Map Locations of contig_1558782 (11213 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_1558782

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10306 1 726 bp MLOC_10306.1 Available Available None
MLOC_10307 1 749 bp None Available Available None
MLOC_10305 4 2141 bp AK354575 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10306






CDS Structure of MLOC_10307






CDS Structure of MLOC_10305






Contig Sequence (11213 bp)

>contig_1558782 11213 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACCCACCCACGCGCCTCACTACCACTACCTGCAATGGCGACGCGCCGAGATGCGAATCA
GTCAGTGACCACTCCCGCTCCGCTTCCCCAATCTCTCTGTTAACATGAGTTCAGGGAGTC
CTCGCGCCAGAGGCGGGATGCTTGCGCTGTTCGTTCACCAAGGATTTTCGTCCATAATCC
ATATCCTCATTGTCTGATTCCGAGGAGATTTTGTCATTTTCAGTTGATCTGTACGTGATT
CGGCTTGGGTTTATGCGATTTGGTTATTGGGCGAGTGGCTTTCCGGTAGGAGGTTCATCT
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GGCTCTGAGACCTTCCTTCTGGTACTGCTACGGGTTTACACGGACATTCTAAGATCGAAA
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GGTCCTACAGTGATGGTGCCAATGTTCCTCAGCTCGCTAGTGTCACCAGAATAGGTCGCC
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GCCCAGCTTGCTCATAAATGCGCTGGCAGATGATGCTATTTTTGTAGCTCACTGTGCAGT
AGGCAGTGTTGCAACGCTGTTGCTTGCGTCTTGGATCCAACTGTATCGCTGGGGTCGTCA
CTCATCACCATTATTGTTGACACATATGATTTAGAATTTGCCATGGTAGAAAATGTCTTA
ATGTCCGTGAGGAATTGCAGGGTGGTTGGCATGGGTTCAAAGCTCATCGGAAGCGGATCG
GCCACTCCATCACTTAGTATTTCAAATGATGACCTTTCAAAATTTGTTGAAACGTCTGAT
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GAACTAATTTAGAACAATAAATATGAACGTTTAATAAATTTATATCTTGGCAACTTACCT
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GGAGAGATATTTCATTTGTTTATGTTTCATGAGTAATTTGTTCTTTTCAAATGTATTAGG
GGGCGAAACACTGGGAGGGCTTTCAGTACAGGCAGCACAAAGGGCACTTGAGATGGCCCA
AGTAAGACCTGAAGATGTTGACCTTGTTCTCTTTTGCACATCTACTCCAGACGATCTCTT
TGGAGGTGCTGGTCGGGTATGGCTATGCACATCTATGAAATTATTCTATTAGTTGTCATC
CATGCCTTCTCTAGAATACAGTAGTTGTCATACTTGTGGAAACAAATGTTATTTACAACA
ATGCTATGTTTGAGCGACTGCATATTCCTGCTTTTAATGCGAGTCATCTCATGCTTGAGA
ATATTTTCCTGTTCCTTTTACTGTATATCATAAGTTGGGTAGAAATGGTACTATCTTATT
GTTAAGTTTATCTGAGGAATTTCTTTTAAACTATAATACTCTCTGTCTGTAATTTTTTTC
ACTTCAGTACTCGTAGTCTCCAGAGTATGACACTCCAACTAAGGCATGGTAGCAAAGTAT
GATCTCTGTTGCTGAATGGTTGTAATTTAGGCACTCCAACTAAGGCATGTACGCAACACA
CTACATTTGCCTCCATAATTAGCTCATTTATGAATGTTGGGTATTATGTGTTAATCTAGT
ATATTAATGAATGTTGGATATGCGAAGGAAAAAAATGGCAGTACCGCAGTAGTTGCCCCA
AACTTGTAAATTGGCATGTATTTCGGAACCAAAACCCAGAAACTAGAATGAGATGTATTT
AGAACGGAGAAAAGTGATTTCTATGGAAGTATGCTGTAATGCATGACAACGAATATATAT
GATAGTATGTTTCATTCATGATGACTATATTCGTACTTGTAAGTTATTAGTACATACCTA
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TTTCATTCATTTTTTCTCTGTTTAGTACTGTTAATGTTTTTTACTACGAGTAAACTAGTT
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TGCATTTGGCTTCGATATCACCGCTGCCTGTAGTGGGTTCATTGTTGGTTTAATTACAGC
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CTTGTAGTTGGGGCAGATGCTCTTTCACAATATGTGGATTGGACAGATAGAGGTACATGT
