Map Locations of contig_1558888 (9835 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1558888

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10353 7 2216 bp MLOC_10353.3 Available Available LOC_Os11g05880.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13111.m00573 protein exo70 exocyst complex subunit, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_10353






Contig Sequence (9835 bp)

>contig_1558888 9835 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGCAGGCTACCAAACACACCCTTACTTGCAGGTATGAGGAAAATATGGTCAAATTCACCA
AATATTATAGTCAAACTGATAAAAAGAATTATGATACTATTGGATATAGAAACGTCGGAT
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GTCAAAGTAGTAAGATATTTTTATGACTCGCGTATAATGCATGTTCACTTAAATGACACT
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CATTTACTATTTGATGTTTTCTGATGACTTATTAGTGTGTGGGTTGGAAACTATCCAAGA
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GTGTACCGTTTGGGAATCCATTTATGACCATCTCTTTATTCAAATTAATAACTTCACATA
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TATGCTTACACGCTATGCAATAAGAAGGTCAGCTGCAACCGAGTGAATTAGCTTGTTATT
AATACAAGTTTGGAAGAACAAAGACATGGTACTAAGATTCCAAACCTTTGGATGGAAGCT
TTTAAGAAGAACTAGGGATACAAGTAAAAGAGCAGGGTTATTATTTAGCCATATCAGTAA
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TTAGAATAGTTCGTGCCATTAATGAAGCTTTGCTTAATTCAGGTTGTCCTCACATGAATC
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TCCTCCAAATTTGCCAATGTAAGGCACCACAATTAATTTAGATTTACTAAATGTAAGCGC
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TCATCATCGATGCTCCATGATCAAACTCCTCCAGATTTGCAATACAAAGCACCACAATTA
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TCAACAGGTAACCTTTCTCATGGACAATGAAACAATAGTCAAGGCTTTGGTATCAAGACA
ATAAGATCCAATTAGGACACTCGTACTAAGTTCTTATAAAGCATATTTCTCTTGCTTCCA
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GTTAGAGATTTCGATCTCCGTGCCCTCCGGCAAATAAATGTGCAGCAGTTGCAGTTCGAC
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CCGCCGCTATCTCCATGTTGAGCTCATCGAAGAGGGTGTCGGCCTCCTTCTTCCTCTCCC
GGATGAGCCTACGGTTGGCCTCCACCTGACCCTTATCCCGGATGAAATCAAGGATGGCGT
GTTGATGCTCCGCCATCTCCTCGGCTTGGGCGACGACGAACTCCGATTTTGCCTCCGCCA
TGTTCAAGCCCGGAGAAGGCTCGTCCGCCTCGTCCTCCTCCATCGCCTCGTGCATCTCCT
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GAGCCTGGATCTCCGCCTCGATCTGCATCCGGCGCTCCGGCATGAGTATAGCGTACGTGG
TGATCCTACGACGGACCATACTAACGTAGAAGAGTAGGGGAGAGGAGGCAGACGGGCTCG
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GTCGGTCAGTGACCGGAAGGTGTGTCCGAACATTTAAAACGGATATAAGAGGTTCGGTTA
TGGATGCTCTAATACTGCTCTTACATGTGCTTAATGCCCAATGATTTCATAGCCCAGGCA
