Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_151325 (3489 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_151325

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9319 4 2422 bp MLOC_9319.1 Available Available LOC_Os05g01994.1, FRAME:+3, EVALUE:6e-21, 13105.m00149 protein rab5-interacting protein like, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_9319






Contig Sequence (3489 bp)

>contig_151325 3489 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTATGCTCGAGGAGGCAGTCCTCTACCTTAAGTTTTTGCAGCTACAGATCAAGGTAAGCC
CAAATGACATGGTTGCATTAGGCCTTTTATCCCCTAGGAACTCTGTGTGTGATCGTGATG
TGTCTTACAAGAAATTTGGTTCATAATTTCATGGTGATGAACTCTGCAATAGTTTGTTGC
TGCAATACCTAGTTTTCTGTAGATTGGGTCTTATTTAAAGTGAACATGATAATTCTACTG
TGTTATTATATCCTTGCACGATCGTACTAATATTAGAATTATGCTGACTGAATAATATTT
GGAGTAGAACATGAGTTACGATGTATTATTTGGTCCCTAAATTAATACAGAAGAAAGAAG
GACTTGAATTTATGCTAGTACTCCTACCAAAGTTTGTATTCCTGTTTTTGTTATCGTCCT
GGACCAGTCAGTGCCTGCTGAAGCTTACTGAATGTATCTCTTGTTCTGGACCAGTTTTGG
TTCCGTAAAGCAAAAAAAAGTATAGAGCAGCACACACTTGTTCCTTAGTCGTCACCACTC
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CTTCATAACGCAATGTGCATTTCATATGTGAAATGCATCCCTGTTAGTTGTGCAAATACT
GTTTACCTGAATAAGGCTAATCCCACTCCCTTTTGGCTATTTATTTTGCTCATGTACTGA
TTGATCATAAACTATATAATCTGATTCATATTTCTTCTACATATCTTATACCAAAATTAG
TTGGATCATTAATTCTGTTTTCTACCTGGTTGTAGTTTTCGTTCATTCTGTTATCTACCT
GATTCTAGTTTTCACATGAGTTGCAATGTCCGATTAGCATTTTTGTAGGACAACGTACTA
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TGTCGCTTTTTCATTTGATTGAGTGGCGGGTCTGTAGGACATTACTAGGATGGCCAAATC
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TGTTTTAGTATTTCGTTGGGTATTAATTCTCGAGAGGAATCCTGCATGCTTTGCTTTGAC
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TGGGAACTTTCACGATGATGGGTTCAGTGTGCAATTGTTTGAAAGATCTTTTCGAATCGT
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TCTGGTACAGGGTTTAACTGCTTTTGCATTTGTACATACGCGCGTAGAGCCGTAAATCCA
AGTGAACACGCTGTCTTTTATAGCCTTATTTCAGATTTTCAGGTTGTGGTTGTATGTCCT
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CTGTCCGCTCGAGCGGCTCAATGAGCTTAATTTGAGGGCAAAGAACACAGCTTAACATCT
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GCTTCATTTCACCAAGTAAAATAAAATCACATGAATGGCGATTCAAAGTAAGAGCGGCAA
CTTCTGGGACACCTACATTGCAAACATTAGTAAACAAACACAATTGCCACAATGGGATAA
GAACTGCTTTAGATATGAGTTGTACTTTTTCTTCGGTCCAGGAGAGTATATCTATCTGCT
CCCTTTAGCATGGGATAATTCTGGTGCAAAATTGTGTTGTGAGCAGTGATATTGCCTGAT
TGCTCATCTTTGTTGAACACCTGAGCATTTTCTATATTCGAACACTTAGAAATCATGGCT
TGACATTTCCCATAGGCAGTACTATGCCCGTTTGATTAAAGCGCTTGTCATACTAGATTA
TATTGTATTTTGGTATCAGCTATTCAGGACTATAATAACCCATATGACTTGTTACAAGTT
AGCCAGTGAATTTCTAAAATCCGCTTGTCGTATTAGGATAGCTTCAACACCCTTTCAATA
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CTATTGCAGATTCTTTACCATTTCCACCGTAATATTTCATTTGTACTATGCACATCTGCT
GAAGATTGATGAGGAAGACTTTGGAGGCCATGCCGCCCTAATTCAGGAGGGGCTCTTTGC
CTCGTTCACCCTTTTCCTGGTAAGCTATCGTCCATAATCATGTCTTCTCCATCACCACCT
CCTAGTTGCACCGATGTTGAACTCATTTCTACCACACATGCACATGTCTTACTAGTGATT
TCTTTTCACATGTTATCAGCTTGCCTCCTAACTAGCAACCGCTACAGGCACATAAAAGTA
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CATTTCATTCACTCTTTTGTACAATTAGCTATCATGGATGTAATTTCACAGTACTGTAGA
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ATAGTGTTG