Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_141923 (3043 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map locationNo map location




Predicted Genes from contig_141923

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_8300 1 251 bp None Available Available None
MLOC_8299 1 672 bp MLOC_8299.1 Available Available LOC_Os10g20600.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-11, 13110.m01693 protein zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_8300






CDS Structure of MLOC_8299






Contig Sequence (3043 bp)

>contig_141923 3043 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATGACCTCTGGATTTGGCACTCCTTCTTTGATATGCCAAGAACTCACAATGACATCAACG
TACTGCAGTGCTCGAATGTCTTTGCCAAGCTTGTTGAAGGTCATACTCCTCCGGTTAACT
ACCAGGTCAATGAGCACTACCACAATAAGGGATACTATCTAGCATATGGCATCTATCCGA
GATGGTCCACCTTTGTGAAGACTATCTCAAATCCTGCACCAGGAGACAAGGACTCCTAAT
TTGCCAAGCGCCAAGAAGCTTGCAGGAAGGATGTCGAGCGAGCATTTGGTGTGCTTCAAT
CTCGTTTTGCTGTTGTCCGATACCCCGCTCACACCTAGTCGAAAGATCAAATGTGGGAAG
TCATGGCTCGCTATGTCGTCTTGCACAACATGATCACTGAGAGGGAGCAGGAGGAGCCAA
TGTTTGACACCGAACCATATTATAGGCACGGTCCTCTTACCCAAGTTGATCACCAACTAA
CGACAACCTCGACTGCCTTTCTCAACATGCGTGAGGAGACCCGAGATCCACAGGTGCATC
AACAACTGAAGGACGATTTGGTGGAGCACCTATGGAGGCTCAAGGGCAACGCCTAACTCG
ATGTGTGATGAATTATGAGTTTTTATTTGCTGAACTATTTTGATTTGTATTGATTTATTG
AACTATTTTTAATTTGTATTGATTTCTGTAATAAACTATCCGATTTTTTTTTATTATTGT
TCATTTTGCGTCGAAGCATGTTAAATATTGACAAAATTGAGTCAATTTGCGTCGAAAATG
GATCGGAATCGGTGGCTTGGGGCGACCTTGGGGATGGCTGGGAACCTGAACACCCTACGT
CAATTTTTCTGCCAATGCATCCACAACCGACCGTATTTTACGCCCGTGGAGCCGAACGGT
TGGAGATGCTCTTACCCGGAGAATCTCACGACTCACCCCAAAAATTGTGTCTCTTTTTTT
AAAGACTCGAAAGCTTTGGTTACGCGATTGATACCAGTTTTGCTGGACAGAGATCAGGTG
ACATGCACGTTTGCATGTCACCGTGTGTCTTGCGGCCTAAATTTAAATTTAAACATTGCA
AAAAAATCTGAAAAAAAATCATGCATGTTCACAGCACATATTAAGATAACCCTTAAAAAA
TTCAAATCAAAATTCGAAACATATATCGAGAAAAAAAAAAACTCAGTGAATAGTCTACAC
AGAACCTAAAAATTCGAAACATGCATGTCACGTGATCTCTGTTCAGTTTTGCTATAAAAA
CGCGATTACTACCGACTCATCCAAAAATTGTGTTTTTTTTAAAGACCCAAAAGCTTACTA
CCGGTTTTGCTATAAAAAAAACGCGATCACTACCGGTTTTGCTATAAAAAAAACGCGATT
ACTACCGGTTAACATTTCTAGCCTTCTAGGCAACCCCACGAAACTTCGTTCCATCTGTGC
GAGATCTGCCGTGCTTCTCCTCTTGCTCCCCGTACCGACTCCCGATTCTTTTCTCTGATT
CCTCGGCGATGGTCGTCTGCAAATGCCGCAAGGTTACTTCTTGATAATTTCTCCACCTAT
CCGGCGATGCCCCTGCGATGTGATGCGTGTTCTTTCTGTTGCGCGTCGACATGTGAGGGG
GGATTTTGGATCTGGGCAGGGGAAGTACGCGGTGGCGGATTTGGCGTTCGCATGGTCTGG
ATCTGAGAGGGCACTGCGAGCGTGGATTCGAAATTTTAGTTTGGGGTTCTTGGATTTATT
GTTGGCGTGTTGAGATTTGTCAGTGCTGCGTGAATTTTGTGTTGACAGGGCGTTTGTGCT
TGCTTTGGATTTTCAGGCAACGAGGGTTTATTGCTTCGTCCACCAGGTTCCGGTCTGCGG
CGAGTGTATCTGCTCCCCAGAGCATCAATTATGCGTGGTCAGTTTTTCGATACTGTCTCC
TCAAATTCAATCAGCTCAGACAAAGAGCATAACCACACAAGATAGAGAATAGCACTAGCT
AATATGTGATTGCTCAACGTGCTCCATCCTGTGTAGTGTTTATAGTCTATCACAAGTTTG
CCTGTCATGTTAGCTGCTGTATATTGGCATTAAGCTTGCTGGACAAGAGTGCTCATTCAA
ATATATGGTATGGCATATGCTTTGAAATGTGCAAGTAATCTAGGTTTGTAATGTGAGACG
TACTTGTTACAGTGTGATAGAAGAGGGTGTAAAACTTAGGGTTTTGGGAAACTGCACGAC
ACCCCAATACGGGTGTGGCTCTTTGTCTATACTACAATATAGTGTAAGAGTTTTGAATAG
GAGCTGGCCATCGATCCTAACCATTTATATCCTAAATCCAACGGCTGAAAGAAGTGGGAT
TCGTGGTGAACAGTGCATGGTTGCTGCATCCACCATGTTCTAGAATGAACGCCTAATCCT
TCTCAAGAGATGTGGCCCATACTGATTCCTTTTGGGCTAGACATGTTGTAACTTCAGGTT
AGCAACGAGGTTAGCCCCCAAAAATTGATTTTAGGGGAGAAAAACAAAGTAAAATAAAAT
TTCATTTTTAAATTTCTTTTATTTTTAAACATTTTTTTGCGGGATTCTTTGTTAACAATT
TCTGGGGACTGCATATATTAATTCCGAATTTTTTGTAATATAATTTATTTCTTCATCCAA
AAATGAAGATTTTTTTTGCTTCAAATTTATTAGCAACTATTTGTTTTCCTACCAAAAATG
ACCCCGTAATGTTAAAACGTGCATTGCACGTGCATACATACTAGTATAGCAAATTTATAT
CATTTTCTGGGACTAACCTATTGACATAGTGCGCAGTGCGAGTTGTTGTTTTTTGCTTCA
CATAAAATCAATATCAGATGAAGTCCAAATGCCTCAAAACTTGTTGGTGAATTTTTTGGA
CCAGAAGGAAACTTGAGCACCAAGGATGCTCACCAGGGGAGGCCCAGGCAGCCTACTAGG
CACCAGGGCGCGCCCTGGTGGGTAGTTGGGGCCTCGAGTACCTCCTCCACCGCCTGTGAG
CTCTATAAATAATTAAGTACCCCAATATTCCAGAAAACCTAGA