Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_147001 (5247 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_147001

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_8867 1 1145 bp MLOC_8867.1 Available Available None
MLOC_8865 1 820 bp None Available Available None
MLOC_8866 1 708 bp None Not available Available None





CDS Structure of MLOC_8867






CDS Structure of MLOC_8865






CDS Structure of MLOC_8866






Contig Sequence (5247 bp)

>contig_147001 5247 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAAAAGTCCCTTTGACAACATTGTTTGTAATTCGAAGATGCAAGCTTGTCTACTCCAAAA
GATCATATTTGGATTTTATCATGTGAAAAAGTAAAAGCAAAACAATAGGGAAAATACAAT
GGCATATGCTTTTTTCTGATTGGTGGAATTGATTGTCATAGAAAAAAAATGAAAACTCCA
TTTAGCAACATTGTTTGCCATTCCAATATGTACACTTATGCAAAATGTGAGATCATTTGT
ACAAACTTTACCATGAATTTTGTCATAACATTCATTATTTGCCTTATAAGAGAAAAAACT
AAAAAACTCAGTTCTGGTGGGATCACTTGTGGCTCGTGGTGACATGGCAAACATCAATCC
ATCCATCCGTCCATCCCCTTCTCGATCCAACCCACCGCACATCAATCTCTCTGTATCTCG
CAGGAACCCTAGAGCTTCGCTCCTCCCTTACGGCCGCCACCACTCTCGAACCCACCCAAC
ACGAACTCCTCTCCCTCGCCGTCGCCCACACCGCCGCCACCCACGCCGCCCGTTTTCCGT
GAGCTCCAGCCGGACGCAGCACACCGGCGAGATTCCCTTCGTCCGCGCCTCCCTTACCTC
CGTGCAGATCCACGACTCAGCTCACCTCATCTTCTCTTCCTTCTCTGCAGGTTGTCATGG
GCGTGCCAGCAACGACGGCAGGAGGGGCACACCTCCGTGGGACGGGACGCCGCCATGGAT
ATGTAGTCCCTTTTCCCCCCACCATGCAGCGGCCCCATGGAGCCTCCTAGCACCCCAAAC
CCTAGCGGAGAGAGAGGAAGGGCAAGGAGATGGGCGGTCAAAGCAGGACCCGGTCACCCA
CCCGTCTCGCAGACGGACCCAAGCAAGCAGGGAGCGACTGGAGCAAGCCCGGCCGTCTCG
TCGACGCGGACCGGAGCTGGCCGGCGAAGGTGAGGCCCTTTCCCCCGCTCCGGCCTCTCC
GCCCGCGCTCCTATTGCCGCCTGGGTTCGTATTTCCTCGGGCCTCACGGCGTCGGCGGGG
GTTGAATTACCAATATGAGAGATTTTCATACCATATCCGCTAGATGTATGTGTTCCTTGC
CTTGGTAGGTTTCCCGGATGTTGAGCCTCTCTAGATCCCTAGTGATATGGTCTGTGGCTC
CTGAATCCACATGCACCCTGGCCTCCGTGATTTCCACGTACACCCTTGTATTGCAATACT
TGTATGCTGAATGACCAACCTTCCCGCAGTTTGGCAAGTTGGCCTGTTGCTTGGTGCATT
CCTACGTACACCGTGGCCTCCGTGATTTCCTCCGTTACGACCATTAGTCAGTTGATTCGG
TGTAGAAATTCAACCCTATTTGTGCATCCAGAAATTTGTTTTTAGTCAGTTGATTCGGTG
