Map Locations of contig_1560490 (11216 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1560490

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_11145 5 2210 bp MLOC_11145.1 Available Available LOC_Os09g24910.2, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13109.m02374 protein phosphofructokinase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_11145






Contig Sequence (11216 bp)

>contig_1560490 11216 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATTTTTCATGTGTTGTATGGATGTTATTTAATCTTAATATGAAAACAGAATTTAATACCC
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GACAGATTTTCTACTGAGAAAAACACGCGTATGTTTTTCATGGGATGTGATTGTTCATGC
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GTTGCTGATGTTCGTGTTCTTTTCTATGGGAAGTCCAAGTGGAGTGAATTTGGTATATGG
TTATTCTTGCTTTAGATAATTCTTTTTTCTATCTTCAGGCACGTAGTGCATATCATGGAG
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AGGAAATGTGGTACTCAGTGATTTTGGTGTCCACATGCAACAAAAGGTATATATGCTCAT
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CTAGGTTGCCCAAACAACCAAGAGTAATAAGCTTCTCAAACTTCACTTCCACGTTTCACC
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CAATAAAACCTGAACTGCCATAACTTTCGGTCTTTCGGATACGAGCTCCGAATTGAGTAA
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CCTTTGGTGCCCCACTGGAGCCAAACGTTGTGCTCTACATGATCCTGAGCTGGAACAAGG
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GATTGTTCAATCAACCTAGATCAAATCCTGCTGGTTCTAAAGGAAATCCTGGTGGAAATC
ACACTACATCTTTCATGACAGTTTCCACTGTGTTTAGCATACTTCAATTCTCTTTTGATC
CTGGCAATAATGATGCGGGAATTTTGCCTATTCATAATGGTGGTAATAGGGCCAACTCTA
ATCTGATTCTGAGCCGGGAGACAGGGTCATGACAGACCGGGGTTTCCAGGCTTTTCTGTG
TTTGATGCCTCCTTGTGGGGCATGATAGACCGACCTGCTAAAAAAATCCATTCCCGCAAA
TGCAAGGGGTAGGGTCATGTGGCAAGTGGTTGTCTCTCCACATTCCAACCTCTGTCAGCG
TCTAATCAACCGATGACCCCTAGTTTTGTTCCCCATTGCAGCTGCGAGGGTCAATGGCGA
GATTATCGCTCCTTCCCAGTAAGTAATTCTGATTCTGAGAAACAGGGCAATGCTATTAGT
GCCTTACCTAACATCATAGAATACAGTTCTCCACAACTAGCTAGTTCTTCGCTCTTCCTT
CTTCGCCTCCTCAATTGCCCAACCTCTCGCCTTTAGCACTTGCAGCGCAAGGAGCGCTTG
CTCAAGAGATGGAGAACTCCCCTTTGATCCGACTCCTTTCCTTCCTCCTCACCATCAAGC
GATCTAGGTGGAGGGAAGACAAGCAAGAGTGCGAGTCATCTCCTCTGCCTCGACACCACG
ACATGAAGAACGAGCTATTGCTACAGTAATCCCTATGCCAAATGTACATGTGCATTTTCC
CACTGTCAGTGACAAATCATACGGGAGTTCATCACATAGGTCAAACACTTCGGGTTTTCT
AAAATTTGTCGGTGCCCTTTTGCACAAGCGTATGTCAAGTTGCACCGATCCTTGAGGTGA
GAATGGGCAATGCACGGTACCAAATAGGCTAGCAAATATGAGGAGGTGAGATTGTGTATG
CCTATGGTGTCACATTAGTCATAAAGAACTCATGTACTTGTTGCAAAGTTTTATTAGTTT
TATCACAAATCAAAGTACTACTCGCATGTTGTGAGGGAGAGGGTTGGGAGGAATTAACCA
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NTCATCACCATGCCCTTTTAATTTCTAAATGAACAAGAAGTTAACATCTCTTAATATCGA
CTCCTCTCTAAATTAATAATAATGCACTCACGCCTTTTTCATATCACCACATCAAT