Map Locations of contig_1558345 (11542 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1558345

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10067 5 2468 bp MLOC_10067.3 Available Available LOC_Os10g29380.1, FRAME:-3, EVALUE:1e-75, 13110.m02513 protein MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain
MLOC_10066 5 7377 bp AK370670 Available Available None





CDS Structure of MLOC_10067






CDS Structure of MLOC_10066






Contig Sequence (11542 bp)

>contig_1558345 11542 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGTGCCCCCCCCCCCCCCGCACACACACACCCCCCACCCACCCACAACTTTCGACCCC
CGCGTTACATTCCTGATTGTGCCAACTGGTTCTGGCTGCTGATTTTTGTTTTGGGTTGGG
AGTTGGGGCCTTGGGGGTGGGGAGCTACTCAGCGATACCAACATGAAATTTGCTGTGTTG
GCCTGCTAATTCAGGTGTACAACCCTGCGACAGCCTGAATCTATATCCCTCTTATCGATG
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GGATTACGTTACATCTACTCGATGAATTTTCCTCATGGCAAACAGTACTAGCAGTAGCAC
ACAACAGGATGTCAGCTTTGCACATATTTTGTGTCTGTTGGGGACTTGGGGACGGGGTGG
AGGGGGGTGGTCATTTTAGGCTCTTTGGCTAACATTGAAAAATTTCAGACGGCATTCATC
CCATTCATCACCGCCGGTGACCCTGATTTGGCGACCACGTCGAAGGCGCTTAGGATCCTC
GACTCCTGCGGCTCGGACGTGATCGAGCTTGGCGTGCCCTACTCGGATCCGTTAGCTGAT
GGTCCAGTCATTCAGGTACATGTTCTGATTTTTCTTCAGGCTTATCAGCTTTAGTAGTAC
TTGTGATGGGCTGCAAGTGTTTTTGGCTTCATAACCATTTCATTTTCAGGCTGCAGCATC
CCGCGCGCTTAAGAAAGGCACCACGCTCGGTTCTGTCTTGGGGATGCTCACGGAGGTTAT
ACCGGAGCTGTCTTGTCCAATAGTTCTCTTCACATACTACAACCCGATTCTAAGGAGTGG
GGTGCGGAACTTCATGGCTAAGATTAAGCAAGCTGGTGTACATGGTATCTTTTCTTACTA
CTAATGTGCTGATTGTGATGTGTCTATTTTGCATTTATGCTCTTGTTAGTGGTTGCTGTT
GTTGATCTGCTTTTTCTTTCTGAGGAATTTGATTTGCTTGTTATGCTGCAGGTCTTGTCG
TGCCTGATCTTCCTTTGGAGGAGACAACATTGTTGAGGAGTGAGGCAACTATGCATAACA
TAGAGCTGGTGAGTCCTGGCTCTCATCTTGTCATGTAATGTTCGTGTGAAAATCTTCTTG
TATTTGTGTCATTGACGCCCTACACTGATCATCTTTAGGTCTTAAAATAGATTCTCACTA
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AACCTGAGCAAGGCTGGTCCATGGAGTGAGAAGTAAGACCAGATCAAAAGACCCTCCTGG
TGAGGCGATTTTGACCAGGCCACATTCAGAAATTCAGCGAAACCTGGTTTCAGATCCTTC
TAATTAGAATATGGTATCCCTGATTGATGTGGATTTGGCCTGCTGCAGCCTAAAATTTGG
GGTAAACCAGGTCAAGTGACCAGTTCAGCCCTGGGCAGGTTGATCAGGCTGTGCTAGGTG
GCCAATAGGTGCTCAGGTTACTTGATATCACCTGGATGCACTTTTATCTTTTATGTTGAA
CTGTATGGTCATGAAATATCCGTGCATTGAAATGTTAAACATGACTGACCTGTTACCTAC