TAGAAATGCGCTGATGCAGTGGATCGGGTGAGGATTGTTTGTGTAATTCTCTTCACCCAC
GTATTTTCTGTGGCCCTCGAATTTGCTCACGACTCTGAGGTAGTGAGATGTTGTCTGACT
GGGCTGGTAGCTCCCAGCTTTTTCTCACCACAGAATATATGTAGTGCCTCTCCCTTTCAC
AAGGCCAGTTATAAATTTATATCTGGCACAGGGGAAGCAGGAACAGCTTAGAATCTGATC
GGTTATGTGTGAAGGAGTACTGCCAGATTTATCACCAAAAAAAAAAAACAGAGACGTCTT
CAAAATAATAATGTACTAATCAGAGGGAGTACAAAAATTGTTCAACCCCTCGCAATATGA
ATTAAGCTCCACATTCACACCACAAAGGCACAAACTGGTGTCGTAATAGTCATGCAGCTG
GGTCGTATTTGGCTGACTACTGTTATCTCTTATCTGTATAACCAATCACTAAATATCTAC
AGCATGTTCTTGGTCAATAGATTCTGATGGGTGCTTTATATAATGGAGTTAGGAAGATAA
CTAGTGTATATTACAAAATAAACTTATGCTTCTACTGTTACAATTATTTTCTGCAGGTTT
TGTGAAATACTCCAGCTAAGATGAAATACTCCAGCTAAGATAATGTTCATAATTAGATCT
TTGCACCACTAGTTCAGCTGCAAGCCTACAACTGAGAGATCATTATCTGTTATGCTATTG
TTGTACAATACGCACACACGGTGTTTCCATATGTGAGATTTTTTTTACTGAAGAGTATTC
TTGATGCAGGGTGACAGTACGGGGCCGCCCTGAAGAATAAGATGTTCTCTGCATGTCGCC
TGCCTGCGCATCGCCACCCCCGTCGACTAGCTCCACCGCATCGCCGCGTGCGCCCCGCAA
CCTTTGCCCCTGCCGGCGCTCCCTCCGGCAGCGAGGAGCTCGACCTCTTCATGGTGAGCT
ACTAGGAACAGTTTCTGGTGACCATGGGTGGGGTAAACAGAGAAGGCAGAGTNGTAAGTG
CACAGTTTTACAATGGCAACCAGACTATTATGTACTTACCATTGATGTATGTGCTAACAG
CAGGGGGTTTGTACTGTATTTTGACTAATATATGCATTTTTCTTCAGTACATTATATCAT
CTTTTTTGGGGTAATTAGTGCAACCTACCATGGTTATTGTTTGAAGTTGAGCAATGTGTT
ACTAATTACTAAATAATTTCAAAAGAAATTGACAAAACAACAAATATACAGGGTNNNCAA
CACGTTCTATAACTGTAGAAAGATGTGTCAGTCAATGTGAAATTCAGGACATGATTTCAG
CTTGTAGCAGCAGTCTTATTGTAGCAGAATTTATTTATCTGTGAAAGCACGTTCATCACA
TGTTATTTAACCAGGACCTGCACTTGTGCCATGCCTCTCTCACTTTTGTTTGCATTTCTT
CTAGAGTACATAAATGTTTGATCTAGATAAACTAAATACTTGTTATGGCGCACAACTTCC
TCTCACAAAAAAAACTAAATAATCTGTAGCACGTTTGTTTGCTTTCTTATTTGAGAAATC
TCATATTTGTTTGCTTGGCCGGAAAATTGTTTGCTTTCTACTTTGAGAAATCTCATGTTT
GTTTTCTAAGCCAGAAAATAGCAACTCCTAGCCTGGTTAGCCCCATGCACTTACTGTTTT
TCGTTCTATAACCAATGGACAAACCAACTGCTGCTCCTATTGCACTTTCAGTTCTGTGAT
GTGTGTTTGTTACTTGTCACTTGTAGGCTAACTTGATAACACACTTTTCTGTTGGTTCGG
GCCACTTATGATTCCATTGAATGTTGAATTGTATTTGAAGCTTTTCATATTTGAACCTCT
ACTTTTATCATGCTTCACTCACTGCTGGCTTACCATTTCTTCGGAACAAATAGGAACTGG
