| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_1558649
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_10222 |
2 |
3315 bp |
None |
Available |
Available |
LOC_Os01g67250.2, FRAME:+2, EVALUE:2e-115, 13101.m07295 protein Rad21 / Rec8 like protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_10222
Contig Sequence (6631 bp)
>contig_1558649 6631 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCAAGTTGAGTCTTCTGGTGCTGTACGGGAGATGGATTTTCTGAGGCAACACTGTGTAAC
TGTGGATATGCCACCAGAACCACAAACATCAAACCTGGTGGCTACTGTTGATAAGTCGGT
GGTAAATACTGACAATATAGCTGTATCAGGTCAAACACTACCTTTTAAAGCAAACATGGG
AACTGTGCCATTTGTTCAGGATACTTCAGAGCCACGCGCTAATGGTTCTATCGAGACATA
TGTGACAGGGAATCAAACACATTTTAATGAGGGGTCAGTAAACGTGCAAGGTAAAGTTGA
CTTTAATGTTTTTCTTTTTGCAAGTCTCAAAATTCTTGTGGCCATCTGATTTTTTACTAT
GTTTTGGCAGGGTATAATTTTCTTGCTTCTAATGTATCTGTAGAGCCATACCCTAGTGGT
TCTACTGAGCCATGGGTGACAGGGCAACAACAACAAAGCTTTTTGTCCCAAGCAAGTTGG
GGTAGGCCTAGTGGTCCTCCTACCGAGCCACGCATGACAGGGCATCCAACACATTTTAAT
GAGGGATCAGTAAATGTGCAAGGTAAAATTGACTTTATTGTATTCTTTTCAAAGCCAGAA
TATTTGTGGGCATCTCATTTTTTAATATGTTTTCTCGCAGGGTATAATCTGCATGCTTCT
AATGTGTTTCTCGGACACAACTTACAAGAAATGCCACCAGGAATGACACACAGTAATATA
TCAACTGCAGCTTTCCAGCAGAACACCGGAACAATACCGCAATACATGTCATATAATGAT
AGACCAAATGACATGTTTACCTCGAATTTCCCAGAACGCGAGAGAATGCTGTCAGCTCCA
TATATTGGATTCCACCAGACAAATGACTTGGGACAGTTAACTGCAGAGAAAGGAATCACT
GAGTCTGATGGAAGTAACAAAATAGGTAGCCTTAGTAGCAGGAAACGTCACTTGGAGGAT
AGCATGCCAGCTCCAGAGAGTAGGACTACTGAAAATTTGTCCAGCAGACCACATGGTCAA
AGAACCACTGATGCTATTTCTAACGATGACGATATACTGGCATCTATTTTAGGTATGGAT
AATTTAATCCACATAATTTTTGCTACATCATCTTCCTGTGTTGTCTAATTATGTCTTTTT
GTATTAGTTGGTAGAAGAACCCCTGGATTGGTGCTTGATTCAACACCATTACCACCTAAG
GCATCATCTTCGAAACGCCAAAGGTTGACACCGAAGACCGCATTGGCACCCAAGTCCAGG
ACACCCAAGAGAAGAGTGAAAATGGATGATGACACGGTTATACACGCTGAGTACGTATAT
GCTTCATTGCCTGCCTCTAATGAACTTGTTTGTGGAAACTCTGTGACTATCCTTTCAAAA
TGTATTGACGTGTACTTGTCCCCTCTTAACGTGTTTACTGTGAAGTGTGATATACCTGTT
CTTTCTTGTACCTCTTATTATTTCAAGAAATTCTTTGTAATTTCTGTTTCTTTCTTCTAA
AGAATGCACGCCGCACTTTTCTTCAAGGTTTTCTTATTGTGACATTCTTGTCATTGGATG
AGTAGTGGAGAAAATATGACAATCTTTTGAGATTACGAGTCTTGCAAGAAATGTTCTTGC
CAAGCTATTGCACCTTTACAAGTGTGCTATTGCTACCTTTATTTATCAGACTGTCATTCT
TTAGCGCACAATTCCACTGTAATATGCACATAGAGTATACAATCACTGAACAGTACAGAC
CATTTCGTCCAAGTAATGTTCTATTGTGAGCTTACTTATTAACTCTTCCCTTCTCCAGTA
TTATACGGCAGCAGTTGATTAGCACTGAGGATATAAGGCGCATTCGGAGAAAGGCTCCAT
GCACCCGTACTGAAATATGGATGATCGAGAAAGGTTCACTAGAAGATGATATATTCCGCG
