Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_1558231 (4747 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_1558231

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_10012 1 2280 bp MLOC_10012.1 Available Available LOC_Os08g16610.1, FRAME:+2, EVALUE:4e-167, 13108.m01775 protein Rad21 / Rec8 like protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_10012






Contig Sequence (4747 bp)

>contig_1558231 4747 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCTACCCCCGCCGCCGGCAGGCCCTGCAATTTAGCTCTCCCCTAGCTTCCCCGACTC
CCTTCCCCCGGCCCCTCTCCCCCCCCCCTGCCGCCGCCTCAGCCAAACCCTAACCCGCCC
CCCGTGAACCCCACCCTCCCTCCCTCCCCACCAGGCCGCAGCGATGTTCTACTCCCACTC
CGTCCTGGCTCGGAAGAGCCCGCTGGGGACGGTGTGGATCGCCGCGCACCTCGAGCGCAA
GGTCAACCGGACGCAGATCGACTGCGTCGACGTCCCCTCCTACGCGTCGTCCATAATGGA
CCCCGAGGTCCCCATCGCGCTCCGGCTGTCGGGGCATCTCCTCCTCGGGCTCGTCCGCAT
CTACTCGTGGAAGGTGAACCACCTCTTCCAGGATTGCAACCGGATGCTGAGCGAGGTCAG
AACCGCCTTCGCCTCCATGGCGGCGATAGATCTGCCAATCGACGCGGACCGTGCCCTGTT
CGAGGTAATCACTTTGCCGGAGACCTTCAGCCTGGATGATTTGAACCTTGATGATGCGAT
TCGTCAGATTGATACGCCGGACCGTCATCGGCGGACCTCTGATCAGATCACCTTGTCTGG
AGAAGGGTATGTGATGATCACCCTTGACGAGGAAGGTGGGGCAGAGTTCACCTCTCCTGC
CGGTCGATCCTCCGGATTTGAGGCTGAACAGCAGGAGCAGGAGACGTTCCCTCCTTTGCC
AGATGATATCATTTCTGTAGATCCTCCTCTCCAAGGCAGTTTTTCAGTGACCCACCAAGA
AACACCAGAAATATTGCGTCGAGCAACTGATAGTGTGTCAAGGTTTGAAGATGTTATTGA
TGGCGGTGACCTCATGGAGGAAGATCCGTCGCCGTTCACAGAAAAGGTTACCACGCCACA
ACCAATGTACTCACCTTTATCACCTGTGCTTCGGACGTCCATTCCCAACGTACCAGCCCG
TATCAGCCATGAGCCTGTTGATGAAGAAGATCTGGAACCAGCAGGTGGCACTGGAATCTT
GGCACCTGCAGCATTTATCCTTGAATCATCTCCACCACCTCAAGTACAAGTACAAGGTAA
CAGGAGAAAGAGAAGGGCGAATGTACAAGAGAACAGGAGACGGCCTAGAATTGATGATGA
AATCGGGCTCTCCAATGATTATTTGAGGGATCAAGTTGATGGCACTGAACTAGGTAAGTT
GGCTCGCAGGAGAAAGATAATGCCCCATTCAGCAGTGGATGTGTGGAGATTCAACAGGAT
AAGCCAAAAGGACAGCCTCTTCTCTGAACCTCTGGTGCAAGGAATGTGTAGTGATCTTCA
TAAAGCTTATGAGGGGAACTACCCTCATGTGAGTGACTCTGATGCTCAGCCTGCCGATGT
TGTAAATGTTCTTGACGAGGTTCAGCCTGCCGATGTTGTGAATATTCATGACGAGGTTCA
GCCTGCCGATGTTGTGAATGATTGTGATGAGGATGCACCTATAGGAAATGCAGATACACA
GGAGCTTCAACCTCAGGTCACCTCAAAATCAACAGGAAATGGAGAGGCAACGCCATTTGA
TTTGTCACCCGAGCTCCCTCGCTTCTCTCCACAGAAGGGTCTATCTCCAGTAAGAGAAGA
AGATCACACCCCTTTTGAAACCTCTGGACGAAGTGGAACCCCATGGTCAGGACTTGGAGG
AACCGGTGCTACTGTACCAGTAACACATTGCAGTTATGCATCACCTGGAAAATATACTAT
TGAATCTGATTTCCCATTTGGTACTGATGATCTTGATGAAGATCTACCAGAGTTTCCTGG
GCTGATGAATACCCCTAGCATGATATCCAGTGTGGGTACCAGCACCACAGGATTAGGCAG
CATCATGTCTACCAGGACAAGGGCTGCCGCACAGTACTTCAAATGTATGATGTCTTCAGC
CACTTCAGAAGACCAGCAAGGGAAATTCAGTTTAAACAGAATCTTGGACGGGAGGACAAA
GAAGCAAGCTGCAAGAATGTTCTTTGAAACGTTGGCCCTGAAGAGCTATGATTATATTGA
TGTCTATCAGGAAGAGGCATATGGTGATATTTCAGTTTCGGTTAGACCGTCACTCTCCAG
TGCCAAACTTTGAACTACTCTGTTTTCCTTCAGTTCAAGTAGACTTTTTTGTTTTGTTTT