ACATTGTGATTGTGAAGGCAACCAACCATAGCGAGCATCCATCGAGGGAGAAGTACATAA
GAGGTAATGGTTTATCATGTCTCTTAGTTGAACCACTACGACGGCTGAGTGTTTCATCAC
TATTGCACAATTTTAAATAGCGGATAGCGGGCNNNCTATGGATTTGGGTCGGTATAGCGG
ATTGCAAATTGCGGACGCTATTGCGGGCGCTATATCCTCACAATATACTTATAAAAATGA
GCAAGATATTAAGCCTGTTTTGTATATTTTTATAGAGTTGTCAATAAAAAATGTATTTTT
AACTTTGCAATTTATTTGTATAAGCTCTTTGTGAGAGTCTCCCTAAGTTACATGCACATA
AGATCTTTGTGTGGTCAAAGCTGTTGACTACAATGTACTAAAAATGACTACAATCTACTA
AAAACACTTATGAAACAATTGTGTCCATGTGTATCCAGCCCCATACCTCGATATTTTAAT
CAAAGAACTTCTCTATCCAGAAGCACCATGTTAAATTAATCAACTTGTAATGAGATAAGA
CTTCTCTTCTAGCAACTGTCTTGGCTCTACCTGCAAAAAAATTGTTTTGGTTCTGCACTT
TCCATCGTGTACCAGAGTAGAAGCACTTCAGGCTAGCAGTAGAACCAAGGAGAGAGAGAG
GTGGGTCGTACAGGAGCTGGACGGTAGTGCATGCGTGACACACATGCTTGTGGTGGTGTT
TAGGGTTCTGGTGTGTAGCCTTGTTAGGATTTGTACAGTATATGTTCATCGATTCAAACT
GTTGCTCGAATGTTAGTTTCCATATCCGCCTTGCCATTTTGCATGAGTTGTTCAACTATT
CCTCTTTTGTTAATTCTTATCCTGAGATCCATTGCCTTGCACCGCACTAATGTTTCATCC
TTGCACCGCACTAATGTTTGAATGAATTATGAATTGCAGGAGAAGGCTTCCNACTTTACC
AATGCTGAGAAGCTCAAGGTCGGGTACATGACGCCTACATCTGAAGTCTTTGGAACTTCA
CCGTTGCCACGAACTGCTAGTGTAATTGATTGATGATGGATGGTTGTTGTTGTTGGTAGA
AATGATAGAAAGCCTTTTAGGTAGCTGCTGTTGCTGGTAGAAATGGTAGCTCTAGTCCCA
TGTAGTGTAGTTCACGTGCTTGGGCTGCCCTACGTTGTTTCATTTTTATGTTAAATAAGT
CTGTCAAATGTACCTATTGTCGTGTCGTGGCTTGTTTGAATTCCCTCTTTGTTTCACTTT
GTTGCTGGAATAATCATAAGTTTATGAATATTTGTTCTTGAGAACCAAAATAGAAATCGA
CTTAAAAAAGGCTGAGGCCCAAAAGAGAACCGGATTGTAGAAGGCCACGTCCTAGAAAAA
ATAATAAAATTGTCAACTTCTTGAGCTTGGCCCATGTAGGAGATGCAAAGTGATAGGAAA
TATATATTAAATGGGTTTGGCCCATCTAAAACACTGAACTGGTCCGGGCTGATTCTAATC
TACGACCAATTCATTTGGTTAAAATTTTGCCACGTTAGCTTGACAAGTTGGATCTAATGT
GGCTTGGGCAAACAACCAACGACCAAAATAATGGCCGTAAAATCCTACGACCAATCCAGA
AAAAAGGTTGTTATAGTTCATTAAAGACCCTCAACTTTTGATCGTCTTTTTTTGGTCGTA
AAAAAGTCGTAAATGGAAATCAATGACCATTCGGTGAACAATATTGAAGATCGTTAGTTG
ACATATTTCTTGTAGTGAGAGGAGGAGGAACCGGATGAACATCAGTTTCATCGCGATGAT
GCTCATCGTGACTGCAATCCTCTTCTATGTGTTTGTAGTTTAGATATCGACTTGTAACGT
GAAGACAAACTCGCTACTCGCGGTCTCGAGATCTGTAATGTTCTAACTTTGTTCGTTATT
TTGAATTCGGAGACTAATATGATGAAT