ACTACCTAGTTAGAATGGTGTCGCAGCAGAAAAGTTTTGTCTATATATCATGGATTTATA
GCTGAAAGAGTTTCCTTGAGTTTATTCATTTATCGATTTATATTTTCACTTGGCTGCAGG
TGCTACTTACAACACCAACCACACCAACAGAGAGGATGAAGGAAATCACAAAAGCTTCAG
AAGGATTCGTTTATCTTGTGAGTGTCAAGAAGACACCTACTATTTGCTCAAAGTTTGTCA
CTAGATTCAAACAATATTTCTTGCTTTTATCCCTTAGTAATAGTTCAAGTAGTGTGGAAT
ATTTATTAACTAGTCTATGTGTTTGCATATTAATAACACACCATATAATTTCTCATCTTG
GGTATATAACTTCCCTGGGATTTGAGCGGAAAAGTATTAAAGGAAGGCAACTGTAAATTT
GTAAACTGCAAGCAACATGAAGGGTCACTTTATCTGTTATGTTCACCTCATGTTGTACAT
GAACCCTGATGTTTTTCAAACACTCGATTTGGTATACGTTATGCAGGTGAGTGCTGTCGG
AGTTACAGGTGCACGCTCAAATGTAAACCTACGCGTTGAGCATCTTCTTCAGGAGATCAA
GCAGGTTTGTGAAACTATAACCCTCTTCTCATTGGTAATAGTAAACTGGAGCAAGCATAT
AGTTTTGTGTATAGAAATTTGCTCTAAAGAATGCTTAAAATTTATATAACAGCTTCTTGC
CCTGAGTTTTCAGGTTACAGACAAACCTGTGGCTGTTGGCTTTGGCATATCAACTCCAGA
GCATGCGAAGCAGGTGAATATAGGCTCGCACAACTTCCTTGTCAAGTGTTTGGTCTATCT
TTTGTTGCATGTTTCGACAGCTTTGCTGTTTGTAATACAGATCGCAAGCTGGGGAGCGGA
TGGTGTGATTATTGGCAGTGCAATCGTTAGACAGTTGGGCGAAGCCGCTTCTCCTGAAGA
GGGACTGAGAAGAATAGAAGAGTACGCCAAGAGCATCAAGGCTGCTATTCCATGAGATGG
GCAGTTCCATCATGAACAAGCCAATTAGTAGATCGTAAGCATGTTGTTTATCATCTGGTA
GTCTGCTCGGTGGACCTGGAATCTGTAATTCGTCCAGCATATTTGATTCCAGTGCTCAAA
ACAATTATATCTTTGTGTGTTAGAATCACAATATGAATTAACAAGGTAATTGTTTCTCAT
TTCCCTTTTGAGGAAAAAAATTGTGAGATGTGTGTTCTTATGTGGAAATATGGAATGTTA
GAATTTGGAAGGACTTATCCTGAGAGGAGCAACACGATAAGTCCATGGTGCATTTATATG
GCTCGCTTGAATTTTGCCATCTGAGTGCATCATTCTTCTCATTTTCTATGCACTGAAAAT
GACACTGCCCTCAGATTCTTCTTCTTGCCTCTTCAGGAGGGATGCAGGGTCTATCAGGCA
AGGCTACAGTCTGAGCCCCGCTGCACGGTGTGCCGATAACTTCTTGTTTCAAGATCATAT
TTATTGGGTACTCTTCCTTTTGAAACATGTGTTGTTTTAGTAAACGACACAGTCAAACAT
TTTATGCACCATTAGATTTTTCAGGATAAATGCTTTGATACAACATATTTACGGTGTTTT
TACTGTATCCGAGCTGCATATTGGTGATGTATACTTATCATGCAGTTGTAGAAATAAAAG
GTTGAGTTTCTATCTGGCTTGGATCCCTGGACATGGTCAGCATGGAAGAACCAGTCCCTG
GTTTATATGTATGATGTCATTGATTATTATAATGTCTAACTGTACCCACTTGTCAGCATT
TCATATAAGATTATTTGGAGGATGAATGTAGCAACGACAGAAACATCATTGACTTTTCAG
ACCTTTCCCTTTCCTGAACTGTACAGATACATTTTTTTTTCTATGAACCATGACATTAGA
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CATGCATCCAAGCTTCCAAAAGAATAGTGTGGTCCAGTGTACTCTTGGGCTATAGTAGTA
GTGTTGAAAGTTGACTTTTCTTCTCCCGTCTCCCCACACCAACTGAGCGCAATCATCTTT
CTTCTCTCAACTCTGGCTGGAAGACAAGATCACATCCATCTGCAGCCATCTGCTCATTCA
CCATTTATCTTGCCTCAGGTTCTTAACTTCTCTTTCTTCACATTTTTTTCCATTTCTACA
