Map Locations of contig_1560800 (10762 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1560800

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11307 1 947 bp AK373688 Not available Available None
MLOC_11308 1 437 bp MLOC_11308.1 Available Available None
MLOC_11306 2 2665 bp AK373688 Available Available None





CDS Structure of MLOC_11307






CDS Structure of MLOC_11308






CDS Structure of MLOC_11306






Contig Sequence (10762 bp)

>contig_1560800 10762 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGGCATCTTCCGCGTGCCGCTGCGCGCAGCCATGCACCCTGGCCGCCCGCCGGCGCTCG
AGGTGCGGCCCCACCCGCCGCGGGAAACGCAGGTGTGCTCCTTCCTGCGGACGCTCGCGT
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CGTGGCAGGCGCACAGCCGCACCCCGGTGCTCTCCATGGTCGTCACATCATACGGTGAGA
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TGCTTGCGGACCATTGTCGAGCGAAAGTTTGGAGTCTAACTAGCATGACGTTTGCTATTT
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TAGAAGAGGTTATATTGTTAATGTATCCAAATAGGTAACAAGGGAAATCATAAAGAATAT
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TAGAGGGAGTAGTTAGCAACTTACTAACTATTATCCCTCTGTTTCAAAATAGAACTGTTT
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TGGCACTTCGCAATTGCCAATTATTGATTACACAGTTTCGTAAGTTTCTTAAAGTGCGGA
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TGCGGTGCCATGTGGCTTTGGACGCGCTATTGGCAACAAGGTACATGATCTGGAAAGTGT
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GCGGTTATACTTGGAGGAGAAACAACCTCGCTTTCTGCTGAGCTAGTAATAGACTTGGTG
CTGTGTGACTTCTATCACGGGGTTCTATTGCTTGTAATTTTGTGTTCAGATTGACTTTGT
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GGGTGACCCTCCTTACAAAAAATCTGTAGAGAAAAACTATCTAAACTGGCCAACGATAGA
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TGTTGGGTTAAAAATGAGAGTTTACGATCGTAGGATATGTTTTGTGAACAATCATTTTGC
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GAATTTTAACAAACCTCATGGATCTGCAGGTTTCCCATTCTCACACCTCCTCTTTTCAAG
TATTCTTTTACACTACTTTACTGTATATGAAGCCTATAACTTTTTCTCCTTCTGCTACAG
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TTTCTTTTTTGACATCAAATTCAGATAATGCTTTACAACTGATAATATTTTCCGTCAATT
CTGATGTAGGGTATGATTCGGGTGAGAAGAAGAGAATACCTGCTTGGTGCGATAGAATAG
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GAAAGATGCTTAGCTAAATAAACCAGATTTTCAGACACCGGTGCTTATCTGTAGATGGTA
GATGCTTAATTTAAACAACCATCCTATGGTGATAAGCACTGGTGCTTAAGACAAAGCCGA
TTTATTTTATCAAGTACCTCCCTTAAGCACCTTGCATTGTACAAGGCCTAATCTTGCTTT
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CTGTTGTCCTTCGAATAACAAATAACTGTGGATCAAAAAAGTCTGCTTTTGAAATCTTAT
GTGAAGGCCAGTCGACAAGCCAGCAGGACGGAACGAAATCTGATTTTATTCCAAGGGCAT
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GTTCGTAGTGGAACCTCTAAAAAGATTTATATTTAGGAACGGAGGGAGTAGTTAGTAGTA
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TTTTTCATTTGCCACATCGGTCGCATCGTACTAGTATTTTGATATCAGCTTACTTTAGTG
TGACTCTCCTGTCACAAACAAAAGTACCATATTTCGACCTGGAGTCCTAGGATCGATCAC
TGGTCATTCTTTGGGTTGTTACTGACAGGTTTCCATCTCTTGTGTTTGTAATTATACAAT
GTTCTTTTTCATTCTAGAGAAAACAAAATTAAGAGAACTACGGAAGCTCTCTTCTGCTTG
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TAGCCCGTAGTGGAATTTCTAAAAAGATTTGTATTTAGAAACAGAGGGAGTGATCTGCTG
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TGCCATGCCATACAGGTTCAACCATCCATCGGCCTCATCGAGCCTGGAGAAACAATGGAA
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AGCACCTCAACCGAAACCGTTACGCACAGGATCAACGTCCGGCACTGCTGCGCCGCAAGC
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CGCCCGCATCAAGGATAGTCAGTCTATTTCAATAGTGATGTTCACCATACCCAATCAGCC
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TAAGGTGACCAGCGCCTGAACCTCTCACAATCACCTTGTCCATCTCGTACCACAAATCCC
GAGCCACCATTACCAGCTGAAGAGAAGAAAGACCCATCAATATTAAATTTAATCTTGTCC
CCTACTGGCCTGCTCCAGTTTTGCTCCTCACTGGTTGGATTTGGTCTTCCTTGGCTCGCA
CCCAAGCTCAGACATTCAGAGAGACGGGTTAGAATTCTGGTAATTAGATTATCAATCGAC
TCACCATGCTCTTTTGCATTTATCTTGTTTCGTCTAGACCACCAACACCATAACATGAAT
ACAACTGGCACCCTTCTGTTCTCGTCCAGCTCCAAGAGGATCTTGATCACTTCCTTTGCA
TCCTTGCCCGCACACATATGAAGTCGGGTATTCCCGAGTTGCAGTCATCGCCAAACCAGT
TTCACTTCCTTGCATCTGAGAAACAGATGCGCCCCATCCTCATTAAGTCCCTTGCAGCAA
ACACAAAGCGTATCACACTCAATGCCCCTCCTCTTAAGCCCCATCAGCGAAGGCAGGCTA
TTGTGGGCAAGTCTCGAGACAAACTATTGAATTTTTGGCTGGCATTTGATGTCCCAGATT
TTCCTCCAGTCTAGATCCCCTTGGTCAATGTATGAGGAGGAAGCCTGCTCAACATCTCTT
CTTCTAATGTACAACTTGTATGCAGATTTAACTGAAAAGATGCCCTTGCCGTCGAAAAAC
CAAGCATAGAAATCTTCAAAGTCCTCACTAGTCGAAGTGGCCAAGATCACCTTTGCATCT
TCTTCAACAAAAATATTCCGCACCAATCGTTCATCCCATGTTGATGTGTCCGGATCGATA
AGTTCACAAACTCTAGTCAGCAGGCATCTTCCTTGTTGCGTCCAGAGCAGCCGAGGGCCC
TCCCTATTCAGCCATGGATCAGTCCATATTTTGATATTTGCTCCATCTCCAACTCTGTGG
ATGATTCCCTCTTTCAGCAGATCAATCCCCTTCAGGATGCTTCTCCATGTATATGAGATG
TGTGGACTAGCTTGCGCCTCGAGGATCGACGAGTTTCGGAAGTACCTAGCCTTCAGAACT
CGTGCACAAAGGGAGTCAGGTTCAATGAGAAGCCTCCATGGTTGGGGAACGCTGCATGGG
AAACAAAAAAATTCCTACGGACACGCAATACCTATCCCATGGTGATGATCCTATACGAGA
GGGGAGAGTGAATCTACATACC