AGCCTATATTTTCCTGTAAGTTCTCTAAATTGTCTTTGATTTTCTGTATCCTCTTTCGTC
GCTGATATTAACTTCGCAGAGGAAGCAAATTAATCAGAAGTTAATTAGTCTATTACTCTT
ACCATCTTAGTATTATTCTACTCCCTCCAATCTAAAATAAGCGACACTTACTTTGGATTG
AAGGGAGTAGTATTTAGTAGTTGTGTGTAACTGGTGTTAATTCTATGTTTTCAGTCTTTA
CTCATGGATGTTTTGCTTCCCAATTAGGTATGCACAAGGACCTGAACGATTTACACTATC
GAACATATGAGTCTGTTTCTCAGTTCACCATACATAACAGGGAACCGCAACGACAAGTAG
ACATATCTGAAACTATCCCAGCAGATAACAGAAATGCTGGCACCTCTGGTGCAGAGGAAA
GTGCAGCTCTTGATCACCAACTTCATATGGTTCTACCAGATACCAACAATGTTGACATCT
CTGGTGCAAAGGACATTGCAGCTCTTGATCACCATCTGAACATGGGACTACCAGATGGAG
CTCACAACGTTGGCATCTCTGGTGCAAATGATAGTGCAGCTCTGGATCACCAACAAAATA
TGGGACTACCAGATGGAGCTCACAACGTTGGCATCTCTGGTGCAAATGACAGTGTAGCTC
TTGATCACCAACTTCATATAGGACTACCAGATGGAGCTCACAATGTTGGCATCTCTGGCG
CAAATGACAGTGCAGCTCTTGTTCACCAACTTCATATGGGACTACCAGATGGAGCTCACA
GTGTCGGCATCTCTGGTGCAAATGACAGTGCAGCTCTTGATCACCAACTTCATATGGGAC
TACCAGATGGAGCTCACTTAGATGCTACACCACAGGAAGCAACTGGTACAGTTGATGCTA
CAGCTGCATTTGGTTTGCAAATGCCATCTGACAAACTTGATAACAACATTGAGAAAGTAA
CTGAATTTGGTGACGGGAAAGAAATCCCACTTGTTGACGAAACAAATGCTGTTACAGACA
TTACTGCTCATGATGATACACTGGATAAGGACTGCCATCATGATGTTTCAGCAGACATGC
AGAGGAATACAAATGCTGATACACCTCTATTTGTGCAAGATGGCATAACCCATGATTCTG
CTACTATAACAGATGCTCCAGATGTTGCTTTACATAGTTCTGGCCCAGCGTGTGCACAAG
CAGTGGACGGTCGGGAAGGGGAATTGAGTGAGATTGTTCACAGTGATATTAATGCTTTTG
AGGATAAGGAGATGCCCACTTCTGAGATCACTGGACTGGAATTGACTGAATGTGCCTCTG
GTTTTCCTCAACCAACGGAGCATGAGAATGCTGTGTCGGCCATGGGAGAAAATTCTGGCT
TGCAAGAAAACAATGCAGGATCCTTCACGGACATGGACAACACCGGGCATGACTTTGCAC
TGAAGGAAATCAGTGTAAGTCCACGTAGAAGTTTTCACTTACATGAATGATTTGTTCCTG
TAACTGCTAAATGCAGCATGTATTCTACTGGCTGCTTCTGGCACATCCTTGCAATGCAAC
TATATGCACTGTTTTATTTCATTGTCATTAAAGCCAGATCATAATTGGTATTTGGTTTAA
ATTACAGGATTTTGGAAGTGCAATTCATGGTGTTGACGGCACAGGTAATTCTTCGGTCCA
GATAAGAACTATGAACTTGTACCCTAGCATGGTGTGGATTCATTATGGTTGCAGATCATC
TTTAAATGTATCAGAAAAAACATGTCCCTTGTATCTTCATGACACTTTTTTCCTGTGTCA
CCGGACTCGCAAATGTTGCTGATGTGGCTGCCCAAATCCATGTTGTTAACTAAAATTATA
GTACATCAAGTTCTTCCCAATCATGTGCTTACTATGTTGCTTATATGCCGAAAGAAATTA
GTTAAGCTTTTGACGTAGTTCTACTGTATACCATTTCAGATTTTCCACACTATGATGATG
ATGGGGACTTTGATGAGGCAATTGATCTTGATGATGATGATGATGAGCCAAATCCTGACG
AATTCCAGTCTCATGATGCACTTAGTGGCTGGTCTTCTCGTACCAAGTATGGATGCAATT
TTAATTCCTCAAGACTTGCATTCAGACTTTGTCAGTTTTTTTCACCGTGTGCTGCTATTA
TTCGTGTGCAGGGGCGTTGCAAGATATCTCAAGACTTTATTCGATGAAGAGTCTGGTCGG
GGGAGAAAGAATGTTGTCATTGATCATCTAGTGCATGGGAAGACTCGGAAAGAAGCTTCA
AGGATGTTCTTCGAGACCTTGGTACGTCATCCATTTTGCTTCATGGTCCTTGTGCCTTAT
