Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1560147 (5338 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1560147

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10983 1 745 bp None Available Available None
MLOC_10982 6 2542 bp MLOC_10982.1 Available Available LOC_Os08g18000.1, FRAME:+2, EVALUE:6e-78, 13108.m01919 protein OsFBX283 - F-box domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_10983






CDS Structure of MLOC_10982






Contig Sequence (5338 bp)

>contig_1560147 5338 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGTACATCGGTTCCATGCTAGTGCTAGTACCAACCTCGCCCCCAGCGCCCTTCGTTGCC
ACTTCGGTTCTCACCTACTTTAGCCTACCCATGGCATATGTTGCGAGTATTCACCGACAC
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AATACATTGGACACACTCCACCTTCACTCTTTTGCCATTGATGCAGCCAAGTATTGGATC
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CTCTTATATAAATTTCAGTTTGACTGTGAAGAGCAAAAGCAGCCGCTTCGAACGGCTGAG
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AACGTCAAGACGTACTCTTAGGGTGCTGCACCTAGCGTTCGTCTGCATATGGGATGCATC
TTTGCATACCGCTTTCGCTGTGACATGTGTGAGACCCGATGCAGCTAGACATTTGGTTGT
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AAGTATCGTGTGCGCTGACGGCTTATGGGCCTTTGGATGAGAAAGGGTGGGACATGATTT
AGCTACAAGGTGAGCCGATGGAACATTTACAGCCTCGCACTAGGCCATATAATCAACCTA
TTGATATTCAAAATGGCTCGGGAGGACTGTATGGAAGCATCGTCATGGAAATGTCAGAGA
CGTCGAGGCAGTTCCTGAGATGTCCCTTCATCTTGGAAGGAGGCGAATCAAACATTGAGG
AACATAGCCTCGCTAACTAAGCATGGTTTAGGACATTCTCTAGGACGCCATGTGTGTCTT
CTTAATCCTTCGTACCTAAATTGTATCACTATGTGCCTTGTTTTTTGTAATAAAGTAAAG
TGTGTTTAGACTAAAAAAACATATCAATCGACCAAGAACCAAGATCAAGGTCCTTCGTGC
TCTCGCTCTTGCGCTCGCCGCCCCCCCTCCCGGGCCACGTCCCGTCGGCGCTGCTTTGGG
GCTTCCCCTCCCCTCCTTCCTCTAGGTGGTCGCCCCACGCGCCAGATTGGGATCTGGATC
GGGGTCTGGCCACGCCTCCCCCTCTACCTGGTCGGTCGCCGTGCGCCTCACGCGGGGTGT
CGGTGGTTCTGGAAACACCTCTGGAGTTACTCTGCATCGCTCCTGGGCAGGCCACCCCCT
CTTCAATGTTGTTGCGGCTGTTGGTGGCGAGGTCGCGCGCAATAACTCAAGCAACTGGGC
GTAGGTCGTCCGGGGCGTGGACAGGCTTGGCCTGGGCGCGCATTCATCGCTCGCGGCACC
CGCAGGACCCGAGGCTCCAGGCGTGGTGCCATGGGTCACCGTTGTGTCCCGTTGGCTGCA
TCGGTCGGTTTTGCGTGCAACTCCATTGAAGTATCCATTAGGGCATTTCCAATGGTTATA
AGATAGTTGTTGGTAATTTTAACACATATGATTTTTGATGATGTGTCTTGCAATAAATGA
GGAAAGAGAGTAAGGTTGTATGTAAATTAACCAACACCCTTGCACAAGCTCCCATGTA