TAATTTCTTTCTCGTTAATTTCTTTTCTTCTCTGAAATTGAATATCTTGCGATTTGCAGG
AATAATATCTACTCTCAGAATGGGTGCTGAACTAACTGTTACAGGATGGTTCTTGTCGCC
AATCATACGGGAGATGCAGGACACCGCTTTGGCCTACATAAAGGGGCAATTCAGTTGGAA
GAAAGATCAGGAGAAGGACCTTGAACGCCTTGACATCACCCTGACAGAGATACTGACCAT
TGTGGATGTCATCGAGAAGAGGGAGATTAAGGATGGGAACCAGAGGAGGCTGCTAAGCAT
ACTTAAAGACGCAATTTACGACGCTGTTGACGTGCTGGACGGCTTCCAGTACATGGTCCT
GAAGTCCAAGGTTGACAGCCAGTCTGCGGTGAGTCGTGTCACCTCAACCTGTATTTACTT
GGGTAAACGTTTGATCGGCGCCGACGAATTCCGGGGGAAGCTGGCAGATATTTTGGAGAA
ATTAGGCGTTGTCAAGACGACAGCAGATACCCTATTGAAGGTAGTTAATTTTGACAATGC
TACTGCAAAGTTATTGCCAGTAACACGGCTGCGTGTAACTTCCCCTTTGAAGGAAAATCA
CCATATATATGGTCGAAGAGATGAGCTTCATAAGCTGAGAGATATGTTGTTTGAGATAAG
CGACAGTAATGCACCCGGACCCAGTAATGCACCTGTACCCAGTGACTCAAGCATTGATGT
TATATTCATTATAGGTGTTGGTGGGGTTGGGAAGACTAGCCTTGCACGGTTGGCGTTCGG
AGATGAACAAATACGCATGAACTTCTGTCTCAGGATGTGGGTTTCTGTATCTGATACTTA
TGATGAGATTAGATTAACAAGGGACATTTTGGAGTCCTTAACTGATGCAAATTATCACAC
TGTTGCTAAATTTGATGAATTGCAGAATGCTCTTCGTGGAAAGATAGCTGGAAAGAAATT
TCTCCTCATACTAGACGATGTTTGGTATGACGAGGACAAAACAGAATGGGAGAATGAATT
AGTATGGAGCAGAGTCTTCTCTTCTTTAAATACTGGACTGGAAGGGTCGAAGATTTTGGT
GACAGCTCGAGCTGACAAAGCTTGCAGTATCCTACATGCTAGGACACCCCCTTTACGTTT
GGGAGGACTGGACAAAGATGATTACTGGTTGCTATTCAGAAACCATGCTTTTGGTGAGAA
ATATCCAGGACAATTTCCAGAACTCAAGGAAGTAGGAATACAAATTTGTCGCAGATTGAA
TGGTTTGCCTCTAGCAGCAAAGATAATTGGTCGCCTATTGAATGCTGATTTGGATGTCAG
CCACTGGACGAAAGTTTTGGAGAGTGATATATCTGATGATGTTATGAAGGTTCTCAGGTT
GAGTTACCAGCACCTACCTGTCCAATTGAAGCTATGCTTTAGCTTCTGCAGCCTTTTCCC
GAAGGACTGGCGTTTTGAACCTCAAAGGCTCACTGAAATGTGGATTTCACAGGGTTTTGT
GCAGAAGGAGGATTCATATGACACCGATTCAAATATTGAGGATGTGGCAAAGGGCTACTT
CAATGAACTTGTGCAAAGATCATTCTTTGAGCGGTCATTGTTGGACCTCCCAACAGAGTA
TGTCATGCATGATTTGATCAATGACTTGGCTCGGAATGTCTCGAAGGATGAGTATTTCAG
GGTTGAAAATGATAAACAAAAGGAGATCCCATCAAACATTCGTCATCTATCAATATCAGC
AAATTTGTTAGGCAGCATGAAGAAAACAGAGTTGAGAAATTTGCGCACCTTGATTGTTTG
GAAGAAAACATGGTCTTGCTTAAAATTGTCCCTTCCAGATGATGTATTCAAGAAGTCCAA
AAGCATCCGTGTGCTGGACTTGAGCGGTTGTTGCATGGATAGGCTGCCGACATCAGTGGA
AGGTCTTAAACATCTGCGTTATTTCGCTTTTCGGGTTCCTGAGAGGCCATGGCAAACATC
ATTGATTCGGCTTTTCCACCTGGAGGTCTTGGTCACAAGAGGGCACTCCTGCCGGGAAAG
TGAATGTGCTAACCTTCCTGCAAACATGAAGAGGAACCTGCTCAAATTAAGAAAAGCTTT
CCTTCTCAATGTTGGCGGCGCCACAATATCTGGTTTCGGAGGACAAACTCTTCTCCGTGG
