Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_1557881 (6577 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1557881

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9823 5 3119 bp MLOC_9823.2 Available Available LOC_Os09g37920.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13109.m03769 protein helicase, putative, expressed
MLOC_9824 1 693 bp MLOC_9824.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_9823






CDS Structure of MLOC_9824






Contig Sequence (6577 bp)

>contig_1557881 6577 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AGGAACGGAGGGAGTAGTAAATATGGTAAATTTATGTATGGCACATACTTGCTAGCTGGA
ATTTGGCCGACTACAGGGCTTTCAGCCTTATGGATGTGCTCGACTGAACAGGCTTTTCAC
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GTGTTTGGTCTGAGAAGGATGGATGTGTATACAAGGCAGTAACATGCCCTTTCTGCTGTC
GTGAAAATTCTTTTGCCATGGTGCTTGGAGCGCAAGTTCTTGCAGCTGATGCTTCAAATC
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CCACACGATTCTAATTGCCCTCTCTTCAAACAAAGGTGCTGCTGTTTGCTGATCGTTTGG
ATTTCAAGAAGGAACGATCAAATGAACAGGTATGTGGTTTTCCTTTCCAGACCTATATCC
CTCAGACAGTTGCTCCTGTATCCTCTCTTCAAACGAAGGTGCTCCTGTATCCCTTCAGTC
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ACCCCCACCGGTGATCAATCTTGAGAGTTTTGCTTATAAACCAGTGAAGAAGGAACCCGT
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ACTTTGCTTATGCTCATTTTCCTATTATTCCAGATATGGTCATGTTCCACATAATTTTCA
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TTTGACGAACCAGGAAGAATTCGTCCCTTGAGAGTCAGCAGCGGGACGTATCATGCTGGA
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GGTTGATACGTTTTGTAAGTACACAGCCATATGGGCATTGGCTAACTTTCTTTTTATTTT
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CTCCATTCTATTCCTGAGAGATCACATGCATCATATACATTTCTTTTCTTCTATTGCCTA
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TGCAATTCCATTAAATTGGTTGTTGTAGCACTATTACTCACATAAGGATAATAGATATGC
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AAATATTGCCTTTAAAAGATCCCAGTGACCTTGCTATCCTTATCACAAGTGCCTCTCCAT
TCATACCACTCTATAGCAGTTTGAGATTCACAAAACAACAAGTATTTCTTATAATGATAG
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CAGTTATGCTTAAATGATGTGTCTCTATGTTTACAATGATTACTATCCTCGCTTGATTCA
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GAGAACTAGTATAGAGGGAGTATATGATTGCTTAAGAATTGGCTCCTGAAGGGTGATGCA
AACACCGCCTACTTCCAGGCCATAGCTAATGGCCGTAGGAGAAAATGCGTTATTCCTTTC
CTCTAGGATGGGGATGTGCTCCTGGAAAGCCCAGAGGACATCTCATCCCATATTTACTCC
TTCTATAAGGAGTTGTTCTCAGCTGAGCCGCGTGGAGGCGCCTCCCTGTGTGAGGACTTC
TGGCTGCCTGCTGACCAGGTGTCTGACGCGGAGAATGCAGAGCTTACTCTCCCGTTCTCC
CCGGAGGAGGTGGGGCAGGCGATCGCCTCTATGAAGG