Map Locations of contig_148670 (3414 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map locationNo map location




Predicted Genes from contig_148670

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_9046 1 2856 bp MLOC_9046.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_9046






Contig Sequence (3414 bp)

>contig_148670 3414 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CACCTAAATCCATTGAAAAATCTCGTAATCCATCATGCAATTTGTTCAAGATCACAATCG
CCTAACTAAATCCAAATTGTTCCATGTTTACTAAAGAAGTTGCTACTTTCTTGGAGACTG
AGGTTTCTTCTATCTCTAATGGCTTCTTTATTTCCTAAGAGAAGTATATCTAGGATCTTC
TTACTCATAATGCTTTGATAAGCACACTGTTGAGACTCCTATGGAACTCATCATCCACTT
TTGTGTCCACCTCCACTCCTTGTAAATTCGGATGTGTATCCGTTGCCTGGTGGCGGGTTA
CTATGTGTGATGTCTTGATCCCACATCCCGTGTTCCCATGCTGGTCGACACCGTAACCGC
ACGCTCAAGCACCACCAATGGCGAGCAAGAACTTGGACAATTGACGCATACCTGGATTTT
ACACACGGGACGCGCCCGAGAACACGGCGCTACCTATCGTCAAGGTCAAGGGCGACAGTA
GGAGAACGTGGGGTGCTTAATCAAGTGCGTGACACAAAACCGCGAACATGACAAGGAAAT
CATGCCGGATAAACATGAAACAAAGAATGCACATGAACGTGGGATGCTGGATAAAGTCCA
TCTGCTGCCACTATCCCAGTGTCTCCGCCTATCTTGCCTTGTTTATCAGCTATTTTCAAT
AGTGGCATCATCGCCTTGAGTCACTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAATATAATAA
TCAACATGCTCATCTACTAAACCTAGAATCACATAATCCACCGGTCATCTTTTACTAGCT
CGTCAAAATCATAATCACCTAACTAAATCCAACCAAAACCTTATAATCCACCGTAAAATT
AGGTTAAAAGATCACAATCACCAAACTAAATCCAAATTGTTCCAAACTAAATCAAATATC
TTTTTATCCATTAATATAATAATCATCAGGCTCATTTATTAGACCTAAAATCTCGTAATC
CACCAAACATATTTGATTATCTTCATAGGACACAATCACCTAACTAAATGCAACTAAAAT
CTCATAAATCAAAGAGAAATTTGGTTAAAGATCACAGTCACCTAAGTAAATCCAAATTGT
TTCAAACTAAATTAAATATCTATTTATGCACCAATAATCACCATTCTCATCTACTAAACC
TAAAATCTCATAATCCAACAACCATCATTGGCTATATTTTCAAGACACAATCACCTAACT
AAATCCACCTAATCTCATGGTCCTTTGTGAAATTTGGTTCAGTGTCACAACCACCTTATT
AAATCCAAATTGGTCCAGATTAATTAATCCACCAAACATCATTAATTATCTTCTCAAGAT
CACAATCAAATAACTAAAGCCATCAAAAATCTCGTAATCCACCATAAAATTTTGTTCAAG
ATCACAATCGCCTAACTAAATCCAATTTTTTCCAAGTTTATTAGAAGAATATTTATTTAT
CAATATAATAACCAACATGCTCACCTACTAAACCTAAATTCACATAATTCACCAAACATC
TTTTACTAGCTCGTCAAGATCACGACCACCTAACTAGAACTAAATTCTTTCAAACTAAAT
TAAGAATCTGTTTATCTATCAATGTAATAATCACCATGCCCATTTATCATACCTAGAAAT
CTCATAATACACCAAACATGTTTTACTATCTACTCAAGATTAAATCACCTAACCAAATCC
GCCTAAAATCTCATAAATCACCGAAAATTTTGGTTCAATATAACAATCACCAAACTAAAT
CCAAATTATTCAAGATTAATTAATCCACCGAATCGTCAAGATCGCAATTGACTAATCAAA
TCCATCCATAACCTCGTAATCCACCATGAAATTTGGTTCAAGATCGTAACTAAATTCAAA
TTGCTTCAAGTTTATTAGAGATCCACTTATCTACCAATATATTAATCATCATGCTTGCTT
ACTAGACATATTAATCCATCGAACATCTCTGAATATCTTATCAAGATCACAATCACCTAA
GTAAATCCAGCAAAAACCTCATAATCCATCCTAAATTTACGTTAAAGATCACAACACCTA
ACTAAATCTAAATTGATCCGAACTAAATTAAATATCTGATTATCTACCAATATAATAATC
ACCATGCCCATTTCCATACCTAAAATCTCATAATCCACCAACATTTTGACTTTCTCAAGA
CACAATCACCTAACTAAATTCACCTAAAATCAAATAAATCACCGAAAATTTTGGTTGAAT
ATCACAATCACCGAACTAATTCCAAATTGTTCAAGATTAACTAATCCACCGAACATCTTT
GACTATTCCCTCAAGATCTCAATCAACTACTTAGATTTGTTTAAAATCTCGTACTTCACC
ATGAAATTTGATTAAAGATCACAATCGCCTAACTAAATCCAAATTACGCCAAGTTTACTG
AAAATCCATTTATCCATCAATATAATAACGACCATGCTCACTTATTAGACATAAATTCTC
ACATAATCCACCGAACATCTTTGACTATCTCGGCAAGATCATAGTCACCTAAATAAATCC
ACTTTGAATTTGGTTAAAACTTCACAGTCCCCTAACCAAATTCAAATTGTTTCAAACTAA
ATGAAAGGTCAGTTTATCCACCAATATAATAGTCACCATGCTCATGTACTAGGCCTAAAA
TCTTAAAATCCACCAAACATCTTTGGCCATCTTCTCAAGATCATAATAACTTATCTATAT
CCACATAAATCATCATGAAAATCGATTCAATATTGCAATAGCCTAACTAAATTCAAATTG
TTCAAGATTAATTAATCCATCGAATATCTTTGAGTATCTTCTCAAGATGAAAATAACTAA
CTAAATTCATCTAAAATCTCATATTCGATCATGAAATTTGGTTCAAGATCACAACCGCCT
TAACTAAATCCAAATTTTATTAAGTTTATTACAGAAGTACTTATTCACCAATATAATAAC
CACCAAGCTCACCTACTAGACCCAAATTCACACAATCCACCAAACATCTTTTACTAACTC
GTCAAGATCACAATCACCTAACTAAATCCAACCAAAACCTTATAATCCATCGTGAAATTT
GATTTGAGATTGCAATCATCAAACTAAATCCAAAATGTTTAAAAAAAAATTAAAGATATA
TTTATCCACCAATATAATAATCACCATGCTCATCTATCATACCTAAAATCTCATAATACT
TGTCAAGGCATTATCGTACATATCCTTGATGAGGGTAATGTATTTTGCTGGAACTTTGTG
TTTCTCCAAGGCCCACCACATGACATTACACGGTATTTTATCATGGGCCTTCTTTAAGTC
AATGAACACCACATGCAAGTCCTTCTTTTGCTCCCTATATCTCTCCATAAGTTGTCGTAC
CANNNAAATGGCTTCCATGGTCGACCTCCCATGCATGAAACCAAACTGATTTTT