Map Locations of contig_1558924 (9702 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1558924

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10369 2 1084 bp AK355136 Available Available None
MLOC_10368 1 721 bp MLOC_10368.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10369






CDS Structure of MLOC_10368






Contig Sequence (9702 bp)

>contig_1558924 9702 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGTGCCAAATTGAGGATGGGATCGCATCTTGGGCGTTACAAAGAATCTCCTCGAAGTTCC
ATGTGTGGGTGTGGAAGGTTGTAGGATTGGGGGGAGTAGATAGTAGTTGGAAGAGGACTA
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CCGCATGCGAATTCTGAAGATATATGTTTGTCAAGATCTTTTGAAAATATATGTTTGTCA
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AGTCTTCAGTAAATTTTCTCAACATTTTCAATAGGACTAACCTAGAACCATTTTCAGGAT
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CTCTAGAAAAACTTACATTTAGGATGAAGGGAATAGATGTATGATGTAAGCTCTTAACTT
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GAGTCCGAACTCCATGGAGCTCGGTTTTGAAAATTTGAACTTCATCAAATTTCATATTTT
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CCGTAGCATTATAGGCGGGATGGTTTCATTTTTGCCGAGTTCGACGACAAAGGCGACCCG
GCGGAGGTCGCCCTTGGCGTCATGGCCATTTGGGCCCACGTACGCGGCCTCCCTTTCAAG
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GCTTCACATTTAGTGGTGCTAAGAATACAATGCAGGGCCTACATAAAAAAGAAAGGAAAG
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AAAAAAAGGAGTTGGAGAAATTGAGGTGTGGGCCGTTGAATGCAGAATCCTTGTCCTCAT
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GGGGATTTAAAAGCTCGAGGACCAAATGAACTCCATGCTATATTCTATAAAATATTTTTG
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GCCAACAAACAAAGCGCGGTAGCTCTCAAATCAGCACTTGATTCATACTGTGCGGCTTCA
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TGGGCTTGCCAGCAAATGTGGGATTAGATAAAACAAACTGCTTTCAATTTGTGATTGAGA
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GTTTTCGGTACGGTCTGCTTACTCGATGGAGTGGGACCATCAGTATGGAAGTAAACTGAG
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CCCAGGGATTTGTGAAACTTAATGTAGATGCTTCTTTTGACCATAATCTGCTACGGGGCA
CGATGAGGCAGTCCTTAGAGATGATAAAGGAAGATTTATTGCAGGAGGAAACAACAAGAT
TGGCTATTGTGCTGACGTATTGATGGCTGAAGCATTGGCGTTCAAATTTGGCCTAACACT
GGCGCAAAGGGCGTGTTGCGATCGTCTTATTATTAACTCGGACAATATGGAGGTTATTGA
GACAATAAAGGATGGAGGACGATCTGCAGGTTCGACGACGGCAATATTCGATGACCGTTT
TCATTACGCGTGTGATTTTGTAGTTACTAGAATCGAACATTGTAATGGAGAAGCAAATAA
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TCTTTCTTCGTATTTATTGCATTTGATTAAAAGTACGTATATACCTAGGCTCTTGCATGA
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CCCGCTCCAAAGCCCTAACCCTAGGCCATCCCCTCTCCCTCCCCTCAACCCTCGTCGACT
CCGCGCGCGCCTGCGTTCCAGGAGCTTCCGCTGCCGGCGGCGCCATGGCCTCAGAGACCG
AGACCTTCGCCTTCCAGGCGGAGATCAACCAGCTGCTCTCGCTCATCATCAACACCTTCT
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CCGCTCCCGCTCCCGCCCTCCGTTCCCTTTCCCCTGTAATGCTCTGATTCGCGGCTCTGT
TTAGATCCGTGCGCGATACGGCCCTTCGCCTTGCCGATGTTCAGTAGATCGCGTGTGTTT
GTCGGTTCGCGACGGTTAGTGGAAGGGATTTCAAATCCATCGACGAATCCGCGGTTTATG
CGATATTCTGTCCTGTCGCACTTCCGATACTCTGTGAGTGGAGCGTAGCCACACATTTGT
TTGTTCTCTGTCCTGTCGCACGTGCGAATCTCCATGATTAGTGCTAATCGACTGTCATAA
ATCTACATTGATTAGTGTTAGTTGACTGTTATAATAGCTTAGGGAACATCATTACTTCCA
TCGTAAATTTTCCTATACGAGGTAGTAGTGAGTAGAACGTAGCTATACCTTTGTTTAATC
CCTGTATGTACTGTCGCACGTGCGGAACTCAGATACCAGAGCTAATTAGACTGTTATAAA
AGCTTTGGAAGCGCTGCACTTGCATTATAAATTCTCCTATATGCGGCTAGGCTTTATAAA
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CCTGCATACCAGAGCTTTAAATTCGAATTCCCATGTACTTTACTCCCTCCGTCACAGTTT
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ATAAAAATTATATCATTACAAAATAGAATATCTAAAGTTTTT