Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_148784 (3592 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_148784

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9063 5 2431 bp MLOC_9063.2 Available Available LOC_Os01g40740.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-24, 13101.m04174 protein hypothetical protein





CDS Structure of MLOC_9063






Contig Sequence (3592 bp)

>contig_148784 3592 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATGAGTTCCTATTATTCAGTAACTGTCAGCGATTGGTCATCGTGCTCCTCGTGTATTTTG
TAAGCAGTGGTTTATTAGTGGTCTGTGTGTAGCCTATGCTGCTGATGATCGAGGAGGAGA
GATGCAGGTCAGCCGCTCATCTCTTAACTAGCATCAGTGATTCAAGGCCTAGGGGTGTTC
CCTCCTTGCTCTTTTCTTGGAGCACAGGGCCAAAGCGCTGTGTTCGGCAAACGCTTCGCA
CCGAGGCTCGCTTTTTTGAACTTTGGTCTGACCTGTCGTCTAGTGTTTGATGCTAAATAG
GAGAGATTGTTATTTATGCTATGGACAGTATAGAAAATCGTAAGGGTACAACATGGGTGT
GTGCATTAACCGATGCAGAGCCTGGGGCTCCTTCCTTTTTGGAAAAAATCATGGCATGAT
CTCTCCTCCGCCGTTGTTTATAATTGAAATTGACAATTTACAGCTAATATATGTAGTTAT
TGATACACTACTGAGCTAGGGCACTCTTTTCTGATGTCAAGGAGCACTTGTCGTGTTTGG
AACTAGTGGGCTATTTAGTCTGTTAGGTCTGCAAATCCTAGTAGAGGGTGCAAGCTCTGT
CATTTCTGTAAATTTATGATCAGATGTATTTGGTGGGACCTGTGTTGTCCATCTCACCTA
TAATCTAATGTTTCATGATACATAAAAAGGATATAGTTACTTATGGTGGTGTTGACAGTA
TAGGATGTGTGCATAAGTCAATGCAGAGGATAGGGCTCCCTCCTTTTCGGGGGAAACATG
TCATAATCTAATTCAACCTAGCATTTGATCCAATGGCCTATGAAGCTTGGATTTGCCACT
TATCCATCGTTGGATATAAGAAAATTGGTGGCTGGTATTTGAAGTTATTGTTACGCTACT
GGTAAATAATATGGAAAACATTAAATACTCAAGTATCCTTACATATTTTAGCTTTGTTTA
ATGCTGAAAAAGTCAAGAGTTTTTCTCTTTCAATGCTTTACAACAATATATAGCATTATA
GCTTGATATTGGCAAGAATGACCTCACATGCTAGGCTCCATGCTGCTTCTCTCTTACCAC
TTTTTTGTGTTCATGCTTCTTTTTCTCTACCTTTGAGTGAGGTATTTAGTTTGTAAGTAG
TAGCCCCTTTCTTAACCACTCTCAATATTTCTCTTGGGTGTTGATGCTTTCCGAAATCCT
TAATGCAATCTTCTGTGAACACAGGCCCAAAGACACTAACCTGGAGTTGTGTGGCCGAGG
TGAGCAGGGTCGTTACGCAAGGCGGTGGCCTGCGGGAAGGGGAACTGCACGGTGACGACG
GGGCTGCCGGGGTACAGGTGCGACTGCGAGCCCGGGTGGACTCAGATGCACGTCGGCTAC
AGCCTCAGGTTCATGCCCTACGTCATCCCCAACTGTAAGTGTGCCCTTTCTCCTTCGTCA
TTAATGGGCGGGCAGATAGGCCCAGATAGGCCGGAACTACCACATCTCTTGCAAGGAGGA
GGACCATGATCTGCTGGAGGAGACGGAGGTAGCCCAATTCGATCCCCATGTCGAGCCGGC