ATCCTCTTCGGTGATGCTGCTGGTGCTGTTTTGGTCCAGGTATATGTTCTTTCTTGCTGA
AATGTGGGTCTGCTTTCCATGGTTCAATTTGCTGTAGTCTTTTTTTTTTGTATAGCCTAT
TCAGTAAGACGCTGCAGTTTATTGTATTACAGGGATTGCAAAATCCTTCTGCAAGTTTGT
TTGTCTAATTTTTAATCCTCAATATTGCAGTCTTGCAATGCTGATGAAGATGGTTTGCTA
GGTTTCTGTGTGCAAAGCGATGGCCATGGGCAAAAGTATGCCTTCTTTCTAAAGAAGTGT
TGAGGTTACATTTCTAGTAGGTCAATTTCTTATGTTTGCTGATTACTTATGTAGGCACCT
GCATTGTTCATCGTCGAACGCTGACTCCATCTTATCCAAGACCAATGGTGTCCCTGGCTT
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TGCTGTACGTTGCGTGCCACAGTCCATCGAAAAGGCGCTAGAGGAAGCCGGCCTACCTGC
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TGGAAACTCTTTGACCTGAAGCATCGATCTAACCAACCCTCGCCGCGTTCCAGGCTAACC
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CCTCTGCGGGGTCATCTACCCTTAGCCTGTCCGGCATTTTTCTTTTATATCACCGTCCGT
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TACACAGATCAGCTGTCATCGTGGCTATCACTACTGTACTTACTAGCCAACAGCGAGTCT
GGATTGTATTCTGTAGTTTTTGAGTGGCATGCTCGAGTATTTTGCATCTGGGGTGGAAAT
TGGAAATTTAGCTGGTATTGGAAGGAGGATACTGCATTGTAAGTTGTTGTTGAGCCTTCC
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TCGCTTATTTTGGGAAGGAGGGAGTATAAGTCTTTTAAGGTTTCACTAAGGGACTACATA
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TCTAATTAAAATTTTAAAAGGACTTATATTTAAGAACGGAGGGAGTACATATTTAGAAAT
GGAGGGAGCAGAATTGTTGATAATTGATGAAATTTGGATGGGTGCTATTGCTAAACAAAG
GTAGTAAATCGTTTTTGCAAACAAAAGAAATAAGTTTTATCATTTATTCCACTGATTATG
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CTGGTGACACGCGTGTCGAAGTTACCATATTGTAGTTTACCACCCTTTGTGGCGGGTTCA
GCACCACAGTCCAGTTGAAATTTGTGAAACAAAATGAAATGGGCACCCTAACGGTATTTG
TTCACCTCCAACATCTCTTCGTGAATTCAAACAATCACGTATCATCTGCTGCACTTTTTA
GCAACGAGACAGTTTTTCTTCATCTTCTAATACAGAGCAGCGTAAGGCCCTGTTTGGAAC
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AGATTATTTTTATAAACCAAATTATATAATCTATCTTTACAATCCAGATTATCATAATCT
ATTGTGGTTTCAAACAGAGCCTAACAAGAGAAGGTAAATAAACTGTTCCGTTGCGGCCAC
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TGGCAAGAGAATGTGAGGACCCTAACGAAATATATTTTTTGAAGATTTTACTATAAACTA
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CTATAGTTTTTTTTTTAAATCTTATGTTTAGGAACGAAGGGAGTAGATTGCAAAGTGTTC
ACGGGCCTCCTTGGCGATGCTTTGCCTGGTAATTCCGTCCAACTGCGATCCATGCTATGG
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AGTAGCAGAGTAGGCCTACTGGAAACCGCTGCCATGTCCTTCTAACTGCCGTCACGCTAG
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GATTAGTGATCTGTTCGATGTTGGAAGTCCTAAGTTGCAGAGGTCCTGTACTACAAATGT
TGACTCTGACAGCCTTATTACCTGGGTAAATGGACGCGTGCGTGCACACACCAACATCTC
TGCAGAACAACTCTAAGCAGATCCGCTATAATACCGGACTACAAAAAACAGTTTGTGGCT
TCCCCTAAAACGGATTTGCATATGTGGTGTCTAGCGAAACAAATGCCGCACACCTGTTCC
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TTAAGAAAAAGATTAGTGCTTTTGTCTGTTCGTCTCTGAAATAATCACAAATTACCTACT
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CTTTGATTTATTACCTAGCGACCGGCTAATGTACCACAAGGCTGCAAGCAGCCCACTTGC
