Map Locations of contig_1558026 (12643 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1558026

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9892 1 4218 bp MLOC_9892.1 Available Available LOC_Os04g57140.2, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13104.m11966 protein kinesin motor domain containing protein, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_9892






Contig Sequence (12643 bp)

>contig_1558026 12643 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGCGCCCCGCGCCTCCGCGGGGCCGCGGGGCGCCCGCCAGCGCCACCGGCGGCGACGG
CTACGACAGCGACGGCAGCTACAACTTCGCGCCTCCGTGAGTAGCCCCCCAGCCTCCTCC
TCCTCCTCCTCTTCCGTGCCGTCTCGTGTAGCTTTTTTTTCTTCAACGAATTAAGCCGCT
CTTTGCCCGTCTCCTGTAGCTACTTCGGTTTGTTCTGCTTGGCGGAATGATACTACTTTC
TGGACCTGTTTCGATTCTGGCATCACGATTAGATGAGATTTTTTGCTGCTTACGCATGCC
GTGCCTTTTGGCATGTTTGTTCGTCCCAGGATTTGAATTTTCTAAGGTTGTTTCATAACA
GAAAAGTTTTCCCAGACCGGTGGAAAGCGGAGAAAGGTCGGGTTCAGACTTGAGACGGAC
GCTTGTTTATTTAATCAGGGTTAATGTCGCTATATTCGGTTATGTTTGTTGGGCTTGTAA
TCATGACCTACCGCACTGCAATATACTGTAATGGTTATTTCCAACTGGAGACAGTCTCAA
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GAAATTTCAAAAGGGAGGGAGAAATCATCTGCTACTGTACGAAATGCTAACTTTAGCATC
GAGCATAACCCGTTATTCTATAGATGCGTGGGACGGGGCTATAAATTAGTTTGTGTGTGG
GGTGGGTGGGTTGTTTACATTAAGAAGGATAAGTTGCATTACTTCCATGCTTGAATTCTC
TTCTAAACTACCAGAAAAAGGAGTTTCTTCTACCTACCACAGTACTCTCCATACAAAGGA
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GCTTGTTGCAAAGCTTTATAAGCATACTTTGAAGCGGTCTGAACTTCGAGATGAGCTATT
TGCGCAGATTTCAAAACAAACACGTAATAATCCCGATCGGTAAGTAATAGGTTTGTCATG
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ATTGAATGTATATTTTACTGGAACCGCCCAACCATAGTTAAAATGGAACCTGTGCCACAG
CATCTCTGGCTGGATTCACTTGTATGTAGCTCATTGCTACTAGGTGTATACACAGTCTAG
AGAGTTGCTCTGTTCAGAATTTCAGATACCTCATGACTGAGCCTAACCACCTTATACAAT
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GGGAAGTAAGTAGTCACAACTCACAGGGACCTTCTTCAGCTCCTATAGTTCCATAAGGTA
AATGCACAGCTACTCAACCCTGCAAAGGTGTTGCACTTTGTGCTCTGTGTCATACATATG
AGCCATTGTGGCTACTTGCTTATTCCTTAGTATTGTTTGACCAAATTGTGGTTATTCAAC
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TTCAAACTTGTATGCATGTTTTTTTTTGTTGACTTGAAGTCGTAAGTAAACAAAATATCC
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TTTACTCTCAAGTTGCAGCCTCCCTTTCTGTCGAAATTTAATTTAATTAATTTATTTCTG
ACATGCAGAGGAATACATTGGGTTAGACGACAACAAGTACATTGGGGACTTGCTATCTGA
ATTCAAGTCAGCTAAGGATCGCAACAAAGGAGAAATTTTGCACTGCAAACTTGTATTTAA
GAAGCGCCTCTTTCGTGAGTCTGACGAGGCTGTGACTGACCCGATGTTCGTTCAGCTATC
ATATGTCCAGGTACTGGTTTACGTAGCCAGATGAAGAGCTTACAGTTTGTAGGCTATGCA
