Map Locations of contig_1559411 (8384 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1559411

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10588 1 931 bp MLOC_10588.1 Available Available LOC_Os02g14059.1, FRAME:-2, EVALUE:3e-106, 13102.m01568 protein ribosomal protein L5, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_10588






Contig Sequence (8384 bp)

>contig_1559411 8384 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCCGCCGCGTCTTCCAGCCGGCAGGTGATGCCTAGCCGGTCAGACGACTTGGGCCTTGA
GAATCTCCGCGCCTTCATGTCCATGGGACCGGAAATGAAGGAGCAGGCTTGATGGGCCTA
TCCCGTGGTTGTCCCCCTGACACTAACAGTGGAACGACAATAATTTGTGAACTGAATGTG
AAGAACAACTACCGAATGAGAACTATTTCATGAAGAGGGAGATAGAAAACTAGATTATTG
CATGGCATTTGTAGTGAGAGAGCTTGTGTTAATGGAGAGCTCTATCCACCTCTATTTATA
GTGTGGGGCAATGGATAAAGGTCACTTGAAAATACCAAAGTGCCCATGATTTATGTCCTT
CATAAGGGCATAATGGGGTGGCTAGTGGAGCTCCATCGAGGAGCTCCCTCCATGGCTCGC
CACCATGTGTGGGTCCACCCAAAGGGGGTCCCACCATCCCATGTCATCCCCTTGAATTTT
GCGACAAAGCCCCAAAAGGTGACTTTCCAAAAGCCACAAAAAGGGGTTGTACCCTAATAC
TATTCACATTACTATTTATACTCATATTCATGATTATTTTTTCATGAAATATTTTCAGCG
TCTGTATTCCAATAAAATTCTCAAAGGTCCAAAACTTTTTCGGGACCCCCTTAAATAATT
TTGAACGCGTTCAATATATTTCTCGTATGAAGTTTGTGTGCAAAACATTTCTTGTTTTCT
CTTCGAAATTCTATTATCGTCTTTGAAACTTTCTCAGAAACAATCTCTCGGACTCCCTAT
CTATTACTTAGTAGAATGATCATCCTTAAGTGTGTGACCTTGTTGGTTCGATGAAGTATA
GACATGACCGGAACTCTTTCCAGTAAATGATCAATATCGGAACCCTGCACATCCATATTG
ATACCTATACACACACGAATGGATATTCGAGGGAACATTTAATTACCGAATGTTGTTCCT
GATGCTTCACAATATGTTACAAATACCCAAAGTGAGATTTAGTGGAATTACCGTGAACCA
ACAACTTGTTCACTATGCGAGTTTCTTTGTTATCGATTTTGTTCTCTTTTCTTGTTCGGG
TATCCCTATGATCAAATCACGTTGCGTCTGGCTAGACGATGATGGATACCGTAACACCAA
GAGGGCTTGAAGAATATCTCTCCATCGTTGGAGGAGCAAACCCCAATCTTAAGCTTCAAG
TACCTTGTCAAACTTTTCCATGGACCCGAAAGCTCTCGTAACAGCCACCATGGCGTTTAA
CTAAACCCAAAGTTCATGAAGAAGTATGAATGAAATCGATACTCTCATGGTCTAAGGAAT
TATACAAACCCTAATTTCCTCTATGTTATAAAACCACTAACTTCTGAAGAATGTATCTCA
AAGCATACCATCAGTTTGGGTCTATTCAATAGAAGTGTTCTTCTAACATTGTGTCCTTAA
AGTTGTCGGCATAGTCATGCCAATGATCTGCAAAACATGATCATCATGCAACACTTCAGC
TAGTCTTAGAACCACGACTAGGAATATATTTTACCGTTTATTATTCCACATGTGCATATG
GGTTTCCTTCTAAGGCTTTATGGATATACACACTCAAGGACCAAAGCAGATACGAAATAT
AAACTTTAATCACGAACTAGGAGATTAATAATAGATGTTATTGTTGCCTCTAGGGCATAT
CATGGAACACTCTTTGGAAGGTCATGGATGAAATGTTCTGACAAAGTTGGACGCCAAAAA
