Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1559971 (4285 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1559971

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10877 2 2357 bp AK371521 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10877






Contig Sequence (4285 bp)

>contig_1559971 4285 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACAAGAATTTTGGGATGGAGGAAGTAATACATGTTGAACTTTTTTCAATACACAATGCCA
TTTTTTAATATGAATACTTTTCTAAATACATGTTATAATTTTTTAATACACGTGAAAATA
ATTCAAAGAACATGTTAAACATTTTTGAAACGTACTAACATTTTTTTAAAGTTTATGGCC
ATTGTATTTTTTTCTTGCATTTCTTTTATTTTGAGCGGTAATAATAATATGAAAAATAAA
AATAAAGAACCTGAAAAAATGAAAATAAAACTTGTGCGGGTCCATAGAAGTGTCCAATAG
AAATAAAAACCGTTTCGAGCACTTTTGTAAGGCTAAAAACTGACACTTAAAAGTTTCAAA
AAGAGTTGATTGTTTTCACACAAAAACGTATGCATGTGCTCTACTCCCTCCGTTCGGTGA
AAAGTGAACATATAAACATTTTAAGACAAATTATGAAGTGAAGTAAAAAATACATTGAAA
AGGTGCAAGCCACCATCTCTCTTCTCTTTAATTATCCAACCCTCAATGAGCTAAGTGCAT
GTACCAGTTAAGGACACTATGAGTAGAATGTTATTGATCTTGATTATCATGTGATGAGAA
AGAAGCATTTTTTTTCTACTTTAAAATGCATTGAAAAGATGAAATTACATTTTTTTATGG
ATTTTTTTAAAGCGAAACGTACACTCTTCACCGAACGAAAAGAGTAAGTGACTTCCAAAT
TTCGTTAGACTTCCATTGTACTCCCTCCGTTCCTATATATAAGACATTTTAGAGATTTCA
CTATATACTACATACGGATGTATGTAGTCATATTTTAGAGTGTAAGTTCATTTATTTTAC
TCCGTATGTAGTCTATAGTCAAATATCTAAAAGGTCTTATATTTCGGAACAGAGGGAGTA
TTGTGTAAAAAAATACCTCTTATATATGCACTCAGCAGTGTATGACACGGTGGACAACCT
ATGTGTACAATGCTATCCGTGATTACGAGAGCCCAGGTTCGACCCTGTATCACTCATTTT
TTATCTTTCTAATTTCTAATTTCTGAAGTTTTCTTGAGCGATTAAATAAAATATGAAGTT
TTCTAATTTCGAACATTAATTTCATGTATTTTATAACTTTAGACACTATATTAACCGTGC
ATGATAAGTCAAGGCACCTTGAGTATATTTAACCCATTCTAATTCTCTCAACATACAATC
CTTCACATCACCAAATGTGCCACATCATCATTCACTGTCTTGTAGCATATGCATACTTTA
ATTTAATATCTTTATCACCATCGACGTCTAACATCCATGCATATTCTTTATTCACACATA
AATACTTCCTAAAAATAATAGCTTTTAATTTACATAATTTTATTCATGTAAAAATAAAAT
TTATCTTTTAAAATCCTGCGTCAATGCCCGGGAAATCACCTAGTATCATTTATGTGAGCT
CCTCTTAAAATCTCTCATTCCCATTCCGCAACACGATCTTAGCTGGTGATGTCGATGTGG
GAAAGACCATAAAAAAACTCCACGACTTCTCTTTTTTGAGTCATTGCCCGCGTAAAAAGT
ACCCAACTTTTGACACTTGTAATTGGGATTGAATAATCAAAATATGTTTGCCTCCGTGTT
GAATCATCAAAATATGTTTGCCCCGTTGCAACACGTATGCAATGAGCTACATATAACTGT
GTAGTACATCGGCGGTTTCTAAATATAAGTCTTCTAGATATCTTATTATGAACTAGTACA
TACGGATATATATATTTGACATATTTTAGCGTGTAGATTCACTCATTTTGCTACTACTAT
TTAGTCCATAGTAAAATATCTAATATGAATTTCCAGCAACATGCATTTTCATACGTGATG
TACACAAAAAGGACAAATATGTGTATAAAAATGGGCCTTCCTTTTGTTCTTTTTTGGCCA
GTATTTTTTTCTTTTTTGCATACAGACATGTAAAAAACATCTATATGTATCCTTGCAAAA
