Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1558988 (4406 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1558988

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10400 2 922 bp MLOC_10400.1 Available Available LOC_Os07g47780.2, FRAME:-1, EVALUE:4e-120, 13107.m05102 protein 60S ribosomal protein L18-3, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_10400






Contig Sequence (4406 bp)

>contig_1558988 4406 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCGCCGGCGACCTCGGCGCCGGAGGTGGCGTACGTGCCGCAGCTCTGGAGCTTTGACAG
CATCAACACTCAAGTGCCTATGTGATAGATATAAAATGGTCTCTTCTGCGTGTAATATTG
CGTTTGCCTAATTATTATTCAGCATATGATGAATTATTTTTGTTTTTTTTACGGCAACTG
TCTCCGTGTACCAGCAAATACATCCTCGTGGCCAATTTATCGTCAAACGTAAATGATGCA
TTACATTTGAAAACTATAACATCGCAATAATGAGCACAAGCGGCAGAACACAAACCTCAC
TGCCAAACAGAGAGAAATTTTGGTGCTAGAAATGATATTCATAACTGGCTTGCAAGCATG
GTCTCAAGTTGCAAAACAACGAAACACGAATTAACTGGTTCTGAGAACTCATTGACACAG
GACACTGACATCTAAAGCGGTATGATTCTGGTACCCAAAAAGGTGATGATAATAAACCGA
TAACAGCAAAATACGACACGAGGGTGCCCAAAATTCCACAGCTTAAACCTTGAAGCCCCT
GCTGTTCCTCCTTCCTCTTGCCTTCTCGAATTTCCTGCCCTTGGAGCGGACATATGGCTT
GGTGTGGCTGTGTGGCACTCCTGGAGCTTTGCCAAAGTGCCTAACAGCTTCCCTGGCGTT
CTTGGGACCCCTCAGGAGAAGCTATAAAGAAAAATGTAAATTGTTAAAATGATTGTACAT
GGCATTCTCATGAATATAAGCCTCAAAGGCATGCAGCTAATACTGAGGCTCATCGGCTCA
TCGCTGATTTATGGGAAGGGAGGAACCATCATCATACCACACCTTGGCACATCTCAAAAG
AGAAGGAAAAGGATATCATAAATTGGAGAAAATGTCTCTACATAAGTACAATGTCAAAAT
TTCTAGCATCAGTAAGCATGTACTAAAGACAAAGCACCATAGTGACAATACAATGAAATC
ATACAGATAAAGTCACGAAGGAACAGTGCAAGAATCTACACACTGATTATCATGTATGTA
TGAATCAATACACATTTACATTAATGTTTATGCAAAGAGAACAGATTCAAGTTTGAAACA
ACTCTTAAACAAAGGAAAACATAGGGCATAAAGACTTTTAACCAATAATGCAACTACTAC
CAATAAAATAAGCATACGCACCATATTTGAAGTTAAGCTTGACTTTCTTTGCGAAAAGAT
ATAGTAGTTTAACAATCATCAATGACTTAGTTTTGGTTTGAAATTGGACACCAGCTGTCC
AGCACAACCATGAAAAAAGTGCAATGTACGTACACCATACAGATTTAGACAGGTATATCA
ACTTTGTTTACATGTACTCTTAACACCTGACAAGAGGGTAACCGATGAATCATCAGAAAA
ATAATAGATTGTTCCTTGAATACCCTACCACAACCTACACATACAAGTCTCTCTGTAACA
CAAGATGAGCATGAAAAATAAACTTGGTTTTCTCCACCTACAGGAGTCTTGCATACTTAA
TAGTACAAACTAAAAGAATTACATGCTTCAGTTGTAAATCTTTGGATACCAACTCGTGTA
ATAAGGAATGCATCAAACAGCACTATTAGCAAATACAGTACCTAAAGAAAAGGAGAAGTC
AAACCATACCGTGTTCTGTCCAAGCGGAGCACGGAGGGCGAGCTGGTCAAAGGTAAGGCA
CTCGCCACCAGCGTTGACAATCCTGGCCCTCGCCGTCTCGGTGAACCTGAGCGCGGCCAC
CTTCATTGCCGGTATCTCGTAGACCCTCTGGTCATCGGTGATGGTGCCCACGATCACAGC
GATCTTGTCCGCCTACACCCGCACAACCACAAACGCCGCCCAGGTAAGCTTCACATCGAT
TCATCCAGCCCGAAGATTAAGAAAAAATGGCACAGCGAGAGAGAGAGAGAGAGGGATACC
TTCCCATCCATGAACCTGACGAGGCGGCGCATCGAGAGCGGCGGCCGGTTTGTCTTGCTC
