Map Locations of contig_1559695 (5297 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_1559695

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10734 5 3189 bp AK373995 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10734






Contig Sequence (5297 bp)

>contig_1559695 5297 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAAGTATGTCTATATACACCCGTATGTAGTCCCCTAGTAAAACCTCTAAAAAGACTTATA
TCTAGGAACAGAGGGAGTATATGCTGGCAAAGAGCATGGATTAAGATGATAAAATATAAA
TGGAACTGAAAAACTTGGAGATGGTGCTTTTGGAGGTGTTAAACTTATTTTTTTGTGAAG
AATATGAAACTGCGAATTGCATTGTAAATTATTGCCACTTGCGTTTGAAGCATTAATTCC
TTTTTCTTAGTTCTTTTGGTTTTTAGTTTTTTATGTGCTAGAGTTTTCATTTAACAGTTG
TAACAGTATCGTCCTTAACCCCAACATTGTTTTGTTTTATATCTGATCAAGTGCATTTTC
ACATCCATTTCATTGTCCAATTGTGACACCAACTTGTGAAATGTTTGTGCTTTGGCTGCC
AAAAATATTCCTGCAAATTCACCTATGTACTTGTCTGTTATTGTTTAACATTGATAACAT
CCTACTTGCGGTTTATAATTCTTTGTCCTATGTCATTGTCGAGCTTGGTTTTTAAAATGA
TCATTTTAGGTCTAGAAACGTATTTTCTTGGTGTAGCCTTGTCGAAGTTGCATGACTTCC
ATGTACATTTCTGTTCTTTGCATGGCTTAATGGGTCAAGAGCACCTGCAGCTTTTTTTGG
TTGCAAGTTGCGACGTTGTGATTTCCATTCTCTTTCATAATCTATCTACACTTTCTTATT
CAACTTCTTTTATTTAAACGGTTCATAAAGAAACACTCTTATGAATTTCATTATCGACAG
ACATTTGTTCTTGATGTGCATCCATTCAACCCCCGTATAGCAATGAGTGCTGGGTATGAT
GGAAAGACAATCATCTGGGATGTAAGTTCCAAACGAGATCTCTGTAATCTTAATCACTAT
TTCAATCCTCAAAATATGTTATTTCTTTATTCAGATATGGGAAGGAAAACCTGTACAGAT
CTATGAAACTGGTCAATTTAAGCTAGTTGATGGCAAGTTCTCTCCGTAAGTGTCACTGTC
GAATTTCATCATATTCTCAGCAAATTGAACCTTTTGTTTTGTCCCATCTACAAATGTACA
TTCTTAACTAGTATTCATTAACCTGCGACCATTCAGCTAGTAATTCGTAAAACATAGAGA
AGAATGAAGAAAAACACCAGAGAAAAATCAACTGAATCGAGTTATTTCTGTGTGGTGTTA
GGATGTTAACATAGAAGGAAGCATCATTGACATGCCAAAGTAAAATTTGCACCGTTGATC
AAATACCAAAGATTGCTGAATTTATTTGATGTGTTGTGTTGTCTTGATGTGTTGCTGGAT
GGACATTTAGGGATGGAACATCGCTTATCCTCACCGATGAGATTGGCCATATATTCATTA
TTGGTACAGGGCAGGGTGAGTCCCAGAAGGATGCAAAATATGATCAGGTACACAAACTGT
TACCAATCAAGTCATTGGGGAGAATGCCTAGTGCAGACCAACATTTGTTGCAATCATGCA
AACTGTCGTTATCTCAGTGATCATGTGAACAGTTTGATGCGGCATAAACAGATTCAATAT