AAAAAAAACTGGATGAACAGTAGAACATTTCATCCAATAATTTTTTTTAGAGGCATTGTT
GGATAAACCGTGGCGGCATGAAAAATCATGGGACACCCTTTGTAAGGCCATGGTACCGGA
AAAGTTGAAAGTGTTCTTATGGAGTCTCACACATCACTCTCTCCCAACTGAGGATGTGCG
GAAACGTAGGAACTTGGTAGTGGGCAATGCTTGCAGCGTCTGTGGCGTGCAAGATTCATG
GAAACATAGCTTCATTGAATGTGCCATGGCAGGGTGCATCTGGACACTTATGGATTCACA
GTTATTGGAGCATGTGATAGCAACAACGGAGCCTCTTGCAAGAAATTGGTTGTTCTTGAT
GATGGAGGATTTACCGCATATGAGTTGGCAAGGATGACAATTAGTGAATTACCTTGTTGG
CAATTTGGACGACGAAAACGAAGCTCACTTATGAGAGTATACATGAGAGTCCTCTTTCCA
CTCACCTTTTTGTCACAAGGTTTTACTGCATAACTCGAAATAGTTCATATACTATATTAC
TTATTTTTCTAGGATTGAAGGTCTCACAATCAACTGAGGTCTTGAATTGGAATTCGATCA
TCCAATTTTGATCGGGTCAACAATTTTTCAACAAACTATTCTATTCAATTCTTTTAATTC
ATTATGCTCCTTAACTTTGAAGCTTTTTGATTCGATTGAGCTATTCGATTTGAGATTGGG
TTCATGATTTTGACTTGATCAACGATTTTTTAAATTAATCGGGAGCAACTGACTTATAAT
AATATATCAATCTCGTGCACCCCTCGCCATCTAGAAATATATTATTGTAACATGAAAATA
GTACATGCACAAAGTGACGCGGATTATTATTTTTAACGTAAATATCGGTTGATTAGCATA
TAACATGGAATCACACCATGAAAGACCCATCAAAACACTGAATTACAAATAAGTAAAAAA
AGCATAGTCCATCGTCTCTCACACTAGCCAAATTAAATTCTCCCTCGGTTCCAAGATATG
AAGTGTATTTTTTTTTTGAAAAGTCAAATTTATTTAACTTCGACTAAGTTCGGAGTAAAA
AATATCGACATCCACAATACTAAATAAATAAAATATGAAAATTCATTTCATGATGAATTT
AATGATTGCAACTTGATATTATGAATATTAATATAGTTCTCTACAAATTCAATCAAATTT
GAAGAGTTTTGTCATTTAAAAAATCTAATACACTATATTTTTTAAAAAACAGACTGATTT
ATTTTATAAACACAACAACACCAAACGATGCAGCAATGCGCGCTCAATCCTTCTAGTAAC
AAAAAACCTCCACATATCAAGATGAATGATGCTGCAGATCGTGATAGTACATATCTAGGG
TCCTCAATTATAGTCATCAATGGCCTTGTGGATCCTACTGCGTTGGAGGCTATTGCATGT
AGAGAAGCGCTCTCACTGGCAGACGATGTAGGCATCCAAGATCTTCACATTCCGTCAAAC
TGCAAGGACGTGGTGAATCATATTCATGCCGGTGTTGGTGGCTCTTATAGTGGAATTGTC
AAGGAAATCAAACGGACGATGGGCGGATTTAATTCATGCACTTTTGTTCATAAACTTCAA
GCTCATAATTTTGAAGCTCATAAGTTGACTAGGGTTCTGTTTAGAACCACGATAGATTAT
AATAATCTGAATTATGAAGACATATTATATAATCAAGTTTATAAAATTAATCTAGGTGTG
CATGTTTGGAGGCCAGATTATATAAATTGTAATCTAGGTTTTTACACTGCATAATGACTT
GTCTGACCTATGCACGCGCTGATGAGAAAAAAAGAAGGGTGGCGGTGGCAGAAATTAGTA
ATTACCTTTAACTTTATACAAGGATAATGGGTCATTAACAATTCATAATCTGGTTTTATC
GGAGGTAGAATAAATTATGAGTTTTTAATAATCTGTTCATCTAATTATTATGATTTATAA
CATAATTTGTCGTGTTTGAAGACAATATAGATTATAAAAACTGAATTATCATAATTTGAG
TGGTTTCAAACAGGGCCTAGCCTTGGAGTCTCATGACTTGTTTGAAACTGCTTCATTTCA
TCAAAATCAGCTTCACTTCATTAAATTCACCTTGCAGAAGCTATAGCACTATTAAGAGAA
TGTTTGGCTTTCATCTAGCTCCAGCTTCAAAAATAGAAAATTTGGTGGAAAGAATCTATT