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GTGCCTTTTGGCGCCTCCCTTTTGTTCGAGAAAAAGTAAAAAAAGGAAAAGGGAAATCCG
TTGTAATAGGTTGGGCCTAAAAACAAAAGCCGGTGTAGTAGGGCCTGCGAGCAAAAGCCC
GTTATGATAAACTAGGAAAGCTAATCTGGACCGTCTGCTTCCGAGGGCAGACCCACACGG
AAGTGTCCTACCCACGCATCTCATAGCACCTCTCCTCCGCGGCGATATGGGTCCACAACA
CAGGCCGGGAGACCAAGGCAGCAAACACCGCCTCTTCGTATCTCACTGTCCTTCCAGAAC
CTTCCGGAAGGATCCCCTCCCACCACCGCCCCTTCCGAACACGGGACCCCTCGCCGTTCC
CCTCCCCCAACCCTCTTCGTTCTCGGCAGCATTCCCTCCTGCTTGAGTCTTCTCTTCTCG
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GGAGGGTGGTTGTCGCGATGGCAACGGAGCTTCCGGAGACGATGGACGCGCTGGCGCAGC
AGGTGAGCGTGCTCCGGGCCTCGCTGCAGAGCAGCCAAGGGAACACGGAGGGCATGGTCG
CCATCCTCGGCTCCTTCGACGAGCGCCTCTCCGAGCTCGAGGCCACCATACACCCCATCC
AGGTACTCTCGTGCCCATTTCCGCTTGGTCTCAACGTCTCGTCGAATTTGAGGGAGAGCC
GCGGGAGCGTGGGGCGTCTGATTTTGGGTGGTGGTGGTGCAGGTGAGGGCGCACGCGACC
CAGATGGCGCATGAGAACATCGACAAGGCGATCAAGGTCGCCGACGACATCCTCGCCCAG
GTCGTCATCGTCCGCGAGGTGCGTGAACGTGCTCTCCTCGTCCCCTTCGTGCCTGAATGC
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GGGCTCTCTGTACATGACTACATGTAACACTGTCGCTGTTCCTTGTTAAGTGATGAAAGA
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GAGAGCGCCGAATTTGTCTTGCTTTGGCATTTGGAGGATGTGTTTGACTAGTTTTGGACT
TGGACTTTCATTAACAAAGATTGGTACGTGCATATTTTACATTTGGAGGTGATTAAAGGC
GCATAGATAATAGATTGGTGGTGAGATAGTTACCATGTTGGTGTAGTTGTGAAGTGCATT
TGTTCTTTTACTAGCAAGGGAATGATTAGCTTCGTTAGTTTTGTTCATGTGGTAATTAAT
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GTTATAGTTGCACTCTTGCACCAACGAATTTTGTTCTATTTCGAGCTATTTTAGACAGGT
AATCACTGTTAAATTAGTTTATTACTTCGTTTGGAACTTTCATTTGCATGTTGTCCTTTT
GAGCTTTAGGCAGAAGCTACGATACTGAGGGGGCCCCATGTGGATCTGGAGAGCTACCTG
AAAGCTGTGGGTCGTCTGAAAGACGTTGTTGGTTTTTTCTCCTTGAGAGACAACTTTACG
AGTAAAGAACGATTTCTGAATGATGTAAACGTTCTCTTATCTAAGTCTTCTCTGATGATC
GAGGAAGAATTCAAGCGGTTGATGATAACATACAGGTTGATAATTTACACCCATTTCTGA
AATCTTAACTGTTGGTTCCTTGTATATTGCTGGAGGAACTATTCCTGTATTCCTGAACCT
CTCCTTAGCCTCAAAGATAATACGTTAGTTCTTCTAATACCATTTTCCATCTATGCTGTT
ATATCTCTGCTTTCAGCAAACCTATTGAGGGTGATCTTATATTGGGTTCGCCTCCAAAGC
TTCAATGGGCGTCAGATGGTGATGCTGAAGCAGATGGACGGAATTCCGCGCACTCTGAGC
ATCCATCCAAACGCTTGGAAACTGCTATTTGCAGGACTCCAACACTGATCCCCACTAGAA
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GCTTCAAAATTTACAGGTAGGCTTTGAGCTGAGGGTTTAACATGAGATGGTTCTCGTGAT
CTCATCATTGCCAAAAGACTTATATCTGATTGTGAAAATGCTGCTTGCAGAAAACAAGAG
GGTCAGTGAATGTAGAGAGTGCCTGAGTTATGGAAAATACATTAACAATGAAAAAATATG
CAGCAATGAGTTATGCTTAGTCAGGTTTTGGTCAACTTCCACTGTGTTGCTTGAGATTTT
