Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1559610 (6987 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1559610

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10697 3 3381 bp AK366730 Available Available None
MLOC_10698 5 2292 bp MLOC_10698.5 Available Available LOC_Os04g39180.1, FRAME:-1, EVALUE:3e-142, 13104.m03786 protein nodulation receptor kinase precursor, putative





CDS Structure of MLOC_10697






CDS Structure of MLOC_10698






Contig Sequence (6987 bp)

>contig_1559610 6987 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCTCGCCTTCCCCCCCTCGCCCCGCCGCTGTTTCTCTTGTCGGAGTCCATC
GCGTCCTGCCTCCCCGCCGCCGCCGCCGCCGCGGGGAACCTCGCCATGGCCGCCGTCCAC
CACCCCTTCTACTACCCGCTCCTCCTCGGCCTCCCGCTCGCGTGCCTCTACGCGTGGCTC
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AGCTCCAAGCTGTAAGAGTCCGCATCTTAGCACAATCCGCACTTAGTTTGCATGGATATT
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TTGACCACTTCAATCTCTTGTAGTCTGCAAAAAGGCTTTTTATTTTAAAAATATGATATG
ATGAATCCCTGGATGATTAGAAACTTTTTTTTAGGATAGATTAGAAACTAGTATTGTGTG
CTCAGGTTTGTACGCTTCGTTTGTGACGCCCGAGAAAGAAAAGCTTTGCCTTTTCTTCTT
TTCCTTTTCTAACTCTTGCCCACAGGTCACTGCTTGTCTGCTTGCCAGCTTCTTTGGAGG
CAGACAAGAAAACAAGCTTAAAACAAAAAGGTACCACATATACTATGAAACTTCTGGATT
CATTTCGTTATTACTTCAGCTAGAATACGATATTACTCCTTCCGTAAAGAAATATAAGAG
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ACTTTCTGGCAAGTAGGGCCAGATTGTAAGGAGATGATTTGGTGAAAAATTGACATACTG
CTCCCTGGATTTGACTAAGGCACCCTTATTCAAAAAAATGAAAAAACAATCAACCCCCTC
CCACCCCGTCGTCTCCCTTCTCCTTCCTGGTCATCGTAAGGCTCCGGCGAGACGGCCTCC
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CCGGTGTGGCTGCCCACGGCTGCTGCT