| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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Predicted Genes from contig_1557849
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_9815 |
4 |
3387 bp |
MLOC_9815.3 |
Available |
Available |
LOC_Os09g29170.2, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13109.m02889 protein CAMK_CAMK_like.38 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed |
CDS Structure of MLOC_9815
Contig Sequence (5316 bp)
>contig_1557849 5316 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TGACGCCGCCACCGCCTCCGGCCGCGGCGGCGTGGTCATGACGGCGCCGCCGGCCAGCGG
CCGGGCCACCCCGGACAGCCCCGGGAGGGGGCTCAAGCGCAAGGTCGGCTGCATCGAGTC
CGCCACGCGGATAGGCCGCAAGAAGCGCCTCGAGACCGAGTACGAGCTCGGCGACGAGAT
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TGGATCGAGATGTCTCTTCTAGGATAACTGCTGATCAAGTTCTTTGTAAGTCAAGGCAAT
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CGGGGGGAGGGGAAGAGGCGGTGCTCCTGCCAAGTCGGAGAGCGTGCTAGACTTGCGACA
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CAACTATAAAATTGATTCGTTGTTGATAGAATATAGGACAATGCTAGGCATGGTCACACG
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AGAGAGGGAGGGAGGGAGGGAGAGCACGGTTGACTATGAGCCGCTGCGTGCCACAACTAT
TCATTGACAAAAAATGCTGCCCCCGCTTGCTTGTGCCGTGCGCATTGCGCTACTCACAAT
ACAACTTCGCGCCCTTGCGATTGTAGCACCCCAACCAGCGTAGAGGCGACCTCGCAGTGC
ATCTTCGAGTCGACCAGAACATCGAATCCTTGCATCTCTCGTCAAAACATGGTTGCAGCT
TCACAAGCTCGTGTTTTGGACCATGATGATCCACAAGTATAGGGGATCAATTATAGTCCT
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CAGGAGGTTTCGAGAGGAAAATCCCCAGGAGGGTTAGAAACCCCACAGAACCTCGGGCGC
CTATTTGGTAAGAGGGGTTTGCTTAGCCGAATCCCCTCTGTTCCCCTTCAATCCCTTTCT
ATCTATGTGTTTCAGGACCGTCCTCCACGGACTGGTGGAAGCAAATCCCCGAGGATTTGA
GAGGATTGGGTGGAAGAAAGGGATTCACCAAATCCCCTCAAATCCCCTCCTCTCCAAACC
TCCCCAACCCACCTCTACCCAACAAAACCTAAACCC