Map Locations of contig_1559778 (3193 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1559778

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10790 1 811 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_10790






Contig Sequence (3193 bp)

>contig_1559778 3193 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACCCTGCCTTCCTCCTGGGACGTCCATTGATCCGCTTGTAACACTGATGTACTGGCCTCT
TAGGAGGATGTTCTCCCCTCCCTTTTCAATGCAATGAAACGCAAAGGCTTTTTGCGTTTT
CTCGAAAAAGTATCAGGTTCTATGCTTCGAACCCACAGCAGAGTATTAGGCCACATGAGC
CTCCTAGAAGGGCCATATGGGCCGAATCAGTCATGCCATTTAGATATATCACATGTAACA
AAGGATTCAAACACCTGTTTACATGTTCTCTAAAACTCTTTACAAAGGTATGTTAAGATA
AACAATTTTAAGAAGGCAGAGTTTCCAAGTAACGGAGGTTGCGATATACTACCAACTGTG
ACCATTTAAGACAACTGGCCACAATGCTTCCATCTGGTAACACAAGATGAGTTTCTACCA
TAAATCAAAAATCAGCTCAAAAGCCAAATATTATAAGGCAATGGCAAACCTGAATATGGT
CTTCAGATAGAATCTTTTTTCTGACTGCAAGGCACCTAAACATCGTAAATCATTGAACCT
GTAAGTAAGAAAACTTTCAAAATGGCCAAAGAACCTAAAAGTAACCTTTTACCTTTGCAA
TAATTCTTCTGATTCCCTCAGCTTCCCTAGGGTTACAAGAGTGACACTTAATTGTACGCC
TGCAACTGTAGTACCCAATGAATCCCATCCCTAGCAAGCAGTTCCACAGATATATTTCAG
TAGTTTCCGTAGGGATGATATGACAGGCTTTGGTCAAGAGTGCCTGTCCCTGTCATTTTT
CTCCTTTTCTGTTTTCAATCAGCTTTTATTTCGTTTCCTATATGCTTTATCAGAAAATAG
TATGGACTGCCAACTGGACTGGAGTTTCACAGAATATGTCACATCGAAACTATTTCAGAC
TTTCTACTACTTGAGATGTTGCCCAACGGTCAATGATCATTGTATGCTATTTTCTGGTAG
AATTTCAACCCATTGAAATGTCAAGGATCACTGAATACACTGGTACTTCCCCACTAGCTA
TGTTGGCATGTTAAATGCACCGGTATACATAACGAGTAGGACAAAGCTGAAGCTCTTGGT
ATTTCATAAATTTGCACATTTTGGATCACCGTGATGCTATTTCGCTAAATTTGCACATCT
GGTCTACGTACTACCTCCATTCCAAAATAATTGAAGTTCTGGTTTTGTCCTAAGTCAAAC
TTGTTTAAGTTTGACCAACTCTATAGAAAAATATATTGACATCTAGAGCACCAAATTAGT
CCCGCGAGATTCTTTATGAACTATATTTTCGTATATGTGTATTTGGTTATGTAGATCCTA
GCACATTCTTCTATATAGTTGGTCAAACTTAAGCTAGTTTGACTTAGGGCAAACCTATAA
CTTTAATTATTTTGGAATGAAGAAGCAAGACATTGCTGCACCAGTGCATTTAACACGTAA
CATTGTGATTTGCGCTTGAATGCGGATGTAGTGATACATTGTCCTTCCTTGCCACCCCAC
CCAACCTTGAATAAACAAACAACTAAACACGACTTGTGTTTTGGGCAAAGTTAATACAGA
ACTTCACAAAAAATCAGTGTGACACTCAAGCACCAATTTAAGGCCCACGTTATGTTCACA
ACCGATTACATATGATGGTCTACTGAAGAAACATTGTAGGATTGCAGCTACATGTGCATA
CCTTTGAAAGCTCCATAATATGTAGTATCTTCCTTCGCAATTTTTCAGCTTCAGCCAGTT
GTTTTAGATTCATCAACTCCTGGAAAAACTGGTAACATGAGTATGAAGCCACAAAAAATG
CACTCAAGAACGAAGTAAAATCACAAATTGCGATCATAAAATCACAAAGTGGTAACACTT
GGTTGGGGGAGTGGATGCACAATCCTACCACCTGGGTTCAAGTCCTCACGGTGCAAACTT
ACGTTCCTATTTATACTGTAGGGGTCTTCCCTACAGTTCTACTAAAAAAGTAGTGTAGGG
CATATAATAAGAGAAAAAAGAGATGCAGCCATTGCTAGGAACTTAAAAGGACTGATCAGC
AACCTGGACCATGATGGAGTATGAATGATCCATGGCACACCTTCAAGTTATAACGATTCT
TAGCCTTTTACTTAGCAAATGGTTCTGATGTAACAATTTAATAATGGAAGTGTAAATTTG
ATACCAATTGCTAATCAGCACTGAAAATGATGGAATTGATTTTCATGACATGCAATGATT
TATGTTAGATCCGTAACATTATTTCACTGTCTCCTTAATACTAAAAAAACAGACAGAGTG
TGCAACACCCGGCACGTTAATTTTCATGTTAGGAACAGACTCCTGCGATTTTTGTCTACT
TAGTATTCAACTCAGAATGGATTATACATACCACAACTTCTATACACACTACGGTTTGTG
TCTCAACCAATTTCCTGTAAGCAATAAGCAGAAATGCATAAACTGTTGAATACAATCGCC
GCAGTCCCTTGTTTGCCCTATTATATTTGTCTTTTTTGAGAAAAATGCAGAAGTCTTGCA
CTATAGGAGAACAAGCTCTGTACAAGCCCTAAAAGGGGCAACACCCTAAATTATAATGCC
ACACTTGTAAGTGCTAGGCAACGCTGTGAGAAGCCCTAAAAAGGGCAACCGCCTCTGCTT
TCGTCCACTGTTGGGCCTCCACCTTAACAGTGTCGAGCTAGCGGGCAATGTCGGGTCTCT
GTAAAAGATGGCCGCCTTACAGTGCTTCCAGATCCACCAGGCCGTGAACATGATCACCGA
CTACGTGCCTTTTCGCACCGCTGATTGGGTGGAGAGGATGACCTGATGCCATCATACCAC
AATAACTGGAGGTCACGCCGTGGATCCACAAGAGCACTTCATGCCATAAGGTGTGGGAGA
AAGGGCAACCTATCAGTAGGTGGGTCATGCTCTCCTCAGATTGGGAACAAAGACTTCCTC
AAGACCTCAACCCCCTGCCTAGCGTAGCATATTTTAAACAAAGAATTAGGGATCTGAAAA
AAAATTAGCATATAAAATTTTGGGATACTTTTACACGTCATCTAGTCTTTCCATTCTCTG
TCCTCAAGACCTCAACCCTACAATTGTTAAGTTTCATGCACTAGCTAACGCAACCAAAAG
TCCGAACTGATGGAAAGGGCTAGGCAATCCACATATAGTGTAACACCCCCTCTCACGTGT
GACGGGGAAGACA