGCCGTGGATGGCATGAATCAAGGAAGCAAGTGATGAAGGACTTTGGGGGTCT
GAAGAAATCGTATTACATGGACCCACAACCATCCAGCACCTATGAGTGGCACCTTTTTGA
ATATGAGATCAATGATTCTAACACTCTGGCCTTGTACCGGCTTGAGTTCAAGGCTTCTGA
TGCTAAAAGGAGTGTTAAATCAAAACTGGGCAGCAGTTCACTCAACGAAATCCAGCAACA
AATGGTCAAGCTTAGTGCAAACAGTCCGGTGGACAGCAAGCGGGGTGCTAGGAGCAAGAC
AAAGGCTAGTCAAAAGGACACCACTGTGAACACATATCCAGCTCTCAAGGCCACCAATCA
AGCGGGTGCTTCAAATGCTTATGAAACAGTGCCCCTCAACATCCCCAACCAGGCCAATGC
TTCCAATGCTTATCAAACAGTGGCTCCCAACATTCCCAATCAGGACAGCACCTCGAATGC
CTATGAAGATTCATCACAGGTGGACCCAATGTCATTTCTTAATGACAACGTCGTCTATGG
ACCTCATCTTCCATATGGTTACCCCGACGGAAAAGGCGACTTCTACTGGAACCCCACTAG
CGGCACCTGAAGATGCGATATGCCAAGCTCATGCGCTCAGACAAATTGTAACACATCAAC
TAAAATTTGGGGCTCAACACTCTGGCCCTGCAGTTTTTCTCAAGTGTAGGCATCTTGGAT
AGATACCATGTTTGATATGCTGTACTTCTGACTGTAAAATATAGTCCGGTTCTTGCCTAT
CAGAGCCGAGTTAGAGTATCTAGGGCATCTGTTCTTCAGAAGCTGATGCGGCTGGACCGT
AGCAGCGGAGGATTCACAAATTCAGTGGGATCTGTTCTTCCCCCTTTTTCCCCCTTACAT
GTGTATATATGCTGAGAGTGGTCGAGGATTCATATGATTTGCGGAATCCCAGGTTCACTT
GCGTTTCAGATGCAATATTGGTTACAGGTCCAATCATTTCAGGCACCAATGTAGCCTTCT
CTGAAGATTGTAACTAACAGCTGATGCTACACCAATGTAGCCTTCTCTGAAGATTGTAAC
TAACAGCTGATGCTACTTATCCGATCGAAAGGAATAAATGTTAGCCTGTGCTTTCAACTG
GAATTTGTTCTTTTTCCCTTTTGGCAACGTCTCACACAGGAAGAGCACATCAACTTTTTT
CGTACGAAATCTCATTGCAGATAAAAAAGACAAGCACCGACTGAAATCTTCTCAACGCAA
GGCATGATGGAGTCAACATGATGGGTAAATCTGAACCGAAGTAGCAGGTTTTCTCACCTA
CGAAGCACAATGGCCATGATAATAACATGGCAAGTGTAACAAACCCTAAATTCCAACAAA
GAGAAAGAAGCAAACTAGTATCGTAGACAAATCCGTCGACGACAAGACTTATAGACTCGC
GATGTTTTCTCCTCCACCTCACAAAAATTGTACCTAGGAGCTCTCTGCCCTCCCACATTT
CAGGTCTCTTCCTTCACAAGCTGCTGCGGTTTTTCGCTCAGACGGGGGTGTGCTTCAGAG
CGGGCAGGGTGGGACTTCGAGCGTCGCGCCGGCTTGGATCTGGCCCCACCCGATGAGGCG
CCAGTGCTTCTCGACACGGCGGCTCAGGGCCACCTTCTCACCCTTGCTGGTGCAGACGGG
CGCGGTGAGCTGGAGCTTGGCGAGATCGTTCTTCACGGCAACCACGCGGGCGCCAGTGGA
CATGGATCCGATGTTAAGCATCAGGATCTCGCCCTTGGTGAGCTTGGAGACCTTCCCTGC
CTTCTCTGTGCCCTTTGTTCTCACACCCAGCAGCCTTCGGAGAAGGAAGAAGTTGATCTG
CAAAAGCAATGTACAGGGATTGTCATTAACAGCTATCACTGCTTGGCTGGAGTCATGAAG
CTACAAAGATCTGACAAACCTCCAGCTCCACGAAAACATCGGGAAGCGACCCGATTTCTC
CTAGAACCTGGCCA