Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1558404 (7259 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1558404

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10089 1 965 bp None Available Available None
MLOC_10088 11 3042 bp AK369372 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_10089






CDS Structure of MLOC_10088






Contig Sequence (7259 bp)

>contig_1558404 7259 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGGCGACAAGCCCGCGGCCGCGGCCGAGAAGACGGTCTTCGAGCTGCGGCTGGACTCGT
TCGACGCGGCCAGCAAGATCAAGGTGATCAAGGAGATCCGGACGTTCACGGACCTCGGGC
TCAAGGAGGCCAAGGAGCTGGTGGAGAAGGCCCCCGCGGTGATCAAGGGAGGGTTGTCCA
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ACTGATCGGCGCCTGCATTTCGAGGTGAGATGAGATCTCTCTCGCGGAATTGTAAACTCA
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CTACACGCTAGTTGTTTTAGCACACACCCATCACATTTCATTATGATGCAATGTGTGCCA
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TTTCTGGATTTACAATTGCCCATTTGTCACAGCAAGTCGAGTTATTGATTTTAGACGTAG
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AATTTAAATCTGCTGTTCTTATCTGCAGGTACTCTTGAATGTATGAACCATATGACTTCC
ATGGTTGATTGCTGCGAGCATTGTGGGATTGTCAGTGTCGTTGAACCTTTTCAGGTTCAA
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AGTCAACTAACTACAGATTTATACACTGTATTACGCAGTTCTCCAGCAAATTCTTCTCTT
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TTCAAAGCAGCCTGGCACTAATATGCAGGGTTAGAAACAGTCTGAGAGGCAGAAAACCTG
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TGTTATCTTAAGTAAACAGCCATCCATAAAAAAAGGAGGGAGCACCTAAGAAATAATTTA
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TATTGTTGTTGTTCCAGACTTGAGATCGAGCCAGCTTGCATTTGGTTGCGGAAATATTAC
TTGCCTGCAGATCGACCGAACCACTACAGCTCTTGTTTACCTGGCATCGCAGCAGGTAAA
TCTTTTGAGCTACTTTGTATTCTCCAGTTCAATGGCATGTTCACCAAAGCTAAAATAGAC
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TCTCCCTTGGGTTAATCTTTTGAATTGGAAGTTTTTTTTTTTGGTCTGAGTAAGTTCTGG
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TGTGGTGCGCCACTCTCCTGTCTTGCAGATTGTCCGAGCCAACTACACTTCTTATTTGCC
TCGCATCGCAGCAGGTAAATCTTTTGAGCTAGTTTGGTTGTCTCAGGGTACGATGGCATG
GTTCACCAATGGTAAGAAGTTTAATTGTCACCTCTCTTAGCGATGGGCTAGCCGGCTGTG
GGCATCCAGGAGCTGGTGGCCTGTCGAGTGGGTGTACCAGAACAAATTCACCTGCTCGTC
CTTGGTAAACAGAGTTAACTTTTGAAAGATGTGAATGCTACAAAATAGATGGAACAGATC
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ACACGAAATCAAGTTGTGGCTGATGTGCTTTAGCATTTTCATACTAAGAAGTGCCAACGA
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CAGATTCTGTTGAGGAAGCTTGGCAACATCCTCGCCACCAAATACACGCTTCTCCATGGC
ATTCGTGGGGAGATCCAGGAGCTCAAGGATGAGCTTGAGAGCATGACCGCGTGTCTCCGC
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TTTTAATTGAACTCTTGATCGGAAGGAAAACATGTCTCTTGTAATGAGATGATACAAACA
CTGGCATGATTAACTGATGTGCTCATTCATATACGTGCAGACTATGACTTGGATGAAACA
AGTGAGGGAGGTCGCGTTTGATGTGGAGGACTGTATGGACAGGTTCTGCCATCACCTCAG
CAGGAACCATGGAGACCGTCATGGACTCCTGGAATACCTCCATAGGATGTTCAACATGGT
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GTCGGGCAAAGCACTTGGCACTTCGTACAGCCACCTCGGCAGTTTGGACCGCTGGCTGCC
AGCAATCCATGGTGACGGGCCCGGGCTAGTCGGGATGGGCAAAATGACTGATGCTGTGGT
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GTTCGGTGGCGTCGGCAAGACCACCCTCGCGACGACCGTATACAACAGCCCAAAGTTGGG
TGGCATCCAATGTCGCGCTTTCATTCCGGTGTCCCAAACATACGACGTTCGTTCTCTTCT
GGAGTCCATGCTGAAACAGCTTTTAGCTTCGGCTAAAAAAGATAAAAATGATGATCCCCT