AAAATGATTTTTCCTAAAACTTGTAAATAGCATTTTTTTTCTGGTCTTCTTCAAAATACC
GGCCTCGGTCTCCAAAACGCCTCACTCCAGATGTAGGGCCTAAGAAGGAAACATAAATTC
AATGGCATGTACAACGATCCTGTGGCACTGGCAACTGTTAATTCACAGTATCGCCGACAG
GGCGAAATGACAACCATACGCTTTTTGTTCCCATACATCCAAAATTATTACAAAATTTTG
GAACTTGCTGAGACAAGTAATAACAGAAAAGGAAAGATTATATGTGGATGGCTTTAGAAT
GGGTTTGCAAGCAAGCCTCCTTGAGGGCTTCACTCACAGTGGGGTGAGCATGGCATATCC
GGGCAACATCCTCGCTCGACGCTCCATACTGCAGGGCAAGCACAGCTTCATGGATGATCT
CTCCAGCATTCTGCGCCATTATGTGCACACCAAGAATCTTGTCAGTTTCCTTGTCAGCCA
CGACCTTAACCATCCCCTCGGCATCATCGATAGCCTTCGCACGGCTGTTCGCCATGAGCG
GGAATTTGCCAACTCGGTAGGGAATTCCTGAGGCCTTCACCTGCTCCTCCGTCTTGCCAA
CGGATGCCACCTCTGGGTGTGTGTAGACCACACCAGGCACCAGATCGTAGTCGACGTGAC
CTTCCTTGCCAGCGAGGAACTCAACACATGCCACACCATCCTCTTCAGCCTTGTGGGCAA
GCATGGGCCCAGGGATGGCATCACCAATCGCATACACTCCATTCACATTGGTCATGAATC
TCTTATCGACGAGGATCCTGCCAGCCTTGTCCATCTCAACCCCAATGGCATCCAGCCCGA
GCCCGGCGGTATAAGGGGTTCTCCCAGCAGAGACAAGAACGATGTCTGCTTCAAGGGTGC
TCTGCTCACCTCCAGCTGCAGGCTCAAGTGTTAGCTTCACCCCGTCTCCAGAGGTATCAA
CTCCGACCACCTTTGTCTTGAGCATAAACTTCATTTTCTGCTTCTGCAACATGCGTTGGA
ACTGCTTCCTGATTTCACCATCCATTGATGGGACTATGTCCGGAGCAAATTCAACCACAG
TGACCTCTGTCCCAAGACGATTCCAGACTGAACCCATTTCCAGGCCAATGTAACCAGCTC
CAATGACAACCATTTTCTTTGGGATACCCGACAAGCACAGGGCACCAGTAGATGAAACAA
TCTTCTTCTCATCGATTGTGATCCCAGGAAGTGATTTTACATCAGATCCAGTGGCAATGA
TTATGTTTTTTCCTTTGACAACAGTGTTACCACCATCAACCAAATCAACCGATACTTCTG
AAGGGGAGGTAAGTTTCCCAAAGCCTTTGACATACGTCACTTTGTTCTTCTTAAAGAGGC
CTTCGATTCCTTTTGTTAATCCGGCCACAGCCTTGTCTTTCTGCGCCATCATGGCTGGGA
GATCCACTTCCAGGTTAGAGATTTTCACTCCATGGTGCGCAAAAGAAGTCTTTGCTTCAT
GGTACATATGAGAAGAGTGCAACAGAGCCTGGCGGATCAGAACCATGGAAGGGAGTTAGA
AGTGTTCCCAATAAGCACATCTGCAAGGATATATCACCAACGTAGATAATTCTCTAGGTG
TACTTGTTCACATAGAAGAAATACATCAAATGTTTAGATTCCAGATAAAGTTGTTAATCT
TATGCTAAGAGAATCCTAAGCTACAACATAAACCTTATGTAGGAGCTATACGGATGATAG
GCCTGTAGAGAAAGATGTTGTGCACATATATTAGTAATATCCAACCTTGCAATAGTGTAT
CCAACTATGCTAGAGTTTGCATCCAATTAGGAGTCTTTGTCTTGGGAGTCAAATTATGTT
GTTGACTTTGTATGTTAGGATATGGTTCCAGCTGTTACAAACTGGACTTGCTGTTCAGTG
TAATCGACTTAGAAGGTTCATATGGGGGATGTATCCTATTGTAAGAGGGAAGCAAGAAAT
GAACTCTTTCCGTTCTACTCCCTCCGTTTTTAAATATAAGCCCTTTTAAAGATTTTAATA
GGGCTTGTATTTAAAAACGGAGGGAGTAGTTGGCTAGTTGCCATCCCTACCCATCTAACT
TCTCCATCTATCCCCACTACGTCACTTCCTAGCCAATCTTCCTACCTTATGAGAAGTTGA
GTTACCGTGTAGATGTTTATGTCGAACAAGAGTAAGTTTAGCTTGTATTGTAGTATAGCT
TAAATCATATATTTGAAATATAGGAAGGATAAACATGTACTCCCTCCGTCCCAAANNNAG
TGTCTTAAGCTTAGTATAATTTTAT