Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1560709 (6044 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1560709

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11258 1 696 bp MLOC_11258.1 Available Available None
MLOC_11256 1 377 bp AK363417 Not available Available None
MLOC_11257 2 2367 bp None Available Available LOC_Os01g65330.2, FRAME:+1, EVALUE:8e-150, 13101.m07055 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_11258






CDS Structure of MLOC_11256






CDS Structure of MLOC_11257






Contig Sequence (6044 bp)

>contig_1560709 6044 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCAATTCCCCTCCGAGGCCACCCCGGCCCGCCGATCCACCCGCCGAAGGCGCGTTATCCG
CTGGGATTCCGGTAAGGCCCGGGTTTCCAGGCGGAGAGGGGAGTGTTTTTTTTTTTTTCG
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TTAGCTAGACACGCCAAAGGTGTAGCGTGCCACAACTTTCTAGAAACATGTTTGGTTCTT
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GTGTGGCGCTCGTTTTAGCTGCCACACTTTCTGTGGCGCGCCAGACCTGCCTCTGCTTAG
GCGTGGCAAACTGAATGCCCAACCAAACAGCCCCGTAATCTCAACTGTTATTACCTGTGT
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TTAATGTTCTGTTCTGTTTGCAGGTGAGAGCCTGCACATACTAAAGCAGGAGGTCAAGAG
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TTTCCTTGCACAATACTGTTCTTCTAATTCGAGAAATAATACTCTCTTCCTAGGTTATGG
AAAAACTTGTAGACATCGTGCACTTCTTGCATTTGGAGATCCATAATACCTTTGGGTGCT
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TGAGCTGTTGTGTAGTTTGTCATTTCTTTAATTTTTTACTGGTTAGATAACATCTCACGA
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ATGCTAGTGGAAATACACCTTTTATTATTGCGCCACAACTTCAGTTTCATCTCCGCCAAT
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TCGCATAACCAAATAAGCTCATTTCAGGTACTTCTGATCAAGCTTTCAAGTTTGTCACCT
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TCGTCATAGAACATTTGCTTGGGTGTGAAATAGTTATTCTGACCTGTGATGTCGTTACTT
GCAGTAGCCACATCAAAATGATACGAGGTGCTTGTTAACTGTGCGATCCCCACAAGATTC
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GTCAAAAAACATCTTATATTTTGATACGGAGGGAGTATTGCATGTAGCACACACTACAAG
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CTGTGCCACCCCGAGAGGTTAGCACCCACATCCACAGTGACAACACCGGCGGCTAACCTG
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TCCCCCGGTATCAAACAGCTCAAAGCGCAACAAAACACCTAACAACAATAGATCGACGCA
CTCTCCACCCATGGTGCCTAGAAGATCGGCAAGCAGACAACGGGAGGTAACCTGACTTGA
AGAAGACGCCGCCGAAAAGGTGTTGATGATGGAGTACATAGCGCCCTGGATGCTCATGTC
CACAACAACAACCCGCACATGACAACCTAGCACCCCAAGTCTCACCGCCGAGGCGAGCGA
GGCAACCTACCCATCGCTCCTCCGGACGACACCCCAAGCACCTAGGCAACGCCTCCAGGA
AGGGGACGATGTTTAGACGCCGCTGCTGCCTGGCCCGGCGAACCGAGCCTAGGGTTTCCT
CTGGTGTCAGAAGAGGGGATGGACATGGCAGAGGAGAAATCCGGTGCGGCTGCGAGCAAC
AACGACACTTGTCCGTGCCGTCTCCTCCCTGGGGGCGTTGTCATGGCGGCCATGTCCATC
CCCTCTTCTGACACCAGAGGAAACCCTAGGCTCGGTTCGCCGGG