Map Locations of contig_1559139 (10512 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1559139

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10465 2 1297 bp MLOC_10465.1 Available Available LOC_Os02g55640.1, FRAME:+2, EVALUE:9e-83, 13102.m06382 protein proteasome maturation factor UMP1 family protein, expressed
MLOC_10464 2 1507 bp AK370773 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10465






CDS Structure of MLOC_10464






Contig Sequence (10512 bp)

>contig_1559139 10512 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
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GATCCCGCCCGACAACCGCATCCCCGCCACCATCATCACCGGCTTCCTCGGCTCCGGCAA
GGTCGGTCAGGGCGCCCCCAAAACAAAATCTGTAGCCCCTACCATGCGCCCGAGCCGTAT
AGCATACACGCCGCTCTCCCGCAGGGATGCTGGGCACTTGTTTTGCCAGATTACCGTATT
GCTGTGTATCTGCGTTAATGGACTTTAGTACAGTGGAAGATAGGTTAGAGCAGCACCTGG
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CTATGAGCTTTGTAGCACGGATTGGCAAAGGACAGTAAGACTGATCGTGCAGGTGTAGCT
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TTTAGTACGAATGATTGGTGAATTGGTTGACAAGAAGAAGGGAAAGTTTGACCATCTTGT
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TATCACCCTAACTTTGAGAACTTTAATTTCTTAGCTTTTTTTATTGCTTTACAATGTGCA
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TGAGGCAGTTCAGCAAATTGCTTATGCTGACAGAATTATAATTAACAAGGTAATGTTTTT
TGTAACCAATACATGCTGTTTAATGTGTAGTCATGTGTGTCTAACTACGAGGCCCTTTGT
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TGTTAGCGAGCCTGAAGTTTCTTCCTTGGTTGAGCGTATAAGGGTCAGTACAGTACATTC
ATTTTACTCTCTCTTTTTGCCATGTGGTTATTCCTTACATTACGTTTTTTGTGCCTGCAG
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TCTTGGGTAGAATTAACTGGTTTAGTTGGGTATTTACCATCACCAAACAGCGCACGCCAC
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GTTAGACTGAAAATTGTGTCTTGCATTTTTATGTTTTGTCAAGATAGCTAAGATGAATTC
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GGTATTTGTTACTCAAGCCTTTAGTTTATCCAGTTCAATTTATTCTCCTGTTCTGGTGAA
TGCAAACTAATCATGTCTTCTTTAGTGACTTATTAAATGATACGCTGGGTCCAAACAGTC
TTAGAAAATTATTTGTTGGTAGAAAAGATGTGTCTGTTTATAAAACAAGCAGCTTGTCTT
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TGATGGTAGTGTCATTTCTTCACGCTCACAATCTCTGCAGAATTTAACAAGATAATCCAC
GCTAACAACCACTCCTTTTCAATAGAAAGGAATAGCCAAACCTACCCAGCTGGCTGGTCA
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TGCTTGATCTTAATGGTTCTTGAATTTCTACTCCTGATCTAAGATCCTTTTTTTGTCTAA
CTCCTGATCTCTTCAAGGCCCATGTTGTTGATGCTAGAGTGTCACTGGACAATTTTTTTC
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GTGGGAGCCCAACGAACCGCGCATCAACAAGATTGTGTTCATCGGCAGGAACCTGAACCG
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TTGTGCACGATGTTGCACTGTGACTCGCAGAGATTTATAGACCGCCCTGTGAATTGAAGA
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AAAACTCATGCTGAAGTTTAAATGTGTTTGAAATCGCATATTTCCAAGCTCAGTTCTGAA
CTGGCGACCTCTCTCTCCACCGCAGCTAATCACCCACCTTCGTCACATTCACCCTCCTCC