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TGACAAGAGGTATATAATGATACACTACTTGTTTATTGATCATTTGATCATTGAGTCTTG
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GTTTCCTCTTATGCCATACTCCATTTGTTTCTTTTTTACTCTGCATATTAGGTTTGTTTT
AAGTCAAACATTCTTAAGTTTGACCAAGTTTATAGAAAGAAATACCAGCATTCACAATAT
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CAGATATTGATAATTTTTTATTATAAAAAAATTTGTTCAAATTTTACAAAGTTTGATTTA
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ATAGTGGTTGATAAGACCATATGTAATGTTACGAGATCCTAAAATTATGGAGTGAATAAA
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TTATCTTCCTAAAAGATTTTTTTCATTTCTTTCTTCCGTGTCATCGCTAAGATAGCAGCA
TTGTACACATCCTAAAGCAACTCTAGCAGATTTTCCAAATCTTGGGCCTATAAATCAGTT
ATGGAGTGCAGTCCAGAGATTTTTTGGAGGTTGCAGCACCACTCCACGTTTATGGTTTGG
GTAGTTGGCGCTATCCTACTCCACGTTTATGGAGCTTGAACCAAATGGTTGTAAGATCAC
AAGGATCTTGATTGTGTCACCCACCAAGCGAAGCAACCTATTCCACCATGGCTTGCACAA
AGAAGCCTTGGTAAGGGGTAGATCTTTGCAAAGTAGGGTATCTCCTTGGCTTCACAGATT
CTTAAGTGACTTCTAATCGTCTAGGAGGCCACACCCTCCAAATCTGACAAGTAAAGCAAA
GTCACTTGATAGAAACTTCTCAAAAGATCTTCAATCAAAACATCACTCAAGAACCCATAG
GATCACTCTCTCACAAAGATAGGATTGTGGTGAAAGAGACGAACTTGATGTGTAGGGGTT
CATGAAAGGGTGGAGTTCTTGGCCTTCAAGAATCAAGAAGTGTTCATTGAATAACTCAGC
ACTTGTTCTTTCTGAGTAAATAGCATAACATTACAAAAATTCGGGCTAGGGTTTCGAAAA
ACTACATTTTTTGAAACTTACGTTAAATTAGGGATGAAAACGGAGCGAAAACGGACGGAG
CTGGGTGCTGCCACATTTGTTTTCATATTTTTTGTGGCAGCGGAAAGGAATACAGAAACC
CCGGAAACAAATAGAGAAACCAATACCACTGGAAACGAAAATGGAGCGAATACGGCACAG
ACAATTTTTTTTGGAGCGAAGTGTTCACGGGAACTAAAGACCCGTTGAACCATAGACAAA
AAAACAAGAAAAACCAACAAAGTTGTTTAATTGATAAGATGATTACTAAAAATTATGATA
TATCATGGCTATATAGTAGGATATTTTAGCGATGGCGGCGTGCTCGATTAGGGTAGGAAT
CTGCTCGCGTGATGTTATGCTCGATGTACTACTAGTAATGTAGAAGCCGGGCTATCTCGG
CCATTCTGTTCATCATGTGTAGGGGCTAATAGTGTAGTCGTTGGGCTACAAAACAACATG
TGCTCATATTCAAAACGGAAAGGTGAATTCTGCTTCCGTGTATGTTCCACCGGAATACAT
CATTCCGTTCCCGCACAAAAAAATCCGTTTTGCAAATTTCCATCTCCACTTCCATTTTTC
CTCTCCATTTCTATTTTTCTTCCATTTTCACCATACCTTTACATGCCGCAAAGTTGGTTT
TTGATTAAAAAACTACCATGTTTCACTGATGGCCGTGTTGATTTTAAGCACGATTATGAC
AGCCCGGTTCCACTTGTCAGGTCTGCCGTGGCAATAAAAGCCAACACCGTTATCTGACCC
GTTAGGTTTGACGAGGGCCCACCTGTCAGCTTCTTCTCCTTCCCCTTTCTTCTCCTCATG
TCCCTGCTATGAGCGACATTTCCTTGCCGGCGAGGAAGTGTGTGAAGTGCTTGCACGGAG
GCGATGGTGGGCACCATGTGGCCAGCACCGTGGATGACGACGAAGGTGAGCCGTGACGAG
CTTGCATAACGTCTGGCGCATGGACGTGATGGGCACGCAGGCGTCCGTGTCGTCGCTGTG
GACCCAAACATGGAGGTCGATGTCGACCATCCTCTTGACCACTGGAGCGTCGACGTCGGC
GAGTCCTTCCATTGCTGGAACAGTGGATCGCGGCATGCGGTCCTTGCCGTGGCTGCTGCT
CCTTGCGACTGCTGCTGCTCCTTGCTGGCATGCCCGCCCTTGGCATGGAGAGGTGAAACC
CATAAGATATCGCGACCAACTCATGGTTCTGGCANNTGGATAGCAAGCTTCCACGCACCC
TGTCCATGGCTAGTTCTTTGGTGATACTCCAGTCCTTAAGATCTCTCTTATGGACTCTCC
CAAGTCAAGTTCGGTCTACCCCGACCTCATTTGACATTATCAACACGCTTTAGCCGTTCG
CAATGCACTGAAGCTTCTGGAGGCCTGCGCTGAATATGCCTAGACCAGCTCAGGCGATGT
TGGACAAGCTTCTCTTCAATTGGTGCTACCCAAAGTCTATCTTGTATATCATCATTACTG
ACTCGGTCCTTGTGTGGCCACATATCCACCTCAACATGTGCATTTCCGCCACACCTAACT
GTTGACCATGTCGCCTTTAGTCGGCCAACACTCAGCGCCATACAATGCGGGTCGAATCGC
CATCCTATAGAACTTTCCTGTTAGCTTTTGTGGCACTCTCTTGTCACAAAGAATTCCAGA
AGCTTGGCACCATTTCATCCATTCGGCTTTGATTCGATGATTCACATCTTCATCGATGTC
CCTATCCTTCTGCAACATTGATCCCAAATATCGAAAGGTGTCCTTCTCAGGAACGACCTG
CCCATCAAGGCTAACCTCCTCCTCGTGTCTATTAGTATTGAAACCGCACCTCATGTACTC
GGTTTTAGTTCTACTAACTCTAAAACCTTTGGATTCCAAGGTTTGTCTCCATAGCTCTAA
CTTTCTATTGACCCCCGTTCGACTATCATCGACTAGCACCACATCATCCACAAAGAGCA