TTTAATTCAGTTTAATCATGTATAACGTTCTAATCTGTTAGATCCTTAGGGGTTATTCAC
AGAATTATTCATCCCGTGGTGTTTAATCCCCTAAACTTAATCCACCAAAAGCTCATTCAG
CTGTTCACACTGATAGTTTGCATGCCTGTACCCAGATATGTTTGCATTGGATAAACCCCT
GTTCAGGGAAATATCCCACCTTTTACTCAATCATTGACGCTCGCCATTCATGTTTTGCAA
TAGTTCTTTCTTGGAGACTATCGTCCCCTTACTCAAGATACAAATGGAAACGTTATTGAT
CAGGTTTGTCCAAATCATCTGTTCTTTTCTTTGGGTTAGCTAATTTAGTTGTTTTGTTTA
TGTATGATATTTTGTTCAGTTTGTGAAACTAACTCACAACAGAGTTATCTATCATGTATA
CTGTTTCCAAGATCTGTTTCTGAAATGGAAATTTTCATTTTGTTATGTTCTGAAGATCTG
ATAGAATCATAGAAACATGAGTTTTTGTTGGGTGTCGCTCAAGAAAACTCCTAGACTTGT
GTTTATCATAGAAACATGAGTTTTCGTTGGTTGTCAGATGATTTGGAGTCCTTGCTATGT
GTTTGCCTCCTTGTGACCGCCAACTATACTTCTGAAGTGTTGCTATCCCGGTAGCTAAGC
AATGTGGATTATAAAAAGGAGTGCACTGCTGATTGGCTGAAAATTTCACTTTGATGGCAA
TCTTAAAAGCATCCAACATTGAAGTTCTGTTATTGCCTATTACAGTATGTTCTTATAAGT
AAAAAGTGCGCCGCACCATCATCTGATCACCTCACTTAATGTGTTTTCCAAGTAGCTGTA
ATATATTTAACATGTTCCATATATCAATGATCTTGTGGGGCTACGGCTAGCATCTCATCA
TGATTCATACAAATGGTTTGGTGTACTGTTTGTAACTGGTCTATTTTTAGTATTGGTGGT
GCTTATCCTCCGGAACAACCAACAAGCAAACATCACAGTAGTAAGGAATGTTAAAGCATG
ATAAAACACATAACTCCAGATTCCAGAAGCTACTGTACACCCATTTGAGCTGTTATTGAA
AAAAAAGGACATTGGGCCCTTTTCATACGTGCCCGTGTGAAACTATATTTTTCTCTGTTC
ACAAAGTGCATGATGAGCTACCAGGTTTTCTTTACGCTGTTTTTCTTAATGTACCAGGAG
ACACAGCTCCCACCTTATAGGAGAAATATTCAAGACCTTTTGTGTGACTCGGGTATCTAA
CTTCTCTACTTCCTATCCTCTGCATAGTATTAGTAATTTTACTGGGTTGCACATGCTTAT
ATTTGTTAGTTGCTAATTGCAGGTATGATGCCATACCCAGAGCCTTTTCAGAGCATGTAC
CAGAAACGGCGGTTAGGTACCATGGGTATTGAGTGGCGGCCTCCCTCTGTAGATTTTGCT
GTTGGCCCCACGTACAATGCAACCACTGGTGAATACCAGATCATCCCAGTCATTGATCCA
GATAGGTGGGAGCCACTTCCAGAGATACCGGACTTCTTTGAGCTTGAACCTGAAATTGAA
GTTATCTCTGATGATACTGATTCTGAGTACAACGGCATGGATGACAAGTCTAGTGAAGGA
GAACAGGAGAATTTGAGTGGTGATTCCTCTGGTGCTTCATACTCAAGTGCCGAGATTGAT
GGGAATAACCTTAGCGATAGTGCTAATCTTCGCAGATCTAGAAGAAAGAAGAAAAAATCG
AAGGTAAGAGGCAACAATCAAAGACCATTCCACCTTCCTTTATGTTGCAAATTCCAACCT
TTTGACTTGTTTTCCTTTATTACACCTTCTGCAGGCTGGTCTCATGACTTCATCTGGTCG