CCACGGGGAGTTCCATGTCAGGAAGGAGAGTGGCTACAGACTAGGTGAGTTGAAGGAGAT
GAAAAATATTAGTGGACAGTTAAAAATTAGATCTCTCGATAATGTTGAACATCAGCAAGA
GGCGGTTAATGCCTGCCTAGATTGCAAAGAGCATATCAAATATTTGGAACTCGAGTGGAG
CATCCATGCAAGGGCTTTAACTTCTGATATTGATAATGATGTGCTCAATGCCCTTAGACC
TCACCCTGATCTTGATCGGTTGAAGATCACTGGATATGGAGGAACGAGGTCGCCCAGTTG
GTTTGAGACAAATTGGCTGATTGCATTGAGTTCTTTAGCTCTTGAGAACTGCATGGGCTG
GGTAGAGTTGCCCCCTTTTGGTCAGCTTCCTCTGCTCAAGTATCTTGAACTAAGAGGCAT
GCATGCTGTCAAGCAGATAGGTCAAGAATTCTATGGGAATGGTGACATAAAGGGCTTCCC
AATTTTGGAAGACATGATATTTGATGGCATGCTCAACTGGGAAGGCTGGTCTGCAATCCA
AGATGGTTCTTTGTTTCCTTGTCTTGAAAGACTACTCGTATCACGGTGTCCAAAGCTTCA
AGAAATACCAACCTTTAGTGCAACACCAAGAGTCGAAGTCGAAATATCACCTGATTCCCC
GGCAGCTTCTTGTTTAATCGAGTCACTGATTGCAACCGCATCACGGTTGATCTTTCTAGT
TAGCTCCTACAGCTTCTTGAGTGACCTAACCACTGAGCAACTAAACCATGTTTCTGAGTT
GAACCTGCAGAACTGTACAGATCCAATGCCAGGTGGTGGATTTCACAGACTTAGCTCCCT
TCAGGTGTTCAGGATCAGCAACTGTTCAACGTTACTGTCATCAGTTAGTACAGAAGCAGT
TGACACATATTTACTTCCTCCATCTCTTTGCCATATTGAAATAGCTCAAAGCAATGTTCA
TTGCAGCTTATTACCAAGGTATTTGCAAGGCCTGACTTGCCTCTCGACGTTGGTGCTCAA
TAGCTGCCATTTGATGACATCATTGTCATTTGCTTCTGAATCCCCTCACCTCGTTGCTCT
GGAAAGTATAACGATCAAAGATTGCAATGAGCTGGCTTCATTGGATGGATTTAGAAATCT
TAGTGCTCTACGGAAGTTAGTTGTTGCAGATTGTTACAACTTCTGCTCCTTGCCAGCTGA
CTTGAATATTGTGGGATCGCTTGAGAAATTAGTCATATGTGGGTGCCCAATGATGAGGTT
TCTCCCTGAAGATGGCCTGCCAGCTTCTATGCAGATTATTTTGTTATCGAAGTGCCATCC
AGAGCTCGATACCCGGCTTCAAAGGAAGGAAGGAGCTGAATGGAACAAGATTATTCATAT
CCCCGAGAAGAAATTAGAGGTATATACTGCTCGCGTTCAGTTATGTAGGATTCTGATGCA
GTGTCTCGTTCATCTTATTACAATTTCCGCGCCCTCTTTTATTTGCACACTCTACTTGTA
CTTTGGTGGAGCGTGTTCCAATAATTGACAAAGTTTAACCACTTCTCTCGTATTGCTAGT
TTGCAACAAAGTTCAATTATTAGTATAATGATATGTCCTTTTACTTATATTATGTCATCT
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GCAGGCGAATATAGGCTCGCAGGACTTTTTGTCAAGTGTTAAGTCTATCTTTTGTTGCAT
GCTGTTTGTAATACAGATCGCAGTGTGGGGAGCCGATGGTGTGATCACCGTCAGCCCAAT
TGTTGGACAGTTGGGCGACTGAAGAAGGGCTGAGAAGAATTAAAAGAGTACGTCAAGAGC
ATCAAGGCAGCGGTTCCTCGATACGAGCTGTTCCATCATGGGTAGTTGTTTTTTGCTTTC
TCTTTTGAGGAAAAATATTGAAATGCCATGTTTCTTGTGCTGACTGAAACATGGAATATT
GCAATTCAGAGGGAATTATCCTGAGAGGAGGTACAGGATAAGGCGGTGGTGCATTTATAT
GGCTGGCTTGAATTTTATCATTTCGCCTTGTTTTCTACGGCACTGAAAATGACATCGCCG
TCAGATATTTCTTCAGGAAGGGATGCGTGGTCTGTCAGGCTGAGCTATAGTGTGGTCCCC