TTTGCTTGACGCTAGTGCATTTTCACCCGAGTGCGGCGTTTCGGTGCCCAGGCTCATCTG
CACCCGTTTAGTGAAGAAATCGAAACAAATACTAAAAAAAATCAAAAAATCCCCCAAAAA
AATGTGTGATGGATAATTTGGTGCGTGAGATCCGCTCCAATTTTTGTATAATTTGAACAT
CTGAGCAGCTCTCGGCAAAAAGGACAAATCGGGTCAAAACGGTGCATGTGCAGTAAACTT
TTTTAGAGACCCCGAATTTGTCTTTTTTGCCGAGAGCTGCTCAGATGTTCAAATTATACA
AAATTTGGAGCGAACCTCACGCATCAAATTATCTGTCACCCACAAAAAATTTGGTATTTT
TTGAATTTTTTAGTATTTGTTTTGATTTTTTTACTCAGCAGGGGTGCAGATGAGCCTGGG
CTCAGAAATGGATTTTCGATTTTCACCCATTGTAGAAAAACGTGTGTGTAGGCCACATTT
TATAGTCACATCTCCGTTTAACATGGCATTTTACATTCAACATCTTCCATGAACATGCTG
CTAGGACCATGTTGTCTTTGAATAGTCTCAGTCTGTAACATCTTTGAAATTATTCCGCAA
AGCTCTTGTGTCTATCCTGGTCGTTTGAACCCCGCGTCTCATGGGATCGTACCAGCCAGC
ACAAGCTGTCAGTACTTACGGTATGTGCTCTGCTCCATTGACAGGTGTTGTCGACGAAGG
ACTACATTCAGGTGGAGCAGGTGAACCCCTTCGATTTAATAAACGTGAAGCCAGTGTCCA
AGCTCCTGAAGACAGATTTCTAGACCGAGACCGCCCTAGCAAAAGTGGCATGGTATACAT
ACATCTTACAATATCTGTCACAGCACCGTCAACAACATACAGATTGGGGTTCAGCTGTTT
GTTGTGGTAACTTCCCCCCATTTTCTGTTGTTTGTTGTTAAATTTACCCCCCCTCCTTAG
TATCGTGTCTCCCCGCACTAATCTGTGCCTAGCTGATCTGAAGCTGAGCTGAAGTAGTAG
GGCTTTGTTGTTGTGCTCCATGTTGGCTGGGTGTATATATGATGATTAGCCCTGTGTAAA
GCTAAGTTTATTATGCCGTGTAATGTTGGTAGCGTCGTCGGCTAAGAAGTTATTTGCCTG
CCTGTTGTTTCCTTGAACAGTCCTTGGGAACTGTATGCATCTGGATCTGTTGGACTGCTT
GTATTTGGAAGTTCTCCTCATCTTTCAGTACTGAATTTCACCGTCTTTACAGAATTTGGG
AAGAACTTTCTCTGTTTGTTCGTTCTGTCCGTTTGCTCTCTGAAGATAACATCATATTTT
TTGCCGTGTGGTTGACTCTGAATTATAACATGATGAACATGATGATGATGATGATGTATT
CTTGTTCCATGAATGAATAAGATTTCAACCGCACCGCCGTTCCATTTGACAAGCAAGGAA
GGGATTTAAAGCGACCTGTGAGCCGTGGGAGGCGTTGGGCTTTTAAGGTGGCAGCAAAGC
GTCTCGCTCTCGCTCTTTACTGTACCTGGAAAATTGAAAGGAAACACAAAAATGAAAGGG
AACACAAGAAAAGGGTCATGGAGACGACGACGACGCAATGTAGGAACACAGACGCAGACG
TTGGCCCCTCAATCATAGACGTGTTTGATCAGTCTTCCCGGGCATAAAAACCGAAGACCG
AGACCGAATCTGAAAAGACCGAATAAAAAAGGGACAGCACAAACAAAATATCGAATTTGT
TACGGTCTGTGTCTGAAAGACCGAATAGCCCGTAAAGACCGAATTAGAAAAAGGCCATAT
AATAGTTTATCAAAGGCCCATCCGGCTAGCCCAAGAGACACATCCTTGACCTCGACTTCA
ATGGTTCACTTCCGTTCCCCATTCTCCCGGTCTCTCCAGACTCCGAGTCCCACTATGAAC
CCTAGCCGCCACCCCTTGTTGTGGCCCGATGCATGACGGCGCCGTGAACCAATGATAAAC
CACAAATGTAGGGGATCGTTTGTAGCTTTATTTGATAGATAAGAGTGTCGAACCCANNNN
NNNNNTAAAGGTAGAATTAGTATTCTCTCAAGTTTTATCGATCACTCATACAACTATATG
CACGCTAACATTTACTTTACCTAAAACAAGTATGAAATTATTTTGCATAAAAGAAACTAG
AAGTACTTAGTAGATGTAATAGATAGTTTTGCAAAAAAATAAAGAGCAAGTAAATAAAAG
TTAAGGCTATTTAGTAGACAACTTTTTGTGTAATGCAAGAGAAAGATTGTTCATAGACAA
TTGAATATAACATGATAGATACTTATCATATGCAATGAGGGCGAGGCATACGCTAACACA
CTTTTCGTACTTGGATCATATACACTTATGA