TCGAGCCTTAAACCCCGACCCAAGTTTGATCCCAACTTAACCCAATTTTCTTCTTTTTTT
TGTTCAAATTTTCTTTTAGCGATTTCAATCATTGATGCTCGTCGCTGCACATCACCGCAC
ATCGCCTTTGTCCCCTCTGCTTTGCGCATGCGAGGTAGGAGACGATGTATGATATTATGC
AAAAGCTTATAGCATTTAATGCAAAAGCTTTCTTTCTTTATTGTCAAGAAAGGACCAACA
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GCAAAGGCATAAATTGAACATGTGGATTAGGCTTGGCCCCGTGAAGTTGAGAGCTTGATA
GAGTCTTGAGTCAAGGGGATATTTGATAACCACTCTTGCAAAGTGGAAATGACCAAGTCT
TCTCTCTGGGGATAAGGTTTGGAGACTTTACCGGTATTCTGGTGGGAAGTATGAGCTTAG
GGTCTATCTTGTCTAGATATCTTTGTAGAGATGTTTTGTCGCATGGGTACATTGTGCGAC
CTTTATAGAGTTAAAACTATTCGAGTAACCATGTCCACACTATGGGCAAAGTCAGTATAA
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TGTATGCATTGTTTTCTGTTTTGTAATCCTTGGTTTGTCTTGAGAATACTTTTTATTCAC
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GAGAGTTGCTAGGCCGCAGTCCAGCCAGGTCCGTGTGGAGTGGTCTCCATCCTTTAGCCA
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TAATCTGTACACAACCTTTTACTTTAGAAACTACCAAGAGCTCTTGTATACGCCAGGCAA
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TTAATATTGTAATAAATTTCTTTGCAAATTTTCCGACAACCATGAACCGAGCTGTTATGG
TGAATAGTAACCAAGTCACGCCTATCATTTGATTTTTCTTATTCTTTGTGTGAATTGTCA
CTTTATGATCATATATATTCTTTAATTCTTTTGAGATTCATTTGACTACTTTGTTAAATA
CTTATTGTGCCTATATGCTCTCTGATCTATTAGTCTTGCACCGGAGAATGTTGTTGGACT
CCATTTTTTACCATGAGGTGCTATATATATATATATATACTATTTTTTATTTTAGTTTAT
TTGAGATAACCAGACAATCACCATATCCCATCAATGGAAACATATTTTGCACCCTTAGTT
TACGATAATGCAATACACTTGTGTTGATCAAATGAATTTAGTATTGGATTAGTATTGGAT
CAATCAGTTTTGCCAATGGAATAAATCATGTGTGCATACATGGGCCCATAGGTAAGAAAC
GATCATGCAAAACGTTTGGTGTAACATGCATGAACTCTGTGCGATCCCTCATACTAGCTG
GACCTGGACGTGTATGTATTCCAACGGGTATAAAATTAAGGTGTGTGGCGGCTGGAGATA
AAAGGAAAATCAATCAGTTGAGTTTGACTAAATCCACGAGAGATGAGTACGGGCACCTGA
ACCGAATTCGTTGCTTTTCCTGCACAACGGCACCGAGAATTTAGAGATAAGATTTGATTT
GTTACTAACGGCAACGACAAAGTGAATCTCCCATGTTTATCTTTCTATTTGCTCGCATGG
CTAACCGAGGGGTACGAGGCTATAAAAGCGGTTGTTCTAGTGACTGAGAGGAGGTTGAGT
TTACTCACCACACACACGACGTTACACACTCATCTCACTGCCATTCACCATATCACACAC
ACACTTCATATCATCTCCACTCCAGCATTCACATACACACACATCTTCAATTCTCGTCCG
ACATCTTTCCCTCGCGACCGGCGTCCATGGTGCAGCCATATGGTAAGTAAATCATATGAA
GGTTGCATATGATTTTTTTACTTTACTTTTTTTGTGTTTTTATATTTCTTTCGTGGCGTT
TCACGGCTCTACATGGCGATTTAATTATCGTCGCGAACGCTTCATGACTTGAGCTACAAA
CTGAATCAGGGGCGTCTCGCGGCTCTACGTGGCGATCTAATCGTCGCCGCGAACGTTTTA
CAGTGAGATCCACAAAAAATGTTTGTCGGCATCTAGCGGCTCTACATGGCGATTTAATCG
TCGTCGCAGGTGTTCCGTGGTCCGAAAAAAAAAAAAAAGAATTGGCATCTTGCGGTTCTA
CATGGCGATCAAATCGTCACCGCGGATGTTTATTTTCATTATCAAATTCGACAAATAGAA
AAAAAATAAAGGTTTAAGGTGTTTTTTGCGGCTCTACATGGGGATTTAATAGTCGCTACA
AAATATTGCATTCGAGGTGCTATACGAAGTCCGGCTCTAGAGAACAGTTGCACAACTACA
TACATACTCAAAAGCAACATCATGAGTCAGCACATGCAAATCATGAGAAGTCCTTAAGAG
CAACTCTAGCAGACCCCGCAAAACGGCCGGTCCGCAAAAAAATCCGGCGACTATACGGTT
TTGGCAGTTTTTCCTGCCAGAGCAGACACTGCAAACGAGGCACGACCTGTATTTTTTTTG
CGGTGGCCCGTAAACGCGACCGCTCGACCGGTATAACTGCGGATTCGACCGCTGGATGCG
GGTCGAAACCCTATCCCTCCGCCGCCACGAAAAGCCCCCTCACCTCACCGCCG