GGCAATTTTGTTTCCAACATAGCACTGACCAGTATCCTTCTTCTGCAGTTACAACATGAT
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ATATTGGTCGAGATTGGATTCATTGACAATCCTGAGTCCTGCGTGTACGTAGTTTATAAG
GCTCTATGATCTCTTATCTTGCTTTTCCATAGTTTTTTCTTAATAATAATTCATCGTATT
TTGTTCTGAAATGCCATTTTTCTTTTTGCTAGTGAATGGATATCTCTTCTAGAGAGGTTT
CTACCTAGACAAGTTGCAATTACTAGAGCAAAGAGAGACTGGGAGCTCGACATCATCTCA
CGCTACCAGTTAATGGTATTCATCTAGCTGTGCAACTTTATGCTATTGAGTATCAACTGT
AGATGAATCACATCACACAAATTTGTGCACTTAATTTTCTACACATGTTTTTTCATCTCC
ATGTCCTGCAATAATCATAACAGTGAGTGTATTTGTGATGCACCACAAACTGTATGAACA
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TTGATGCATGCCTGGTGATTTTTTTTCCCCACGATCTGATTCTACATTGGCAAGCACATG
TGATATCTCAGTTACCTAAGCATTTCACTGTTGCATCCAGGAACACTTGTCAAAAGATGA
TGCAAGGAACCAGTTTCTCAGAATCTTAAGAACTCTTCCATATGGCAATTCAGTTTTCTT
CAGCGTTCGGAAAATTGATGACCCAATAGGACTTTTACCTGGAAGAATCATTTTGGGAAT
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GGAATACCTACATTCTGCAGAGCTGAGAGACATAATGCAGTTTGGGAGCAGCAATACTGC
TGTTTTCTTTAAGATGCGTGTTGCTGGCGTCCTTCACATCTTTCAGTTTGAAACTAAGCA
GGTATTTTGAACCCTCACAGAGGAGATAGTACATTAGCGTAATCTTATAAAGCTGTCAAC
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GTGAGTTCAGAACTTTGTGAGAAATGTCTTATTACCTGGTAAACGTTGTGCAAGCATTCT
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TGCTAGCTATGCACATTGTAATGTGCCCAAGTGTATTTGCAATTTTCAGTTTACATGACT
TCTTCCATAAGGAAAGACTAAAATTCCCGTTAGCTGATGTTTTTGAAACCTAACTTTTGT
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ATGGTCCTTTTTTATTGTTAGTTGCGGGATGAGTTACAGAGGAAGACACAACAAGAAAGA
GAGATGCAAGAAGAATTGGAAGGGCTAAGAGATACCTTACAATCTGAACGACATATCATT
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TTTTATTAGGTTGCATTGGTGGAGAAAAATAGACTGGAGACCAGATTAACAAATGGTCAG
GGCCACGAGAACAATACTAAAATAGACTTATCTGGTAACCATTGTGAAAGAGATACTTTG
ACGACCGTAGGCAGCGTCAACAGTGGCATTGAGGTATTTTACAACAGTCATGTACATTAT
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CTGGTCTTGCAGCGAATACTTTATTTGCTTCATATTTCTGAAAATATTGTTACTTTAACT
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ACAGCTACACTGGAAAAAAATTTGGAAAGTACAACACAGTCATTAAATGTCGCTGAGTCA
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GGTTCTGTAGAAATTCACATACGTCCATTGTGCGTTCATTCAGGATGTAGACAGAAAAAA
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TAGGTTTTCTTTCTGTCGCAATATAATTCACTAGAGCAACATATATATGATCGTGTATCT
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AGATATTTATATTTCTATGCAGCTAGCTAACTTGTGCTTTTCTTTCTAGGGTGTTGTTAC
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AGGAAAGGTATGACAGCATGAATTTGAGAAGTTCACATAACTTTTGTTCAGTCGTAGCTC