GCGAGTTAAGAAAAGGAATTTGGATGAGCATGACGCTGCTGCTGTGTCAAGGCCACACAG
AGCTAGGAAGTCTAAGAGTAGTCGCTCTAGTAAAAGGAAAAGATCACCTAAATCTAGGGG
ATCGCGACCTCAAAGACGCGCTGCTCGCCATGCACTCAGTTTTTTAACAAAGATGAGAGC
TTCAACAGATGAGGATGAAGAGGACTCAGAGAGTCTCTCAGATAGTGAATTGAACACGGA
AAGCATTGAAGCTGAGCCGTCAGCATGGTATAGCCGGCCAAGACTTGGTACAGAGAGTAA
CCAATATGATTCAGAAGATGTTACACAACCTTCTCATTTCACTGAAACTCGGGGGAGTTC
TGGAAATAACAGAAAACTGGTCCTGAGGATACCACGCCGTGATTTAAAAGTTGAATTTCC
ATCAGCTGTATCAGTCGTGGGGGGCAGACATGGATCAGTTGAGCCGGAACTAGCTTTTGA
GCCTGGAAGTTCCTCTGTTTGCAAGGCTGAACCACCAGCAGATGGAGGTCAAAGCGTGAC
CTCTGGTCTACATGATGTTTCTTCTGTTCATGGTAACAGCACAATCAAGTGGGGTGAGGT
TAAGCAGCGATCTTCAAAGCGTTGCAAGTTTGGTGACTCTTCCGCTGGAGACATGTGGCC
CTCTTCAAATAATGCAGTTTCACAGGATGGTGACGAGTCTGGTATTCAGAAGACACCTCA
TGAATATGGTAACACCATGCAACAAACGGTTGAGCAGACTGTACAAAAGAGTGAACGTGC
AATTTGTCTGGATAGCATCCATGAAAATCACGATACTGATGTTTATAGTGAAGATAATTT
ACCTGGTGAAAAAAGGACAACTAATAACAATAATGCTCATGTAGAGGAAGTGAACAACAA
AGAAGGCAACCAACAGTCCCACAGTAATTCTCAGTCTACTATTAAACTAAAGTTAGTCAG
GTCAAGAGGCATTCCAGATGCAAAAGGTTCACCGGGCAAATCAAAGACTACTGCAGTAGG
GAGTGACGTGAACTCTGAGTGTGATAAAGTTCCCATGCAGCATGACGAGGATCCTACCAC
CAATCAACATATAAGCAGTGACTTCCCTAGTGTGTCTAGAGATTTCCAGGAATGCACAGA
TAAAAGCACTGGTTATCATGATTCAAGGAAGTTCTATTCTGAACCTGGAAAGACGATTGC
TGTTTATCGAAGGTCAAATTTAAGTAAGCACAAGAAAAAATTGGATTCAGATTCTGGCAA
TGGAGATAGTACCTCCGTCTCCAATGATGATGGTGGGTATAGTCCTGTTGCACCTGGTAC
TGGTAATTTGCGAAGAAGCACAAGGAGGTCATGTGCATACACTGATGGTGGAGCAAGGAA
TGCTATCTCTCATTTGAAAAATTCTTCCCATGAAGCATCAACTAGTGGAAGACAAATTGG
TGCAGATGGGCATGAGTGGGGATCACCATCAAAGACTGCTGGTTTAAGGTCTACTAGGAA
CAAACTTCCTGATACACATTCATTGGAAAAAAAGCCTCAAGTATCCTCAAATTGTTGGTT
GATGTTGTTGGAGCATGAAGATATTTACCGTTACATTCCTCAACATGGCGATGAGGTTAT
GTACTTGCGACAGGTAATGTTATTTTCTGTTTTATTCTGTGATGGGGATGACCTCGGAGC
TTCCCCACATGTTCTCAATCCTACCCACCCCAGCTGAAAGGCAACTGCTTGTGCTTGTTT
TTTGTGTGTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTTTTTTTAATTTGT
TATATTTAATGTTAAAGAAGGTTATAAGGAGGAGGGGGAGAAAGGGGGGGAGAGGGAAAG
GGAGAGGGGGAGAGAGA