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GGGGAGAAAACGTTCTTTTATCAAATAAATCTTGGTGTTTTAGCCGCATACTGGGGCCAA
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AGTTTTACAATGAATGAAGAGATAAAAGCAAGACACACACACACACAGACTACCATCACT
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TATCCGCTTTTCACAGATGAACTTGAGCCGCTGGAGATCATATCGGTCTGCCGCTACCAA
CAAGTCGTGCAGCCACTGCAGCTCCATTTCACGCGTTTCTGACATTTCATCATCTACAGC
TTCATCTGCTTGTTCTTGTTCCTCAGAAACTATCATGCGATTCTCCTCCATGATGTCCTT
GTACATCTCAGGGAATGAGTCTGTGTAAACGAAGCTAAGCAAAGCCCTGAACACTTCTGC
TTCCATGTCTTTGATCTGTATGATGCTGGACGTGGCAGTGCCCTCCTTCATGGGGCCAAA
GAGTTGTGCCCTGAACACGGTGGAACGGGCTTTTTTTTTAAAAGGAGGCTTAGCCCCGGC
CTCTGCATCAATAGATGCATGCAGCCATAGGTGGAACGGGCTGCAAGCACGCACCGGTGT
GCGGCGAACGTCTCACCGCCGACCTCAAATGTGACATCAGCACCCAACTTATTATCAAGA
AGATTGCTAAAATGCTGGTGTATGTCAGGCAGGGTGCCACCGGCATCATCCTTAGTTTTG
GGGTCCTCGCAAACCATGATGTCGCACCGGATGGTAAAACAATCACATGCCATATCCATG
GACTGCTCAAGGACATCTCTTCTCACAAACTTGCTGATGCCCCACATTGGAGCACTGCTG
GAGAAGCTGTAAGTCTTAGTTCCACGAATGTACACTGGCATCTGCTTCTCAACCTGGTTG
ATGAGACTGAAACTGAACTTGGCCTCCACGGGCTCCTCTCGGTCGACATCGGCATCATAG
AGAAGGGTTAGATAGACAGAAATGTAGTCAGCGCAGCTCGGGTTCTCGCCATTAGGGTAA
TAGTCGAGCACCCACTCATGGCCTCCTATTACAAAAGGACCACAGGTGATGTTCTGGCCG
GTGGGCACCAACCCATTGATACGCGAGCAGGCCTTGATGATGAGCAGGTGGTACCCGGTG
TCCACATCGGTGCTGGCGTGGACGCCCGACATTTCGCAATGGCACCGGTTGTTTCCGTCG
AGGACAGTTACGCCGGCGAACGACGACATGACGAACCTGCGACCTCACCGAAATCTATCT
ACTCAGTCACCAGTCACATTCCTAATAAGTTTCAGAGCTGAGAGTTGGGATCAATGGGCT
CAGGGGCGAACCTGGGATTGGACCGGCGGCCGCTCCACTCGCTGCGCCGGTGTCGCCGAC
GCCGTTTCTCCCCGGAAAGAGGGTTTGCGGCGAGCTGAGAGGCAAACCTGGTCACGGCCG
GCGGCCGCACGCACAGCACGAAGTCGCCGCCGCAAGAAACGAGCCCCCCGCCCGCCGCGC
CGCCGCTTCACTTAACGGAAACAGTGTTTGCGGCGGCGGCGATGGCTCGTCTGCGTGCGA
CTGGGCCTGCCTAGAGCTAAGCTAGGGTTAACAACAACTCACCGCGTTATTGGGCTTGAA
GGCCCCCAGTCTACGAACTGCAAAGCCCAAGGCTCAAGGCATATTATTTTATTCAGTGTA
AATGGGTCTGAATTTTGTGGGATGCAGGAATATAATCCAGTCAAAAGATGTGCACATTAG
AGTTTGTATTTATGGAATGCCAAGCAGTACTTGACTGATTTTCTCTTCTCACAAAAAGTG
CTTTTTTATTGAGATTGAAACTTTCTACATCTGTATTTACATAATTCAAGGTTGTTCTTC
CCATCAAATAAACTAATAAATAAAATTCAGGGTTGTTCTTTATGTTATTTTTTTTTCAAC
ACGTTAAGAGCCACTCATGTGGGAGGAGGTCTCTGTGCACTTGTCCGGTATGATTTTGAG
GCATCAACGATGGGACTTATTTTTTTATTTTAAATAATTTAAAACTTTAAACAATCTTTA
AAATTTTAATAAACTGAAAATT