Map Locations of contig_1558692 (9273 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1558692

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10253 1 613 bp None Available Available None
MLOC_10252 25 3687 bp None Available Available None
MLOC_10254 1 445 bp MLOC_10254.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10253






CDS Structure of MLOC_10252






CDS Structure of MLOC_10254






Contig Sequence (9273 bp)

>contig_1558692 9273 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGGCGGCAGGATAGACGGGGGAAAAGAAATGGATATGAATTGTGTGCTGCCCGTTGGAT
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AAACGAGATCGATAAAAGTCCAACCTTTTCCGTACCCCAACAGGCATCTCAAAGAAGGAC
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GACATGAGCTTGCCCTTCCAGCAGCTTAGTTTTTTTCTGAATCAATCCTCGATACACTTC
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GTTTGATTTCCTCTGATGCTCTCTTGTTGGGCTTGGTTGGTGTGTTGAGACCAAGGTTTT
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TTACACATTGTCCGTTTTAATTATTTTCTTCATTTTAAGTTATTAACCATCTTACACAAA
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TGGATAGTGCTGAATACAAACTGAGGATTCTCATGCTGTTGGAACCAAAAACAACTCAAA
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TTTGACCCTGTGAAATATTTATAAATACAGTACGGTTACAATATTAAGAAAATATTTGTG
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GATATTTATAGATAAATTAATTAATTAAAATTGACTGCATCTATATCAAGACCCTTGTCA
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TGCTCATATTTGATGCATGTATTATTTTTATCTGAAGTTTGCCACCTCTGGAAATACTAT
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ATTAAATAAGGTGAATCTTATAAGTCAATACGAATGTATATGCTTATAAAGAATAAGGGA
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AAAGTGGAATATATATTTGATGTGATACAGAGCCTATTGATATACATATTTCCTAGTTCA
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TGTGAAGATGGTGATCTTACCATTCAGGAAGCTATCGAAGCAGTTGAGGATATCTTGAGA
AGAAATGCACTGCATCTTTACAAGTTGGATGTCGTCCATGAAAAAGTTATTAATATTGAT
GATAATAGCACATCATCGTCATCCTGTGTCAAGAAAGATGATGTGATTCTTGTTCGAATG
GTTTGGAATGATGCTTCAGGTCAACATAGATGCCGTGTAAGCATATCTTCCAGACCACAT
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AAATGGAAACTTTACTTTCAGGCCTTGCCAGCCGAGAGATTTTACGGCATTGCACGGAAT
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TTTCCAGATTGTTCACAACCTATCCGGACAAACCGAGAATTCACTACGACATAGTCTTAA
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AGGAAATCATTCAGGTAGCTTTGCCTGACTCTGTAGTCTGTGTAAAATTAATCGTGGTAG
GAAGGATCTATCCGCTCGTTCTTTATATGTACTGAAAACTCATGCAGTGAGGGCCATGAA
CAGTGGGTACCATATGATAATAGCAGTTACTGCTCGACTTCAGCATTTGATGGTGCATCA
TCTATACTGAAAGAAGCATATTCCTGTCTTAAAGCTGCAGAAATTGTGGTTGAGCAGGTA
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GTATTGATTTAGTGATCTTTTTTTCTGTTTTCACCTATATTCTTCCTCCTGCAAGTATAA
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CCAGACCAGACCTGAATGAACTTGGATCCGGTTGTCATGTGCACCTGAGCTTATGGGAGA
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TGCTATCCTGAAAGTAGTTTTCATGGCAAGGTTATTGATTTTTTTAGGATTACCAATCCA
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ATTGTGATTTTATTTCTGTGCATACATATACAGCTATGACCGAATTCAGCCACACACATT
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CCCACCGGGCGTGCCTCCTGATTTTGTCAGCAACTTCGAGGTCAGATCTTTCGACGGGTG
CGCGAACCCTCACCTTGGCCTCGCCGCCATCGTCACCGCCGGCATCGACGGATTAAGGAG
AGGCCTGAAGCTGCCTCCACCAACTGGTAAACACTAATTTCTCATTGCTTTCTTGAGCTT
TCAACATCTTAACCACGAGTGTTTCACTCGGGGAAATGTGTCTCTTGGCTCTTGCAGAAC
TGAATCCTGCAGATTGCGCTTCACACGAGAGGCTACCGCACGACTTGCTGGGATCTGCAG
AGGCACTTGCGGCGGACGAGATTTTTCATGAACTGATGGGTGATAAACTTGTTACTTCTG
TTATAGCTATGCGAAAGGTAACTAGTAGACACACTCCAGTGTACTGTTTCCATCTGCTCT
TCATATTACTAATCTTCGTGATCTACAGGCTGAGATCGAGCATTACGCGAAGAACCCAGT
GGCAGTCCACCATCTCATTCACCGTTACTAGCGATGCCTATTTGCCTTGCTTGGTGATCG
ATCGGGATCGGGTTGAAAAAGTACTGCTCTGCTTTCAGACGTTGCTCTGTTCTCAGCACT
TCACATGTATGTGGATGAGTAAATGTTGTCCAGATGATTGCTCATGATCTCGGCAATGCA
CTTGCCGTTGTCAGACTTTTTCAGTTAATAAGTGGTAGAGACCAAGGTTTAGATGATTGC
TCACCGACAAAGCTGCGCCAGGCCCTGGGATGGTGGCAGCAGGGCCATTTTCACCCTCCG
CCCTTCCCCCAGATCTGGTCCCCGGCAGCACCGCCAGCTTCCACCGACGACGGGGGCGGC
CTCCCCGGCCATCCCGTCCTCGAGGTGCTGCTCCCGTCGGTTGCATGTTCAAAAGTTTGA
TTTGTCAGTACCGGAGCTTGATGTGTCGATGTGTTGGATCTTCAGGCTATGAGCAACCCT
TACACCTGATAAAACTGATATGTGGATGTGGATTCACACATGTGAGTGGCTTGATGTATA
CAATGGACATATCTATCTTTCTTTGACAAATCTGTGCATATATAAATGTCGTACAATTGA
TGCACGCATGTCGTACAATTCCAGTTCACTTGCTTGTGTTTCTTCATTCTGGTTATTTTC
GTCATTCTCGCTAATCTCATCAGATTGTCTGTTTCTGGTAATACGTCTTTTGACATGAAA
TAAAGGCTGTACACCCATGTCAATTGCAATAGATCTCACAATATCCAAACTTGTTGCAAA
GCCTTCATTTCTATACTTCACAAAATATGAGATGGCACCTTCAGTCTGTTTAAGAGTAAC
ATCAATGCACACAAATTTAGACTGCAACTTTTCACTCACCATGTTTATAGTGAACAAAAC
GTCATGCCAAATGACCATGCCAAGTAAAAATTCAAATTTCTCAAGTGCGGTAGCCAAAGA
TTTTGCGTCGCTCTTAGTCTTGAAGTCATCAGTAGAAGTTCTCTTCAATTCTAGTACTCC
CTCCGTCTCGGTTTATAGGTCATCTTAGGTTGTGCACCGCAACCAAGACGGAGAGGAAAA
CAAGAGAAATTAATGTTAATTTGCTACTTAATA