ATGAAGAGCCGCTTCAGGATCACGGCGTTGAACTGGCTCTTGGTCCTCCGCACCAGGAAG
CGGTAGAGCTACGAACAGGAAAGCGAATTGCGGTAAATCTGAATCCCTGAGACGGGGATT
ACGCGGTAACACCGGATCGATGGGGGACTGACCTTGACGAGCAGCTTGAGGTACACATCG
TCCGACTTGGGCGCCGTGCGCTTGGTCCTCTTGTTGCGGCCGCCGGCGACGAGGTCGATA
CCCTGGGTGCGACGGGAACGGACGGTGTGAGCCTTGCGTAGAGTTCAGGGGAGAACGACG
AGGAGGGAGAGGGGTAAGAGATTACCATGGTTCCGCGGTGGTGGATGCAGCAGCGGCGAG
GGTCGAGGCGGCAGCGGCGGCGGCGGGACGGGTGCTAGGGTTTTGGATGGAATGAGATGT
GGAGTCTAAATATGGTGTGGACGGAGAGTTATTTGGGCTGGGCCTAAATTGGTGGTCTTT
GTTTCTTTCGTTTTAGCCCAAATAAGCCTGCCTCTGCCTTAACGGATGAAAGGTTGGTAT
CGGGGACGAGGGTTTTGTTAATCGTGCAGCCGGAAAACCCTATTTGCCACTCTTTGTTTC
TGTTTTTAAAAATGTTTCTGTTTGTAAATTAATCTTTTTACAAAGTTTAAAAATGTTTGT
CTTTCACAAATCACTTGGGTATTTTTTTTTAAATAAACGTGTTCAAAATTCTAAAAATAT
ATCGGATCTGGACTGGATGTTGCTGACTTGCTTCTTAAAGTTTTACGCTCCTCTATGTTT
AATAATCTTACGTAGCTCAACCGGTAGTATTTCATGGTATGTTGATTGAGACCATGTGTC
TTCATTCTATGAGATGGCGGTTCTAATTTTTAGCTTTTATGAGCAGTACGACTCACCGCC
GACCGTCTCCTTCACGGGTCGGCTCAGGCAAAGACCCGACTATGCGAAACTGTGACTATT
TGCCGTAAAATGCGGCGCATAGGAGCTTCCGCTGTAGTCGTCACTATTGCAAGGTAATTT
TTCATCCCCTCGCCTCTGGCTGTCATTTTGGCGTTGGAGAGGTGAGTGATCTTGCATCTT
TAAGAGTGTTACTTTTTTGACATCGTCTAGTGATTATTGTATGTTGTGAGAATAGATTAT
TTTCAATTTTTTGTTGTACCATGACGTTAGAGAGTTTTCAGTCCTCGCAGATTCAATTAT
TCGGGTCTAATAAGGTTAGGTTGGTGTGTCAAACCTTTTTTGGGGGTTTGGTTCTTTGTG
AAGTTGAAATTTTACATCAACACTATGTTGAAGATATTGTGATCCAACGTTCTGCATTCC
CAGGGGATCATCCCCGGCCCAAGTATGTTCATTGATGAAGACCTTCCATCTTTCTGGATG
GATGACTCAAGTCGCCTTAAAATATCATCATTGGTAATGTTTTGTGGCTGAAACAGTAAC
AACATCGTTGCTCCAGTCCAATTACAACCTCTCTAGCGAAGTTTTTTGAGTATCTCTTCA
AGCATAGATTGATACAACGAAGAAGGTGCTTTCAAGGAATCTCACTGTAATTTTTAGTCA
TATGAGTTACTTTGTATTTTTTAGGTCTTAGGTTCATATCAATGTATCTGTAACTGTTAC
GAGTATGAATAAATTTATAGGTGTTTCTAAACAAACGGATGAAGGGATTTTCTATTTATA
GGGTGTGGTGTTGTGAGTGTGGTCTTTTTTTCTGAAGGAAATGCCATCATGGCTGACTTT
AGTGCGACTCTAAAGTAAAACAAAACTAATAAGTGTATACGTACAATGCATGTCTTGAGA
AATGCATGCACGAGTTAAATTGAGTATTGTGTAATAATATTAAAATAGTGATGTGTCCGT
CCGAGATAATGGTTTTAGTTTTTACCATTAAAACGGCAATGGCGTATGTGTAAAAAAAAA
TAGAGATAATGTGTTTGAATTCAAAAACATGTCTATTTTAATCTTACATTATTCTACGGT
TTTGTTATTTATTTATTTTAAAAAGGCACAAAGGGAGTTAGGTAAGGAGAAAGTACTTCT
TGTAGCTATTTATTTTGCCTTTGTTTTAGGGGTTGGCAGCTCTTAGATTTGACCATTCTC
AGTCGTCCGATGAAGCAGAACTAAAAGCTTTATTGCAACTTAATAATGATTTGATCATCA
ATGAGAAATGTAGCAATAAAACTAGGGAAATCTTCGATTCGAATGGAAGGTTCAGATTTG
GACTCCCTAGCTAAACTATGTGCAACTTCTCGAAGAGTCTGCACAAAATGGGAACAAATG
AAGGATACACTTGTACTTACAATCAACATTTATGCAACTTTTATAGGTTGTTTCAATAAG
GACCAACGATTTGTCTCATCTACTCCCTCCGTTTCTAAATATAAGTCCTTTTAGAGATTA
CACTATAGACTAGATACGGAGCAAAA