CCTGGCCTGTCTAATATTAGTCCTGGTTTAGAATAGTGCTATGTTATTTTACGCCTTCTC
CTAATGTTCCTGTAATATTTGGCGTGTATCTCAGTTTCTGTTAGTTCTGTTCAGAACCTG
GCAATGCTAGTGTGAGTGGAGCTGAAGGTGTTTTGTATACATTGTGATATGTTGCAACTC
TCGTAATCTTTACACCTGTGCCGCGCTGACGTATGATTTTCTTGGTTGATATTTTGCTGT
GTGACGGTGTTGCCTATTGGAAGGAGGGAGTTGAATATTGATTTAGCTTTAGCGCATAGC
ACATGAATGTAATTCTTTTGGTATAATTCAGATTTACGAGTCAATTTGATTGGTGACACC
GTACAGTAATAATGTAGACACATTTTGCAAATAATACATCTCCTTTCAGACTTTCTTCAA
TTGTCTGGTCCACAAAGTTACAATCTGGTAAATAATATCAAATTACACTCAAGTATTATT
TTATTGAGATTGCACTCAGAGACTTTTCCCTTGAAGTTTTCCAGCGGTGTGGCAGGAACT
ACAGATGAATGGTTCCAATCATATCCCTGTAGGTAAATGAGCAGAATTATTTTGTAACAC
AGTTGCAGAACATCTAGGTCATCTGGGTTAGATTTTGCTTTTCCTCTTCTCACTCTATAT
CATGTTAGCCATCCCTTCTTAAGCTCTAGCCTGAATAGGGGAAGCTACCTGTGCTATCCA
GATCCTATGTATCACTTGCGCCTTGCCTTCCTGTCTTAAATTTTGATCCACCAAGAACAA
GCCGGTGGTTATAGGAACTTTTATTTGTTTCTCAACTGAAAGTTATCATGTAATTCTTGA
ATGAATTAGCACTCATTTCTTGATGTTACCCTGTGGGACTGAAAAATGAAACAGTATGTG
CTTCATCATGTGGTCCTGGCTTTTAATAAGAGTTCTTCATTTGTTTTCAACAGAAATTCT
TGCCTGAATCTTGCAATGTAGATAGTGTTAAGAATGGGGCTGAAGTTTTCTTCTGATGTC
TGTCAAGGTAAGGTGCCAAAACTTTTCACTCTCCACGAACAAGCCTGTGGTCATAGAGGC
TTTTGTTTGTTGCTCACCTGAAAGTTACCTGTAATTCAGTAATTGTTGAATTAACTAGAG
ATTATCTGTTGATGTTTATTCTGTGTGTGGAACTGATGAATGAACTTCTGTTTGTTCACA
TATCTGAGATAGAAGGGTCCTAGTTCATGCATAATGCATCTTATTGTTCTGTTTACATGC
ACCCTGCTGAATAGTCTTAGGCCAAGGAGAGGGAGGGCACCGTGCGACAAGCTACACCTT
AGTCGTTGGTGCTATAAACATCTGTGATCACCAACAATTTATAGTTCATGAAGAGGCATG
CCTGATTTCAGGACCAAAGGTTAGTGATTTTGATCAATGTTAGCTTCAGGATTACGCAAT
GCATGTTTCTGTTTTGGTTAGATTGTTTAAGTGTGCTAATTCAGTCATATTCACATTCAC
AGTGTTAATATGATGCCAAGTCTTATTTATGCCATTATTGTTTGGGCATTACCTGAAGGA
GAGATCTGTTGATGTCCAAGATAGGTTAATGGTTAGCTTCTCAAGGTTCATCTGGTCTAT
AATTTATCTTAAATTGTTAAATAGTTTTATTCTGATACACCAATACTTGTTCGGAGGACA
GGTGGGCACTAATTTAGCCTGCTGATTAATAAAGATTTATTGTTCTTGCTTGCTATCTCT
ATGATATTGCCCGCATCAGAACTTGAAGTCATCATGGTATCCTTGTGACATTTCTTGGCC
ATGCTCTACTACTGGACTATTGCTTCAGACCAACCAGTAAACAGGATACTGAAGCATTTG
TAACTTCACTTGAATATGGGACAGACATACTGCCAAAGGAAGGTGAGCTAGGTTTATGTC
TGGTCGAACATTTCTCATCAACAGCAATGCACCAGGACTTCTCCATAACAGATTTGGAAC
TGCAATGTTTGGTTTACTTAATTTTAGTGCTCATTGTCAGATTGTCAAATTCATTGAAGC
AATATATACTGGAAGTTCTGAACTATAAATGGGTTCAGTATCTTATATTTGGTTTAGATT
GCAGACGGAATGCTGCCACACATAAGTATAGTGAACCTGCTTTCAGAAACGCTTGGAATA
TCAGCGTGTTATATTTGCCTTTTTAGTGGCCGTGGCCGATGACACTTTTATGATGACTAG
TTTGTGCACTCAATTTTTCCATTTGTCCAGCGAGTAAAATTAGATGCACTATCCATGCTT
TTGGATGGGGATCTTAATTTCTTCTTTCCTTTAAGGAGACGCCTGCTGGTTACATTGTTC
ATGCTTGTGGATAGGGATCATTTTTTTTAAACGCGGTCCCTTAGTTACCGATCTCATTAA
AAAAGGTCGAAGAGAGTTGTCTGGTTAATCGAAAAACCGGACTAAAACCGTCACAATGCG
CCTGCCACGACAAGACACACAGGGCGACCTGGCAACCTACACAAGAACACACACACGCCG
CCTAGGGGAAGAGCTCCGTCGAGGTTGTAATCCGACGTCATCGTCATCACGCCTCCGCGA
GGGCGAC