Map Locations of contig_1558626 (4265 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1558626

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10207 3 2141 bp AK363623 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10207






Contig Sequence (4265 bp)

>contig_1558626 4265 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGCTCGGCCCACTCGCCTCTGCCGCCGCCGGTCGTGGCCGCCGCGGCTGTTGCCGAAC
TTCCGCTGCCCGCCCCGGCTGCTGCGGCGCCCGAGGAGCCGACGGGGATGGGGGTGGAGA
CGACCATGACGCGCTTGGAGGAGGAGTACCACGTGCGGCTCGCCCTCGCGATCTCGGCGT
CGGATCCCGCGGGGCTCGTCGATCCGGACTCCGTTCAGATGCGCGCGGCCGAGCGCATCA
GCCTGGGTGGCCCGGCAGCCGCGCCTGGGGACCGGACCACCATGGAGGCCCTCTCCGCCC
GCTACTGGAACCACAACGTCGTCAACTACGATGAGAAGCTCTCCGATGGGTTCTACGACG
TCTGTGGCGCACCCATGGATCCGGGATTCCAGGTCAAATTCCCATCCTTGAGCAGCCTCA
GGGCGATCCCTGTAGGGCGAGATGTCGCTTATGTCGCCATTTTGGTGAACCGGGAGCGTG
ATCCCACGTTGAAGCGCCTTGAGGGGACAGCAATTGCGATTGCTGCACAAAGTAGGGCAG
AACGCGGTGGAATTGCGTCAGCTGAGCTTGTACAGAAGATAGCTAGCCTAGTAGTTGATG
CCATGGGTGGTGTGGTGGAGGATGCTGATGCGATGAACAGGGAATGGTCCACAAAGAGCC
GGCAGCTCTGTGCTGGGCTAAACAGTATTGCCCTTCCTCTTGGTTCACTTGGAATTGGGC
TCTCGCGCCACAGATCTCTGCTTTTTAAGGTTAGTACCTCTGCAAGTGTCCTGTGTTCAT
GTGACCGATAACGTACCACATTACATTATATCTCGACTGTAGCAAATGTGGAATTGGTTG
ATGCTAATAATTCCCAGTCACATCGCATAGTTTGTATTGTGTAACTGCTGTTTAGAGTAT
TTACTTTTGAAGATTAGTTGCCTAACAACCAAGATAACTAGTGAAGAAGTTATGGTAGTC
GAATAAAGTAGTTATCGTAGTTTGCTATGCTTCGTTGATTCATGGATCTGCTGCACCAGA
TGCATAGTTTAAAAGGGCTGCAATTCTGGATCATGGATTTGCTGCACCATACATGTAGTA
GATGCCGTAAGATTATTCATTTAGTTTTTTTATTGCCTTCTGTAGTGGAAAGTTTTGCTA
TTCAGTAGGATCCCCTGAGCAAGAAAACAACTCATCAAAATGGTTTCAGGTACTAGCTGA
CCGAGTTAATCTCCCATGCAAGCTTGTCAAAGGAATATGTTATACTGGAACAGATGAAGG
TGCTATTAACTTTGTTAAAATCGACTTTGACAGGTCTGTTCCTTGTATTATTTCTAACTA
TCTTTTCGTATTTGATCTTTAGTATATTTAATCTATTGACGTACAAAAACAATCTTATGG
GGCTTTTGCAGTGCTGAATATATTGTCGACTTAATGGGAGCTCCAGGCACCTTAATACCT
TCAGAGATTTCTGTCAGTCAATTTCAGGACTCCAACAATAGTCAACTGAGCAGTGACGCC
ATTGAAGAGAGTGTTGCAGAACTATGCATAGCTCTTGAGCAGGTTAGTGGTGTATATGAG
AGTAAAAGTGACATGGGGGGAAGTTCATCTGATCGTAATTCTGTCCTAGCACTTCGAACT
CCACATTTGGAAGATACATGTCACACAGAGAACCCACTTAAACAACACATTATCTCCGAC
GAAGGCCAATTTGATGAATTCAACATTAAAGGCAGTGTTTCTCAGCAGAATAAAGTGAAT
GACACTTCCAAGTATTTAGTTCCTGGAGTAGTGGACCCACAGTTCGCACAAAATTTGCAT
GACTTGCTGCTGGAGGGTGGTGCTTTGCTACCATCTGGTTTGTTATCATGTCAAAATAGT
CATAATTCTGGCAATACAACAGAGATGGGCAAAAACTCTTCTCCTGAAGTTAAAGAAATT
CCTGGATGGATGCTAGTTGCTCAAACAGGTCAAAATTCACCAGAATGTTCTGTAGCTGAA