CTCCTGACCTCCGTAGGTGACTGCCGTCAGCGATGTCCTTCCCCATGACCAAACCTCTTC
CCTACCACCGTCCTTCCCCATGACCAAACCTCTTCCTTACCACCGGGACATGCAAACAAC
ATCAAAGAGCTCGTCTCTTCTCTACCTCCACACCGTAGCAAGTCGCCCACCATCGAAGAT
ATTCACTTTGTTCGATGACGACCACATGCCAACAATTCTAAACCGATACAAGAAAGTTGT
TGTTGTTATAAAATTTAGATACTAAAATAGATATTCTGTGTGCGAAAAATACGAAAAATC
CGGAGTGCCTTCTGTATGGATAAAAACCAACGCAGGGAAAAAAACAAAAACTTGGGCCTC
ACGACGGATTAGGCCCAGGCACTACCCGAACGGGCCTATATCATCTACCAAGCCCAGACC
AGCGGCCCCCCAGCCTTCTTTCTTCTCCGCAAAGAAAGAAACCACGACCCGAAAGAGGAC
ACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAAAGCTCAGCAGCGGCGATGGCGAGCGGCG
GATTCATGGCGAAGAAGGAGCTCGGCGAGACCCACGACGTGCTCCGCTTCGGCGTCAACG
ACAGCGTCCGCGGCGACCTCGCGCCGGCGCACCCCGTCCAGGCCGCCATCCACAAGGTAA
ACCCTCTCTCCCTCCCTCCCCGATCTGCCCCCGCGAGCTGAAAAACCCTAGCCCTGAATC
CGATTTGTTCTGTGGGTGCCCGCGCGCGTGCGTGCGTGCAGGAGTCCAAGTTCTGGGACG
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GTGTTCATATCTTGTGCTAGACTACTTGTGCTAGACTTTTCGTTAATCTCACTTTCGAAC
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TAGCAAAACCTTGACAAAATCAATTAAGCTTCTGTTAAAGGAGTTGATCTAGAGTGATTT
CCGTTTTGTTTATACACTTTTGAACGTCGTTTTTCCTTGTCCTCAGTTTTTTTTCTTTAA
AAATATGTAGGCGGTAAGCTCTTTTGACTTAACGGCTGCTTCACACTAGAAACGTTTGAT
TGATGACTTCTGTGTTTCCAGGTTCCAAAGGCCCCCAGGTGCATTGCCATCATCTATGCT
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AGCTTCCGTGCAAAACTTGCTAGTTATGACTTATGAATTGATTGGTTGGAGTTAGGAAGA
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ACAAGTTCTTGGGAAATCAAGATAAGCTTTATTAAAATGGTTCTGTTGCTAATTTTCCGC
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GAATCTCTTCATGAATAACCAATAACAAATTGTTCGACAATTTTGTCAACCAAGCTTGTG
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TACTCCAGTAGTGCCTGTTTTTCATCCACGTTGATTTTGACAAAATCTTCCTGCGCCCAT
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GTTGACCGTGCGTCAAACACCCCACCGACACCCCAATCCGATCTAGGGTAGCGCCAGGCC
GACGGGAAGCGTCGTCATCCTTTCGCCCATTCTCGGCCATCGCCGCCGTCGCCATCCACC
ATGGCATCAGCTCGGGCTCCTCGAGTCAAGCAGAAGGTAAACCCACCGTCAATCACTAAG
CCTATCCGATCCACCAAAGTCTATCAAAACCAACAAGCAGCTGCGCAGTGTAGGCCTGGA
TTTGCTTGACCTGTAGCGAGAAGCCTTGCTTGCATGAGGCGCCAAGGATAGCACTAATTG
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CCTTTTCTCGAGCACATTTTCAACAATAACATAAGATTGCTATAGGCACAATGGAGATGA
TTTGAATGTTGCCATTGAAAAGGCCAACACGGATATAACAAGACCGGGGCCCGGTGTTCC
TGCCTCTTGTGGATTAGTCTAATCGAAAAGTTTATTTCCTTCTAAAACGCAGGTTAGTAG
AATTATGGTGCTGTTGGGGGGAGGGACTCGAGGTCAGGTGTAGGCATGTAGCAGCTGCGT
GAGAGGATAGGAGGCAGTGGTCAACTTCTCTCACCAACTAATTATTTGACATTTGTTCCA
TCCTTGTGTTTATCCTAAACAAGCAAGGCCAGGTGCGTGCTACTAGTTATAATTAACACT
AGACTTTGGCAGGAAATTAGTTAAATAAAAGTAGTACGTAGTAGTCGCACCAACTAAGAT
TTGGTCTAACTGTCATGATTGTTCGTGCTTCATTCAGACACAGGTATTTCCGTTCTCATG
GTAGATTAGGCTGGTTGTAATGGGGAGTATCATGCATATGATACTAGTATATGATACTAC
ACCCGTAATGCGTAGTACTCCCTCCGTTCCTAAATANAAGTCTTTTAAGCGATTTTACTA
GATGTCTACATA