TGATTGGTTGAGGGGAAAGAAATGAAGGGGTATCCACTTTTTGGTTGGAGTGGTGGGTAA
TTTTTTCTCAACTCCAGCTTCTAGTCTTTTTTGGAGCACACTCTCAAGAGCTTCATAAAA
ACTTTGAAGTTGTACCCCAGACTCTAGTTTTTTTTTGGAACAGCATATCGTGGAGCTACC
CCTTTGGCTTGTTTTTCTGAAGCAGAGCTGAATTTTAAGAAGCAGAGCAGTTCCAAACAG
GCTCTCATTGTCCTCGTGATTCAAATGTAGTTCATGTAAACATTGACAATGATTAATAAA
GCCTAGAAGATTTTGCTTAAAAAACGAGGAATATGGAGACAGAGAGAGCCACGATATCTC
AGGAGAAGGAGACGGCGCAAGTTTGGGCGGGGGATCTCAGCTTCTCGCAACATCGCAGCT
GAAAGGGAGGGAAGATCTTGACTGGTTCAGGTTTGGGGGCTCAGACCAGAGCTGTTTGGT
TTTTGAACTGCTCAAAAAATGATTGAAACAAAAATAAATATTCAGGTACCTGACGCGTTC
GTGCTCCATCAAAACGAAAATTCTCAACTTATGAGCGAATTACCAAAGCAATTAGCACAT
GCGTCCAGCTAAGCTCCCATAAAACACTGTAAATTTTGTGTTGACCGGGATTCTTTTTTT
ATCGACAACGATTTCTTGCTCGAGATTTAGGACGATGCACAGAAAAGAGTATAGTTACAA
ACCTTTTCAAGGATAGACAAGACTTTCGTGCTTGCAAGCATCTGCTAGGAAGTGAATTTT
TTGAAATTTAACAGATGCTGAACCGGACAAGAAGATCAAACAAACGCAGGTCATCTCATG
CGCCAAACATATATCTATTGTTGAAGAGGATAATAAAACAGACTGGGCCTCTTAGACGAA
AGTGCAGATCAAACAGAAATCATCCAGCTTGAGTACAGGCAAAAAGTGACAAAGCAGGTT
TCTAGGTAACATACATATCCAGCAACCAGGTGAACTTAATTAACTCAAGGTCTAGCGATA
GCTACATCCTTCTTAGCTCGCATGGGACTTGTTGAGGATGACACCCTCATACTTGACCTG
GAACCACTTCATGGCGTCCTCCTTGGTGACCCTCTGGTGGATACCGACACGGGCCTTGCA
CCTGCGGCGGCGGGAGACACGGTACCCAGCACGCTCGAGCACCACGAAGAAGTCCATACC
ATAGATGCCAGTAGATGGATCGTACCTGAGAAGGAAACATGGTTAGCTACTGGTCTTTCA
AGAATTGGCATTCTTCATTGAACAACCATTGTGCACTCATATGCTGGTGTGTTATCAGCA
AACAGACAGAACCATGTGCTGCAGCTACTTGGTAAATGAAAGTAGTGCCCCAAATCCAAA
GGTTGAGAAGGACCTAGGCAGTGGCAACACAATGTGTATACAAACTATATTTAAGCAGTG
ATTTGCACTATTAAACTGAAAAGGAATAGTTATCGACAAGGATTCCAATAGATTGTCAAA
TATTAACAGTGCCAACACTAAGGAACCAAAAAGACTTGCATTGGTCATCTCTGACATACA
AATATGTATGTTGTTAATTGGACGCTTGAGAACCAAGTCAGGATTTGGCATGTGAATCAA
CTGAGAAAATAAATCCAAACTACCAATGATGGTTAAGCCAATTTCTAACAAATATTCTAG
GCATTACGAGATAATGAGTGCATTAAACAACTTATTAGGAATTTTAACTATAAGAGTAGA
TGACTGATGATGATGTAGCCCTACTATAACTTCAGCCAAATATCTTTCGGGTCTATGATT
TTGGTTTCAGCTATTTAATAATGAAACAGAATCATCTATTATTAATAAGTAGTATTAACC
AGTAAAAACAAGCACCACACTGACACAGAAAAGTGCTGCCACCAATTCAACTTACTTCAT
GCCGAGATCGATGTGCTCCTGGATACCGAAGCCAAAGCACCCGGTGTCGCTGAAGTTCCT
CCTGAGCAGCTCGTACTCCTTCACCTTCAGGCCACTCTCCAGCAGCTGCATCGCCTTCTC
ACCCCTAATAGTAACGTAGCACGCGATCTTCTCATTACGCCTGATACCAAAAGACCTGAC
AGTGTACCTCGCTGCAAAAGCACAATATCATTCCTATTAGGACCACCAACATTGCCCACA
CTTGACATGGCCAAAGGGGAACAGGGCAGATTTAAGAAACTAACCCTTGGAGAACACTGG