ATCGAGTTAAGAAAATTCCCTACTTAAAGTATAGTTTACATTACTCTGCCATACTTATAG
GTTGGAATGTTTTGCTGTATGAATGATCTTCCTTTTCCTCGCCAATTCCAACTGACATCT
ATTGTTATTTCTGAAATTTTAATACTATGCAAAATCAAGCTCAGATTTCTTCTCTTCCTT
CAGAGACGCTCGTCGTTCGGCACTACAACTGAGCTTTCAGAAACTGGGAGTAGAAAAGCT
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GACCGAGTATTTGCGAATTACAGTGAGGGCCCTTTTTCAAATATGCTTATGGTGTATGTG
CTTAGACATCCAACTAACTGTCTATGCTTCAATAGGTGAAACTTCTTAATGGAGAACGAA
AAATTTGTGATCAGGTTTTTGAAGGTATCAGTTTCAACAAGGATCAATGTTTCGCTGAAC
TGGCAGGAATTGGAGTTGCAGTTGCAAAAACTCTTCTCAGCTTTGGAGATGCTGTTGCTA
AAAGTAAAAGGTCTTCTGAAAAGTTGTTTGTACTGCTGGACATGTATGAAGTAATGCATG
ATGTTAGATCCGAGGTATGCTAAAAGCAGTGTGTTCCTGCAACACCAAATATGGTATATA
TATGTAGTATGCCATCATAATATTTTGATCAGTTACGTAGTAGCTATTGACCATATATAT
ACAACATTTCTAGCTGTTGGCAATTAGCAAATGATGGTTTACTTGGTTCTTCTAGTTGCA
GTGTTAGTGTTTGCAGTTGTTATTTCTGCAGCTATGCTCTCAACTGTGACTGTTGATATT
GGCGACTATGGAAACAGTAACGCCTACTTTCTTTTGAATTTCATTTACCAGGTTGAAGTA
ATTTTTGAAGACAGCTTTTGGTCTGAGATGCCTGAGGCTGCATTTGGCTTGATGAAGCTC
TTGGCACAGACTGCCCACGAAATGTTTGTTGATTTTGAGGAATTAGTTGAGAAGGATACT
TCAAAGACTAACGTCCATGATGGAACTGTCCATTCTTTTACCATCTATGTGATCAACCAT
GTTAAATTCCTTTTTGAGTAAGCATCTCCCATTTTGCCTAGCTAGTAAACTCTTGGACAC
ACAGAGTTTTATTTGACTTAGATGTTAACTAATATAGGGTCAATCAGAATGCAACTTTAC
TATTGAACTTCTGAGATGTATGGTCTCTCTTGTGTGCATTAGTTGTGTTAGGCATGTGTT
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TATTTGTTACTCAAGTTCTTAGTGTCTTCATTTTTTCCACATAGCTTTGGAGCTTGTGAT
GTACATCAATGTTTACCATTTCTTCTTTACATGTCTATACACCACATGTATTTATTTTCT
TGATAGAATTTAGGTGATATGTTGTTCAACTATAATTACAGGGAGTATTATATTTTTTTA
TTGAAGTGATTTTTAGTTTCTCGGTTCTTTTTTTCCATCATCTTCGAAATAGCATGCTAA
CTGATATGTGTGCTGCGCTGAAATTGACAGTTATCAGTCAACGCTGAAGCTACTATTTCA
AGGATTTGAAACTGGAAGTGATACTGAATCCCAACTTGCAGTTGTTTTGACAAAGATAAT
GCAAGCCCTTCAGAACAACATACATGGGAAATCCAAGCAGTACAAGGATCCTGCGCTGAT
GTGCATATTTATTGCTAACAACATTCATTACATGGTTAGGTCTGTTTGCAGGTATGCTAT
GTTTTGTGTTTCAGGTCTACATCATCTTGTCCAGACAGAGTGCCTAGCAAATAATTTTTT
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TCGTAGGATTGTACAGCAACATGCCCAACAATACAAAAGGGTTGCATGGGGAAAGGTTAG
TGCTTCAGATCTGGAGACCGCCTCCATCCATGAATCGTCCTCTGCTCCTCTCCCCGTCGC
TTCGTCTTGCTGCGGTGGTGGGGTTGGTAATCGCTTTGCTCGTCCTAGGCAAGATCGGGA
CTTCCCCTGTCGGTTTAGCTCCGACCGGCGTGAGGTCTTCTGGTCGTTTTGATTTGTGGT
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GGCCCGGGTGACGGCCGGTCTTACGGTGTCGGGCTGGTGGCCTTGGCTCTTGGTGATGTC
GCGCGTCTCGTGCATGTGTGCATCTAAAGGCTCTGGTGATTTCATCTGTCACTCATGGTA
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GTTAGTCCGCCGCTTCCAGCTCCCTCCCTCGCCGCCGCCGGTGTGCGCCGCCGAT