Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1560959 (4008 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1560959

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11386 1 598 bp MLOC_11386.1 Available Available None
MLOC_11388 1 1644 bp MLOC_11388.1 Available Available None
MLOC_11387 1 377 bp AK355166 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_11386






CDS Structure of MLOC_11388






CDS Structure of MLOC_11387






Contig Sequence (4008 bp)

>contig_1560959 4008 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TACAAGTTGCATATTCCTAACAGTTGTCACTCATCCGGATATCTCTTATCCGTTCATATA
GCGAGTCAGTTTGTCTGGTTCCACTTCGGTTCACTATAGTTACCTTCTTCGAGTCCTCCG
ATATCTTCATGGCATGATCTTTCATCGTCTATTCTTTCCTCGCTCTAGTTCTTTAGAACT
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TTGGTTACGGTGGTTAGTTCAGAACTTTGGTGTTCCGTTCACTACACCTACTCTGCTATT
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GGATACATGCAGCCATCGGATTCACAAGATATGTTGCCCCTTTGTATTTACCCCATTGTA
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ATAGGAATACAAGTTGCATATTCCTAACAGTTTTTTCATCCTGTTTGCAGGCAAACATAG
GGCCTGGTACCCCAAGGGAAAGTTGGGATCTTGGCAAGCTGATAGCTAAAGTTCAACAGT
GAGTTTTCTGATAATATGCATATTTCAGGCGATCTACCAAGTGATTTACTATCTCCTTCG
TTATGTTTCTATCTTTTTTCTAGGTATTGTTACCTATTAAATGACTTGGCACCAGAACTG
TTGGAGAGTAAATGCTCAAGCTACGAGGATTTACAGGAGTACCTTCGAACCCGAGGGCGT
GAAGCATACTTCCAAAAAGCTGTTAGTTGCTCTTTCTGGTCTCATGTGTAGAGTTTTCTT
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TGAAAAGAAGAATCGAAGTTTCACCTTGCAAATACTGGTGAATATATTTTACTATTATAA
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TTCAGAGATCAAAGGTGCTTTCTTCAAATGACACATGATAAAACAAGATCTTCAAATTAG
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GAAGGAAGCCGAGCGATTCCTAATCCTAAGCAATATTGATAAGCTCTGGAAAGAACACTT
GCAAGCTTTAAAGTTTGTGCAACAAGCTGTTGGGTTAAGGGGCTATGCTCAACGAGACCC
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GAGAAATGTTATTTATTCAGTATATCAGGTTTGTCCATCCCTAATGTCCAACTCATCCTT
CCTTTATTTCCCTTAAATAATATATTAGGTTATCATATTTATTACCTTTTACTAACACTT
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ATCTCACAAGACTCCTGTGCAGCATTATGCAATTCGGAATGAAAAGTTAGTTTGTCAATA
GTGGTATTGTGAGACTAACTACATCTCTACTGTGATATCCTGCTAGTAGTAGGCGTTAAG
AAATATGGAACTCGTATTTCCATGAGGCCAAAACCCAGTATATACACATGTGCAGGTGTG
GGTTATGCAGAAAGCCCCTTATAGGATACATGACTATATAAGTCTTTGTACTAGGGTCTT
TGTGGGGCTGCAGCACATGGTCCTTGTGGCTGTTAGGATAGAATCCTT