TGATTGTCCACTCAGCTGCTCCAGCACCTATCATGTAAACAACGAAAATGCAGTTAACAT
CAATGGTTGGCAGTTAACCTGTGTTTTTCAGAGACCAGGAATGCAGAGAAATCTCCAACT
ACTTGGTGCCACTCAGAAAACACGGATTAAGGTCAATCTACAACCAGCGAAATGGAACAG
AAACGATCGACCACATAGAGACAACAATGGTTACATGGTAGCAGCATCAGCATCAGAAGC
CGATGCATCTCCGACTAGGAAACTACAATGGACACCTCAGATAGAATAGGCCAGTGCCGA
GTTCGGCTAGATACAATTCCACAAACTAGAGCGCTAGATCTCTATGAGCGGTAGGGTACT
AACCACCGATATACTGACACGTGCAAGGAGCTAATCTGAATCGCACACGCGCGAGCGCAT
CAACGAGGCGAGCAGAGGGTAAATAGACAGGCAGGCATATATATATATATATATATATGT
ATACCTTGGAGGCGCGGGTGAGACGATCTCCGCTCTCACCGACGGAGATGTTGAGGACGA
GCTTCTGCACCTTGATATCCCGCATGGGGTTCATCTGCTTCTTCTCCGTCGACTGCGAGC
ACCAAAACACAAACGACACGGCGTCGTCAGAACACAAGGAACCTGAGCAGCCCAAAGGAT
TTCGAACGATTGACAGAGCGGAGGGGAACTCACCATGGCGGCGGGATCTGGGGAGCGGCG
GCGGCGGGGGAGAGAAGAGGGGGAGGTGGAGGGGGGAGAGGTTTAAAGCGTGGTGAGGGG
CGGCGGCGGCGGCGGCAGGGGATTTGTAGGGAGGGGAGGAAACCCTAGCGCGAAGGGCGC
TTATATGCCTGCAATTACGTCTGTGCCCCCGTGTGCGGTGTCGAATGGAGGGTGGTTTAG
TAATTTTGGTTAATCTGGCTTAGGAGCGCAAAAAAATGGTAAAATTTCCGTCGCCGGGAC
TTGAACCCGGGTCTCTTGGGTGAGAGCCGAGTATCCTAGCCACCTAGACTACGACGGAGA
CTGAGTGTTAACTCGAGATTTTCGTTCAAGTTACACACATCACATCTTTAAACGATTTAA
CCTGCAAGACTTTAGTTTATCTCCTAATTTTCGGCTGATTGCCACTTAATGTGGGATCAC
ATCTTTAAAAGTCGAGAGATCGCTTGGTAGCTGGTGCGTCCATTTTTCTAGGGTTTATTT
ATTCCCTCACCGAAATAGTGTAAGTAATGGACGTTTGCAAAATCTAGAGCTAATTGCTTA
CACTTTTCACCATGACCGCATCAGGTCGAGCATAAGCATTAGGGTTTTGCACAGATTCCA
TCACAAATTTGTTGTTTGATTCAACTAGAGCCTTGTTGCATCTCATCTTTCCAACTGAGT
ATAGGTCGTTACGCATTGCTTTTGTCTACATTGAATCACCACTCCTATCCCGAGGGATGA
ACCAAGTTGTTGCAGCGGTAAACTTTCCTCGATTGTGACGAGCAAAGTCTCGAATCAAAA
GGTTGCACCAACATTGATTCTTATCACATCACTAAGCACACATTTCCACGTGTGATCATG
GCTCCGTTTCGGCCACTTGTTCGTATGTGCTCTAGCGAAGTTAGTAGCTACAACTCTGAT
TGATATAGCATCTCTATCCGAAGTTTGAATTGCTTTGCCATTCGCGTGTCGCTAACGCTG
CAACCACATCTGATGTGTACATTTTGCTAGGGTTTATCTATTCATTTTTCTGTTTCTTAG
TGGTGGGCTCAGCTCTTTTTTTCGAGCGGATTCTAGTGATGCCAACTCCTTCGATTAGGG
ATCTGGTTGGCGTCCTCTCCGCCATGAACAATTTCAAACGGTTTACATTATCTCTTTCAA
AGCGCTAATGTCCTCTCGCATCTTTCTCTTTGCCACCTTATTTAATCTTGAGCTCTCACT
CTACCCGCATCTCCTTCTTTTCTTTTACGCACAAACAATTGTCGTCTTTTAATAAACATC
GAGTGTTGCTATGCCCATGGACTTCAAGCGATGTATCGCATGTGGTCGTGGAGCGCTGCC
TCTCCCCTTGGCCACTGATACGTCCCAAACGTATCTATAATTTTTGCTTGTTCCATAATC
TTTTGGATGACATTGGTATATGTTTTGCTNNNNNNNNNNNNNNNNNTACACATATTTGGA
CTAACCTGCTAATTCAGTGCACCCAATGCCAGTTTCTGTCTCCT