Map Locations of contig_1557849 (5316 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_1557849

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9815 4 3387 bp MLOC_9815.3 Available Available LOC_Os09g29170.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13109.m02889 protein CAMK_CAMK_like.38 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed





CDS Structure of MLOC_9815






Contig Sequence (5316 bp)

>contig_1557849 5316 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGACGCCGCCACCGCCTCCGGCCGCGGCGGCGTGGTCATGACGGCGCCGCCGGCCAGCGG
CCGGGCCACCCCGGACAGCCCCGGGAGGGGGCTCAAGCGCAAGGTCGGCTGCATCGAGTC
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ATGTAGCTAATTTCTTTGTTTCTTCCGGTTCTATTGAGATCAGAGTTTTGCATAGACTTC
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CGGGGGGAGGGGAAGAGGCGGTGCTCCTGCCAAGTCGGAGAGCGTGCTAGACTTGCGACA
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AGACCTTGGGCCAACAACTTTGCGAGTAAAAGTGTGAAGTGTCAAATCCAACTTTAGGAG
GGGCAAGAGCAACACTCTGTGTAAATCTTCGATCTGATTGGGCGTTCAGAATTTCATTTG
GGTTTAAGAATAACTTTCAAATCAATTCATTGTCGAGAAAATAAAGGGCAATCACTAGAA
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TATGCCGTTCAACGGCCTAGTTAGAACAATTCGATTTGTATCCCCACACAACTTCGTGAG
AGAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGAGCACGGTTGACTATGAGCCGCTGCGTGCCACAACTAT
TCATTGACAAAAAATGCTGCCCCCGCTTGCTTGTGCCGTGCGCATTGCGCTACTCACAAT
ACAACTTCGCGCCCTTGCGATTGTAGCACCCCAACCAGCGTAGAGGCGACCTCGCAGTGC
ATCTTCGAGTCGACCAGAACATCGAATCCTTGCATCTCTCGTCAAAACATGGTTGCAGCT
TCACAAGCTCGTGTTTTGGACCATGATGATCCACAAGTATAGGGGATCAATTATAGTCCT
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GAAAGGTAATCTGTGCGAGCACTGAAAATGACAGTAAGGCCTCGTTTGACAGGGGGGATT
CAGGAGGTTTCGAGAGGAAAATCCCCAGGAGGGTTAGAAACCCCACAGAACCTCGGGCGC
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TCCCCAACCCACCTCTACCCAACAAAACCTAAACCC