Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_149019 (5238 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_149019

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9088 2 655 bp AK357584 Not available Available None
MLOC_9087 1 271 bp MLOC_9087.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_9088






CDS Structure of MLOC_9087






Contig Sequence (5238 bp)

>contig_149019 5238 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGAGGGAGGGAGTTCCACCGCGACCGCGAACCAGCAGGTGAGCCGGCGGCCATGGCACGC
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GTGCGAGATGCACGCTAGATCCGTCAGTGGTCCTCCTCTGCAGCTTCCCTTCCCTTTTAT
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GCTTATTTGAATTTTTAGGTTGCATTTACCGGGAGCTATGCAACCGGTCAAAAGATTATG
GTTGCTGCAGCTCCTACGGTCAAGGTTTGTTCCACATGTCTCTGTTTAAAAAAATCTTTG
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TGATACTTCAAACGCTCTCCTAATAGCAGATCATTCTCACCCTTTGTGTTGCATGTTTTC
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CGACATTGACAAAGGTACATGCTGCATGCTGAGACTTATCCAATTCAAAATGCCATGTGT
GGAATCACTTAATCGAGCATGGTGTTACCCACCCTAGTGCCTTTATTTGGTGTCTCGGGC
TTTTCATGATAAATGATTAATGAAGTAACCTGTAAAATGATTAAAAGAATGATGTCTATA
TTTCACCAGTATTAAATGACAAAAGACAACAACAGCTTTGGATTCAAAGAATGATGTCTA
TATTTCTTTAAAAGTACGCGCGAGTTTAATCGCTCTACTTCTATAGTTCAAGGCTCCTGC
TTGATTGAGATTTATAGCTCTTAATAATGTTTGTTGAATCACATTGCTCCTAAGATTTAT
TTTATTCTCCTCTCTGTGTAGCTGCCCCTGGTTCGATTCCTCCCAAGAGCGGATCTGCGC
CAAAGGGAAACTTTTCTT