Map Locations of contig_1559975 (11711 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1559975

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10881 1 707 bp MLOC_10881.1 Available Available LOC_Os11g14270.1, FRAME:+2, EVALUE:4e-26, 13111.m01462 protein transposon protein, putative, unclassified





CDS Structure of MLOC_10881






Contig Sequence (11711 bp)

>contig_1559975 11711 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTCACTATGTGTCTACATACGAAGCAAAATGATTGAATGTACACTCTAAATTATGTATA
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CTCTGAACTAAAATTAATTGAGATTTTAAGGAAATGCTAGGGATTTATAAAAAATGTTTT
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TTGTTAGCAGTTGTCCTTTGTCATCTACATGTCCTGGGTTCGAATCCTTGCAATGACATT
GTGTTCTCTAACTTTCTAGAAATTAGATGCTCATAGTGCGGGTGGGAAGCTACAACTGCC
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ACCCTTTATATGTTTTTGAAGGGAGTAGTACCCAAGTGGATTCATAGGGTAAACTATTCA
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GATCCTAAGCTAGGTGTCTTCGAGCGATGATAACATGGACACATGATTTTACCCACGTTC
GGGCTCTTTCGATGAGAATATACCCTACGTACGTCCTGCTCTTGATTGTCTTGATATGGG
GGATAGTACATAGTACATGTANNNACCACGAGATTGTTGTAATGAATATGCGATTGTCTA
TTGAGTAGTCATACCTTGATACTTGTGATCTGAATTAGGTTTTCCGTGAAGAGGAATGGC
TGATGCAACATAATATAGGTAATTATTTTCCTTAGTAGAGAACCAAGGTTTATCGAATCA
ATAGGAGTAACAACCAACCCCACTCTTGAGCAGCTACACACAAAAGAGCAAACACTTGCA
TACAACACGGACATGAGGGTTGTCAGTCCCCTTAGACTCATTATTTGCAAGCTTGCAAGT
AGTGTGGATGGTAGTAGGTAATTGCAAATTACAAAATAAATAAAAAGTAAATAAGAACAA
TGAGGTATTGTAGTGTTTGTGAACTTATAAGTGAGTAGACCCTGGGACATAGTTTTTCCT
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