Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_154620 (4129 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_154620

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9684 6 2404 bp AK369415 Not available Available None
MLOC_9682 1 132 bp None Available Available None
MLOC_9683 2 892 bp AK364811 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_9684






CDS Structure of MLOC_9682






CDS Structure of MLOC_9683






Contig Sequence (4129 bp)

>contig_154620 4129 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCGCGCCGGGCCTCTCGCTCTCCGCGACCGGTCGGCCTCCGACGGCCCTCCTCCGCCT
CGTCCCGCGCCACCCCGCCCCCCCCCTCGGCCCTCCCCCCCCCCCCCCCCCACGGACCCC
TCGCCGCCGCTGCCTACGCCGCTCGATTCCAGCGTGTTCCGGTGGACCTCGTCGGCGCAG
CGAACAGATCCGAGCTCCCGTGCCGCCGCTCTTCCCTGCCCCCCTGCCGTCCAGATCTGC
CTCTCTAGGCCCCTTTTTATTTGGTTCCTCAATCCTCATGATCGGCCGTGGTGGGGGTGT
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GCCAGGACTTCTGCGTCGCTACTCACGGCGGCGTGATCCCGTCCTGCATCCCCGCCGCGC
CGTGCTAGTACAGCATCTCATACGGAGACGGCAACTCCACCACTTGGTTCTTCGTCACGG
CCTTCTTGCAGTACAACCAGGTGTCCGGCAATAGCCAGACCACCTTGGCCAACACAAGCA
TTACGTTTGGGTACTCTCTCTGGGAAACACTTTTAACTCTATTTCCTCTGGCAGTCGGCT
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GAAAACGCAGTTAATTTAGTTGAAAGCTTGAAAACACATTCAATTTAGTGTAAACGAACC
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ATAGACATGTACTAAAATGAGTTGTTTTGCAGAGATTTATCTACCAGTGGACTGAAAGGT
GGATTGGTCATAGCCTTCATGAACATGGTATCATTGGAAAACCTGTAAGTGGTGCCTACC
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AATCCCTGATTCCATTCTTCAAAGATCTCGGGCCGGTATTCTTGACTTAAGGTTTGCAAG
CTCTGTTGCACAATTCCTTTTCTTTTAACTGAATGTTTCACAATTTCTTACTACAGAAAA
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GGACAATGGAGGCGTCTTCTAATCATAATTTTGTAGACCTGTTGTAGCTAACATCGTATT
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TATGCTCCAAAGTCAAAGATACGTACTGTTCAAACAAGAAGAAAAACAAATCTACCATGC
TCATCGCAGTGATAGTTCCTGTAGTACTAGTATCCCTCCTAGTAGTGATGTGCATACTCT
GGAAATTGTGCTGGAAAGGTAAAATGATTTTTTTTCACTCTTAAACTCTCTTTCATCAAT
GGATTAGGTGGTAGACATTAAACAGCAGCATCACCCAAAACTTTAATGTAACACACTACT
TTATGATTCTGCAGGGAAGTCAGCAGATAATGAGGATTATGCTATGTATGAAGAGGAAAC
GCCCCTACATATTGATATCAGACGGTTCACGTACGCAGACCTGAAACACATAACAAATGA
CTTCAAACAAATTGTTGGAAAAGGAGGTTTTGGTACTGTTTATCATGGCACAATGGAAAA
TGGTGATGAAGTAGCTGTTAAGGTGCTTATGGAGACATCAATAGCGGAGTCAACAGATTT
CCTCCCTGAGGTATACCACAAAACCAACTAGATCAAATCAATAATTTCTTCAATAGAAAG
TAAATTATAAGTGTGCAAGATATCAACCCTTTCCAGAGTCCATATCCAATTAAATGACAA
TTGACTTCAGCTCTAGGAAGATTGGTAACTATATCTGTTGCTGCAGGTG