Map Locations of contig_1558239 (9261 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_1558239

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10018 1 810 bp None Available Available None
MLOC_10017 4 1577 bp MLOC_10017.3 Available Available LOC_Os02g54160.2, FRAME:-1, EVALUE:2e-111, 13102.m12340 protein AP2 domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_10018






CDS Structure of MLOC_10017






Contig Sequence (9261 bp)

>contig_1558239 9261 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTCTTTTTCACATTACTATGTTTATTTACTCTTTAATTTTTTTTTAATCTTTTGTTTTC
TTTATTTACCGTTGCTCTCCCGGTATAATATGATTTTTTTCTGACATACGTTACTGAACA
TGTATCTTAGTACACAGTAATTTCTTTCAATGTTTTCTAAATACACAAACATTTATTTCA
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TTTTATATGGCGTGAATTTTTCAAGACAATACACACGCAAGCGTTTATATATACATGTAA
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GTTTGATTCTCTTAGTTGCTATTTGGCGGAAGGCTTGCATCTCTGACAAGCTATTTGGTA
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TGATCCGCTGACTTGTGTGTATGCATTCACACATGTTTAGTGTGTACGATTTGCGGCACA
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TCATAGCTAGTTACGCCATTTATTAGCTCAAGATTGTACTACACACTTGTAGTATGAGTG
TACTACTACGGTCATACTCCGCCCGTTCGAGTTTATTGGATGGGTTCATCCAACCAAACA
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ATAGCTAGTAATTTCATTTATTAGCTCAAGATTGTAGTACATACCTATAGTATGACTTTA
TTACTACTATCACACTCCCTCCGTCTGGGTTTATTGGACGGGTTCATCCAACCAAAAGTT
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TGCTTCAAGTGCAATCAATAACATTATCATATGGTAGTTATATAAATTGTAAGTTAACAT
TGAAATATCTCATCGCATCCTCGATCTAACATTTTCTAAGCTAACATGACATCGTTTCTA
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CTGTGATCCTAGTAAATCACACATATCTACTTACCCCATTGAGCTACTATCACGTATGTG
CAATCATTAGCTTCATTATACATTTAGTTGAATTCTAAATGAGCATTGCAACTTTCTTAT
AATGCACTCATGATTTAACCATGTACATAGATATTATTAACTATTTTTGTAAACTTCATG
GCAATGTTGCTTCACGACTTTGTGTCTTACTTGACACCGAGAATAAATGATTTGAGAGTG
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ATTTAGGTTCCGGAAGCGAGCATTTCCATTCGGGGGAATCTTTCATGTAGACCCCTTGGA
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GTTCTCTGTGCTGTCCAATCTACCCTAACAATGTGCAAGCGAAAGGCCCAACTTGGTGGT
CCATGATGGGTGGGACGCAAGTGCACACAAGGCCATCGTCATGGGATGGCTTGACGCACG
CCAGTTAGATCCCTTTCGTCTGGTACCCTGCACACAACAGTTGAGTAATACCCACCTATG
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CAAAGGGGGTGAGCGAAAGNNNNNNNNNNNNNNNCCCAGGTTCGGCCCCTCGTGTGGAGT
AAAAGCCTACGTCCTGCTTTG