GATCGTGGTCATTGGTTCGTATACTACTTTAATTCTCTCCATCGGGAAGGTTTCGGTTGG
ATTTGGTTTCACTTGTTCAATTACTGTCTTTGTATGTATGCAACTGCACATATTCAGATC
CTGGTCAGATTACCTGGCGCGCCTTGGACCTCAAGTTCCCACAGGAGGAGACCGAATCAG
ACTGGAGCGACTGGAGCGACGGTGATGCCCAAGTGCTTGACGTGGAGGACAAAGATTGCA
CAGGTGCCTATTCGTCCCTCTAGATTAAATTTCCCCCCAAATGTCAAACCATGAATTACT
TAACCTCCTGGGATTCTACACTCGTTATTCAGTAGTTGATGGCGGTGATGATGACGAGGA
GTGCAATGGCCAAGTGCTTGACGAGGACAAGAATACAAACAGCAAGATAATCTGCCCAGG
TATCTAATTCTATATTCAGTCGAAAACAAAAGAAACTCGTAATTATCCATGATACATTAA
ATACAACGATTCTCCCTCCACTCTAGGAAAGCTCTATCCCGCGAGCAAAGCAAAGGAAAT
TGACCGGGAATGGATTCATAGGCACGCCGATCAGATGGGAGAATACTGGGACATGTGTGA
TGACATTCTGGACCGGGAGGACGACGATGATACCCCCTTACCTCCTTTTCCTCTGAAATT
GCTCCCTCCCACAACAGCTCTATGCGCTCTTGATGCAAAATGCTACCACCGCGTTTACAA
GACCCACGACACTTCTACCAGTAAGCGCACGCCGCTCCATCGTCCCTAGCAAATCTATTC
TTGTGCCATGTGTTCAATTAACAACTCACTTTGGTTATTGTTCCTAATGTTTATATATTT
GCAGCTCCATCAATTCTGGGATATCGCGAGCCACAAGAGATGCTACAGTTCTTTTCTATG
AGGTTATCAAGCTCTGCGCTCTCCTATCCTGTTAGTGTGTATGGAATATTTGCCGTTCAG
GATGACTTGGACCAGCGACGCAACTATGTCTTTAACTATCCTAGAGATGTTGCTGTAGAG
ATTGTGAAGCAGGTAAATAAGCCATTTGTTTACAAAATGGTTGGCTGCTGACCAATGATG
TGATATTTATGTTTACTTTAAATCACTGTCAGCCATCTAACTTGGTTTGTTTTGGATCAG
TCTATTATTTGCTTGTGTCCATTAAAAGATCTGTGAAATCAGCTCCATTTAGTTTTTCAT
TTTCAAGGGCGTGTGTTGTTAAAAGCAATTTTGTTGATTCCATCAACTGATTATACCTTA
GGTATTTATATGATTGCACTTCTACATGTACATACAAATCGTCATCTTCTTAACGTACTT
TCAATTATAGCATGTTACATATTTCCTTTCACAAGGCATTAAGATGATTATTATAACTTC
AACCAGCAAGATACTAGGGGCCTGCGGGTAGATAGATGACCGTGAGGTACCAATTCTTAA
AACCTTTGGAAATGATGAGAATCTTTAAGGTGCTGTGAGATTAATGGGGACATTCAAGTC
ACATGCCTGTCTTCGTTCACCCAATATTTGATCTAGACCGTGAGGTACCTATTCTCAAAA
CTTTTGGGCATGAAATTGGGGTTATGATATACGTGAATTTTAAGGTGTTGCGAGATGAAC
GGGGGTGCAAAGTTGCAATGTGACATTAAAGTTTCATGCTTGCCTTCTTTCGCCCAACAT
TTTGATCTAGATGAGCATGCATGTCTTGTTTGAGTTTGTTTATGTTGATACAATGCTAAT
GTATGTATTTGATAGTGGATCTAGTATACATAAAGTTGGAGGCTCATCGTGTTTGACTAG
TTTTTCCTTTGCATTANNAATTTATCAATATGTGCAGACGCTGGTCAAACAAAACACTGG
GCAAACAAAAAGTGATGAGCAACAAGGCTTGGCCGATGATGTTAGTGTGGAGTCTGCTCC
AACAACTGGACCGATTAAGCACACCAATGAAGATGACACGAAGGCTCCTTACTCGGTACG
GTCCAACATTTTCATACATGCCTGCCCATGAAATAAGTGAAACAAGGTGCAT