GATTCTTTACCCAAGATTGCCTTGCCACCTCGTGAAGATGTACAATACCCTGTAGAAAAT
ACAGAAGCAACTATCAGAAGTTTGGATACTATTTCAACTGAGGGTGAAAGGGTTGCTGAA
GATTCTTTGGCAAACATGTCAGGAAGTAGCAGTGCGAATTTGGACAAGTTGAGCTGTTCT
AGTACGAAAACAATCAGCTCTGTTATGGATGATGTTGCTGAATATGAAATATCATGGGAA
GATCTTCATATAGGAGAGCGCATTGGTCTAGGTATGCTTGTAAATTCCCAATCCTTGTCC
TTCTGATAAGGCAGTTAATGGTTAGTTTAGATTTAGAAGGAAGTTAAGGAAACATGCAGC
ATTAAGTTTCTTAAATGGAAATTAGCCCACAGGAACATATGTGTGGCAAAACTGAATGTG
TTGTGTTTTTTCCTGCTGGTAAAACTCTATGAAGTTAAAAAGGAATATTGGAATGTCAGG
CTCTGATGTTTCAACTCTGAAATTGCTTATTTGTTGGAAATTTAATCATTGAGACTTTGA
TAGGTAAAGACAAATCTGCACTTTTTAAGTATCATGGGGAGTAATAATGAATTAGCGGGA
TCTTGTTATGCAGTTCCATTGAAGTATCTTCTAGCATAGTGGACTTAGCTAACTGTCGTG
TTACGCTTCTGCAATCAGCTGTGTTGGTCCTCTCTTTTTCGTTATTGTATTCTCCATTCA
ATGAACTTACATTTTTCTCCGTAGGTTCATACGGGGAAGTTTATCATGCAGATTGGAATG
GCACGGTAAGTCTCATATTCATAGTGAACTTGCATATCCATACTTTTGCTAGGAATTTTC
AGTTTTGACATATTATGCAGTGGGTTGCTAATGTCGACGAAGACGTTTCTTGTGCAAATC
AGTTGTCTCTATGCACTTCATATTCAGTTTAATGCGTACTCCCTCCGTTCCTAAATATAA
GTCTTTTTAGAGATTCCACCACGGACTATATGCCGTATGTAGTCCGTAGTGGAATCTNNN
NNNNNNNNNNTATTTAGGAACAGAGGGAGTATTTGATAGTAAAACTGTGTTATTTATAGT
GGGTCATGCCGTCATGGTTACATGAAGTTAAAACTAGTTGTCTCAAGTTAAAACTAGTCG
TCTCAAGTTAAAACAAGTTGTCTCTAGCAGTGATATTCTATGCATGCTGTTACTAAAAGC
TAACCAATTAACAAGATTGAAATAAGCCTTAAAAGTTAACCAATTGGAAAACTCAGATCC
AATTTTAGAAATCCACCAAGTCAGAAGAGGAAGACTTACAGTGGAACTCAATTGCTAATT
TGTTTTTGATTCCTGCTCTCCTAATGTACTGTCCTCATTTATCCCAGGAGGTTGCTGTAA
AGAAATTCCTTGACCAGGATTTATCAGGTGTTGCACTGGAGCAATTCAAATGTGAAGTAA
GTTCACTTTTGCGTCTCCCTTACAGTTAGGTATCGCTATTATCGAACCTGTGCGTCAACT
AAGTGTGTATTAGTTCCTTATCTTTTAGGTGCGAATCATGTCAAGGCTAAGACACCCCAA
TGTAGTTCTTTTCTTGGGATATGTGACGCAACCTCCAAATCTCTCTATATTAACCGAATA
CCTTCCAAGGTTTCTGCAGCTCCCTCTTTTCAAATAAAAAAATGCCTTCCAAGTTATAGC
AAATATGATGTACTTTATTTTTGCCAGAGGGAGCCTATATCGCCTTCTGCATCGGCCAAA
TAGCAAAGTTGATGAAACGCGAAGGTTAAAGATGGCACTTGATGTGGTAAGCTTTGGCTA
GTTGCTTTGTTTGCAGTCATCTGTCGTGGCTTGTTTTGTCAGTCAGTTGATATTTATTTC
ATTCTTTCAGGCAAAAGGAATGAATTACTTGCACACTAGCCATCCTACTATTGTACATCG
TGATTTGAAATCACCAAATCTTTTAGTGGATAAAAATTGGGTCGTTAAGGTGATTCTCTT
CTTCACAATCCTCTTTCATTTAATGAATGGGCATGCTAGTTTTATTGTAACTTGTAAGTC
CACTTTCACCTTTAATAAACATTTGTACCATTAGCTGCCCACTGATGAATCAAGGGGTGT
CTAAAGGTGGTATGATGTTGCTTTAGAAAAAAACATGAACCTACTCGTTTTTACATAGAT
CTCTGGATTGCATGTCCTTGTTTATATATTTAATAGGAAATGGTTCCGTACTCCTGGTAT
ATGTACTCCCAGTCTCCCTGGTAGAGGCTAGGGTTCTACCAGGTCTCGGACGTAGGTTGT
AGGGG