GTTTTTATTTGATCCGTATTCCAATAAGAGATTTGCATGTTATGATGGTCTACCTTCAAT
TGTGAACACTTCATATTTGTAGAACTATGTATGCTTGCTATAAAAAATAGTCATATCTTT
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GAGTCAAACTTGGAGGAGACTTACAACTCACTCATGTATGGACTTCCCATTGCTTATTTA
CTCTTTGCATTTCTTTTTCATTGCCATCGTTGTCTATCTCTCAGATTGCTTTGTGGACAC
GAAAAGTTAACTGAATTTTCTTGCATCGCATGCTTTAATATCCTGCATGATGTGCATAGC
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GCGCCTGTTTGTACAAAGAGCCTGTAGTATACATTCATAGGAGAAGGGATGAAGAGTTTT
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GCAAAGTGTTTATTACTATGGATATAAGCAATTCACGAATACCTGGAGGATGCTGAAAAG
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CAGAGACAGCGGCCTAACCAGGATTTTATTTAAACTAATTAACTATTTGGACCCACATGC
CAGTGTCACAAATTCAAATTAATTAACTTAATTAACTGATTGAGTTAATTAGTCGGTGGG
GAACCCACCTGCCCGTGTCTGTTTAAAATGATAGAGAAAATTTATCTAAGGGAAAATCTA
ATCAACGACGCCGCACTAGGCCGTTCCCGACTGCTTGCGTCGTGCATGCATTTTTTTCTT
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GTCGAAATGTTCTACCTCGTACTACCATCATCACATTATATTATTTTTCGAATTTTAAAA
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CAAGTTTTTTAGTGGTTTATATTGTTGTTCATCAAGCTAACAACCAAAATGATTTAATTT
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GTAAACTGTAAAACGGATCATCAAGTGAGATAACGGTTTGAGAGATAAATCTTTTTGAAA
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TAGCACTAATTAGGTGGCCTGACGTGGGGGACCCGCCAGACAACGACTCACCGGTGTTCA
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AATCATCTACATGGCACCATTTGGCGTGCGGCCGATCGAAATCGAACGAGAGGAGAGAAC
CGCATCGACCTGCGGTGGTGGCCGAGGCTGGGGGAGGGATTAGTCGTTGGTAATAAGCGG
AGCGAACGCGTGCATTCAGGTGTGGTCGGGATCGAAGCTAGGGGCTCGGGAGGGCACGTG
CGTGGGTGCACTAGCTTCCTACGAGCTCCAGGAGCTCAATGTCGTGCTCGGACACGGGCT
GCGGTGGTTGTGGCTGCGCCGACGGCGTGCACATGCGGCGACCAGCTTCGCCCCCGATGG
AATCGGGGGCCAGAGCTCGAAATCGAGGAGGGGAAGGAGGGGGAAGTGGTCAGGGGCTCA
CACCGGTCCCGTAGTTGATCATAGCAAGCTCGGGGAGGCCTGGCAGCGTCGAAATCGGTG
ACGAAGCGCAGCGGCGCCCGAGGAGGAAGAAGAGGCTGAGCCGGCGCTGGGCTCGCTCCG
GGCTTGCTCCCGTGGGCGAGGACGAAGCTATAGACGGGGCGGTGCTCCTGGAGCGGTCCT
AGAGCTCGGTGATGGCGACGGCCACGAGGGCGACGGTGGTCATGGCGACGGAGGCTCGGG
CGTGCAACAAATCGAGCGAAAGAGGGGCGAGGAGAGTGAAGGGGGTGTGCGACAGCCCGA
GACCGACGCTCTGAAGATTCCCCTTTTTATTTCGTTGCCGCTGTGCAATTAGATTGTCTA
TTGCATTCATCATCGCATTATGCGCATCATCCGCATTGCATTGACACTTCGTTGTTGCCA
GTTTTCAAAACTTGCATCCGTTATTAGCTACCGCACACGCGCCCGCGTCATCGATTTTTT
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ATTAGGCCGCCGCCGCCAACCGCAGCCCCAATCGGGAGCACCTCCCATGGCGCCAGAGGA
TCCCGAGCTCTTGTGGCCGCCTGCTGCGGCAACAAAAGTCCTT