Map Locations of contig_1557802 (8637 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_1557802

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9793 4 4344 bp MLOC_9793.1 Available Available LOC_Os03g02110.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13103.m00159 protein WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_9793






Contig Sequence (8637 bp)

>contig_1557802 8637 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCGCGCCCCCTCCTCCTCGCCGGTACCTCCCCCTCCCCTCTCCCTGCCCTCCGGCGCG
CCGTACGCTCACCTCACCTATTACGCCGCGCGCTCTCGCAGGGACCGGGTCGGAGCTGCT
CGTCTACGACCTGGATGCCGCCAGGCTCGTCGCCTCCTTCCGGGTCTTCGACGGCGTGCG
CGTCCACGGCATCCAACCCCGCGTCCGTGCCCCCAATGGCCCCGCCGACGGGCTCACCGT
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GCTACTGAGTAAGATTTGACACCGCTCTCATCAATCGCTCACAAATATAGGGTGTAGGGT
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TAGGGTACTTTCTGTTGCAGCTCTTGCAGAAATGACACTCATGGATTGCTCACAAATATA
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ACAGTGGTTCTCCGTGCTCTTCTTTTGCCTTCTCGATTATGGTACGTAACATGAAATTTC
CGAGGCAGAGTTCCTATTTATCTGTACTAGTCTTGGTGGTTTCAGTTAGCTGTTCCTTTT
CTCTGTGTACAGGTTTGATGTTGCCTTGTTGGTCCCACAGGCATCACCAGTTCTTGTCCT
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TGTTCTGAAAATGTTGTTAAGCATAATGGAATTCACACATTTGCTTTCAGGTGTTGTTTA
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CCTAACAGACACCATTCATGGCTTTATGCAACTAGTATCAGAGACGAAACCGCACATGGT
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TGGCCAGCACACGGTTCCCTCCGCTCACGGATCAGCAGTGAAAGGTATGTCTGTCACTAT
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TGCTCCGGGAGTAGAGTTGTGGGGTGGAGGTTCTCCGAACAGGGCCTAAAGGTCCTCCTG
CCCGGGTGCCCCACAGTGGCCACGTGAAACTCCTTTAGTCTCGGTTCATAATGCAACTGA
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GTTGCATGTCCACCACTAGACATGCAATCACAAGCATTATAATCCGGCTTCAACTATATG
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GGTGCCACTCCTTTTTTTTTCTTATTTAGTCGTACCAACTATCACACCACACATGTAATT
AGCTCAGTGTCGCGACTACATACGTCTCAACATGCATGCAATTGCATGCCATACAGAGCA
TTTGCAACTATGTTTTCTTAGCATTTTCAATATAATTTTCAAAATAGGAAATGACAACAA
GAAGGAACAAAAAAAGCAAAAGAATATTAAAAAGAATTCTAGTCGCATGCAAAATTTACA
ACACTATACTTATCCATGGAGAAAAAACGAAGGACCTATACGAGCCCAATCGAGCTACGT
GTGTACACTAATTAATCAATAAATTAAAACTTTTTAAACTGGAAACGAGCTGAAGTTTGG
ATAAAAGGAAAAAAAATGAAATGATTCAACAACAGTCTTGAAAATTCTAAGGAAAAACGT
TCAACTGGCCCAACAACCACTCAAGTGGCCCAAGACCAGAAACGTACCCAAAAAAATACC
GTACACACTCAGCTGCCCAAGCCCATAAGAAAACTAAAAAAAAACTAACAACCAGCCCAT
TAGCATGCCAATGAAAACGGGCTACCACAACAAAAGGTGATGTCAGCTGATGTCATGTGA
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AATTATCCCTAAAGTTTGCATAAATTANNNNNCATGCCACCGGTAAGTAATAAAAAACGT
TTCATAAAGCAAAAAATCTTGGACTGGGCCAGCCCATGTAAAAACGTCCTATATTAC