Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1559984 (5749 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1559984

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10886 1 246 bp MLOC_10886.1 Available Available None
MLOC_10884 2 1670 bp MLOC_10884.2 Available Available LOC_Os06g47530.1, FRAME:+3, EVALUE:1e-159, 13106.m05043 protein TKL_IRAK_DUF26-lh.6 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed
MLOC_10885 1 208 bp MLOC_10885.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10886






CDS Structure of MLOC_10884






CDS Structure of MLOC_10885






Contig Sequence (5749 bp)

>contig_1559984 5749 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GTCCAGGTACGCGTGTTTGGGCTTGATGCTGGTCAGTAAGTAGCAATTTTCTCGGTGCTT
ATGTGGAAGTTCGTATCGAAATTGAAGCCCATGGTAGCATGTGATTGGGGAAAAACACTG
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GGTTTTTCCATCAGCTACATTGTAATTCAAACCTACAATGTTTCATATTTTGTTGTTCCT
ATTTTCTACGCAGATAGGGATCTTGGAATCTTTGCAAGCTGGTTAAGATGTTTTGTAAGA
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AGTGAAAATGAGTCCCGCTTCGATACAACCCCCTCACAAAAACGTACAAAGGACAATATG
AACCTTGATAATTTGTACGTACTTCTGTATGTAAAACGTATGCCGTTGGTGAAGGGCAGC
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TGGGAGTACCTGCCTTTAGTGAAAGTTCTAAAGCTTGATGCTTTAAGTAACGGATAGGCT
GCGAATTTTAGGAAGATTTTACGCACGCTTTGGGAACGGGTCTTTTTTCCGTAGTTTATT
TTTTATTTATCTATTTTTGTTTTCCTGTTATGTTTCTTCTTCATTTTTCAAAAAATGGTC
GCGCTTCCATAATTTTGTTCAAAAATTCAAAAAAAATTGTTAATTTCAAATTTTGTTCAT
AAATTGACAAATATTCGCATTTTCAAAAACTGTAAGGTAACTTCAAAAAATGTTTGTGTC
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AAAAATGCAAAAAAAATTGAAATCTTAAGGTGTTCTGGATTTTCCCGAACACTTTGAATG
TTGTGAAGAAATTCTTTTGAAAATGGGAACAGTTTTGAAATTCCAATAGGCGCCTGACAG
GAGCGATGTTGTCGCTTAGTTGTGTGAACATTCATGTTTACCTTCATGACATCATCTTTA
TGAAGAGAGAAGATAAGATACAAGGTTGATCAGGACTAAGTCAAAGAGTGAACGAAGTTG
ATCAACACACAAAGCACACAAGATGTACCGAGAGGGATCNNNTGATCCCATGGTATGGTA
AGAATTTTCCATTACGCTCTGTGTACTAACCATGTTTTACATAAAAGTTTTATGTGGGGT
CATGTATGTTTTCATGGGTTTGCGTCAAGAGGAAAATCTCATAGAATCCATGGAGGATAC
CATAGAACTTATGATACTTGTGCTATGAACTTGTTAATATTTTGGTGAGGAGCGGCACCC
TGGCGTGGAGCAGGGAAGGAGGATGCCCCTGTTGTTAATCTAAGTTTGTTGTTGCTGTCA
TTTCCGTTGTTTGCTTTATTTAATCTAAGTTGTTTGTTGTTAATTTTAAGTAGATTGTGC
TTGCTTTTGTGTTGATCATGTGGTGATAAGGACACCACATTTGAATGGGGTAAGCAGAAC
ACAAACGTTGTTTGCAACCAAACAACTGAAGTTTGCATCTGTCCACACCCTATGCATAAA
ACGACAACCAAACAACAGGGGTAAGTGCCTCTTCATGCGATGCAGGCAACCAAACAGGTT
GCATCTGCTGCATATGAGGTTGCATATGAAGAACCGGGCTGGCTGAAGATGAGTATGCAA
CGCAGGTACTGTAACCGAAAGCAACCAAACACGTCCATACTGCTCGCAATAATGCTCTAT
AGCGTATGCTTAAAACTTTTCAGGGCATGTACAATTTTACAGTAATTGAAGGCTGAAGCT
GTCCGACATCTAAAAAAACAAATATTTTAACGCGTAAACAGTTTTTGTGGGAATGTTGAA
GATGTTCCTGGTCAAAGTCGCCGCCGGCCCACTCCACCGATAGATACGTGTCGCACCCGG
CACCCGCACCCTCGCGCGCGCCCGTCAATGGCGGCAGCGAGCATGGCGAGCGCATGGGAC
AGCCCGTCGAGCAGCCTGTGGGGCGCGCTGGGGCAAGCCTCCACGATGGCGCAGCTGGTG
GGCGTGGACGCGCTCGGCCTGGTCTCCATGGTCGTGCAGGCCGCCCTGG